55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3405 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  100 
 
 
82 aa  164  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1633  phosphopantetheine-binding  65.43 
 
 
82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0617964 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  30.77 
 
 
93 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  29.49 
 
 
544 aa  53.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  33.33 
 
 
2762 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  29.85 
 
 
2103 aa  51.2  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  28.57 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  28.57 
 
 
89 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  28.57 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6478  beta-ketoacyl synthase  35 
 
 
1474 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.651287  normal  0.801281 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  35.9 
 
 
1823 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  35.21 
 
 
2333 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  33.33 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1906  phosphopantetheine-binding  31.71 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 
1580 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  34.62 
 
 
1828 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 
1580 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  34.85 
 
 
1580 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  28.57 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  27.54 
 
 
1656 aa  47.4  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  28 
 
 
103 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  25 
 
 
141 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  25 
 
 
141 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1666  polyketide synthase, putative  33.8 
 
 
5566 aa  47  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  28.17 
 
 
103 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  32.1 
 
 
3337 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1606  phosphopantetheine-binding  32.89 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.607416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4741  phosphopantetheine-binding  28.57 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711261  normal  0.224545 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3098  mycocerosate synthase  28.99 
 
 
1717 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18390  phosphopantetheine-containing protein  26.03 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.674444  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
662 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1429  6-deoxyerythronolide-B synthase  26.09 
 
 
2363 aa  43.9  0.0007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  32.86 
 
 
1876 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8815  Polyketide synthase modules and related protein- like protein  35.94 
 
 
2111 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.39915  normal  0.217366 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4951  Beta-ketoacyl synthase  26.15 
 
 
1835 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.780339  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  30.67 
 
 
505 aa  43.5  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  29.31 
 
 
6876 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4756  Acyl transferase  35.82 
 
 
2162 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.593906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3097  beta-ketoacyl synthase  31.43 
 
 
4869 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4453  phosphopantetheine-binding protein  30.77 
 
 
101 aa  41.6  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  28.79 
 
 
91 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0180  hypothetical protein  34.78 
 
 
90 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.612499  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1669  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  34.78 
 
 
90 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.772406  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1587  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  34.78 
 
 
90 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.059476  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  28.79 
 
 
91 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1857  amino acid adenylation domain-containing protein  35.09 
 
 
3099 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1219  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  30.43 
 
 
90 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  24.19 
 
 
1939 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  24.29 
 
 
897 aa  40.8  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1334  amino acid adenylation domain protein  35.29 
 
 
2896 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  26.56 
 
 
585 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00150  hypothetical protein similar to polyketide synthase (Broad)  32.81 
 
 
1806 aa  40.8  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4313  beta-ketoacyl synthase  26.87 
 
 
2393 aa  40.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.415713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 
1698 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2097  yersiniabactin synthetase, HMWP1 component  24.36 
 
 
3163 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>