197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3333 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3333  acyltransferase 3  100 
 
 
346 aa  683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1956  acyltransferase 3  34.8 
 
 
342 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00893007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2871  acyltransferase 3  32.13 
 
 
351 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1688  acyltransferase 3  32.24 
 
 
367 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.180609  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2694  acyltransferase 3  33.33 
 
 
327 aa  144  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4681  acyltransferase 3  36.71 
 
 
356 aa  142  9e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.883244 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2281  acyltransferase 3  33.43 
 
 
351 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4207  acyltransferase 3  32.84 
 
 
338 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1676  acyltransferase 3  33.42 
 
 
367 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855409  normal  0.393603 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4697  acyltransferase 3  33.67 
 
 
342 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4497  acyltransferase 3  32.82 
 
 
339 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.601093  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0913  acyltransferase 3  33.33 
 
 
384 aa  124  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1193  acyltransferase 3  30.29 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.559062  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1528  acyltransferase 3  31.64 
 
 
363 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.469566 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2291  acyltransferase 3  32.19 
 
 
382 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0403995  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6786  acyltransferase 3  32.39 
 
 
354 aa  115  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2465  acyltransferase 3  31.04 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0125025  normal  0.0255247 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3881  acyltransferase 3  33.55 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.645656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2102  acyltransferase 3  31.96 
 
 
382 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188806  normal  0.600649 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1680  acyltransferase 3  32.59 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1653  putative exopolysaccharide production protein ExoZ  29.06 
 
 
335 aa  109  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.463034  normal  0.0385271 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2734  acetyltransferase family protein  31.59 
 
 
340 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1766  acyltransferase 3  31.68 
 
 
366 aa  108  1e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0833  acyltransferase 3  32.85 
 
 
337 aa  107  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013862  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1890  acyltransferase 3  31.04 
 
 
344 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2663  acyltransferase 3  28.49 
 
 
368 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.336229  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03732  putative acyltransferase transmembrane protein  29.64 
 
 
375 aa  103  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.477787  normal  0.658202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1080  putative acyltransferase, putative membrane protein  29.55 
 
 
364 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4943  acyltransferase 3  30.93 
 
 
335 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.306637 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1683  acyltransferase 3  26.06 
 
 
357 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.610394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6862  acyltransferase 3  31.86 
 
 
376 aa  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1984  acyltransferase 3  31.32 
 
 
344 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313741  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.99 
 
 
395 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.99 
 
 
395 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0850  acyltransferase 3  28.73 
 
 
359 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0165262 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1166  acyltransferase 3  30.03 
 
 
357 aa  99.8  7e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3705  acyltransferase 3  28.25 
 
 
353 aa  98.6  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2377  acyltransferase 3  29.58 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.623012  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3069  acyltransferase 3  30.36 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3318  acyltransferase 3  29.3 
 
 
344 aa  98.6  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0862368 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3771  acyltransferase 3  30.52 
 
 
378 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1886  acyltransferase 3  30.85 
 
 
355 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.657669  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0183  acyltransferase 3  30.41 
 
 
362 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.585084  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3105  acyltransferase 3  30.58 
 
 
333 aa  92  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3629  acyltransferase 3  29.32 
 
 
309 aa  90.1  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00464208  normal  0.205518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3379  acyltransferase 3  30.25 
 
 
354 aa  88.6  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.765152  normal  0.118052 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1270  acyltransferase 3  29.72 
 
 
348 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.545486  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0759  acyltransferase 3  26.7 
 
 
336 aa  85.9  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.083154  normal  0.109469 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2384  acyltransferase 3  39.62 
 
 
383 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3179  acyltransferase 3  29.2 
 
 
362 aa  80.1  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.488055  decreased coverage  0.000870466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1051  putative acyltransferase, putative membrane protein  30.81 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5590  acyltransferase 3  28.53 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2243  acetyltransferase family protein  26.88 
 
 
377 aa  77  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.243115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1182  acyltransferase 3  27.55 
 
 
354 aa  73.6  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.257471  normal  0.827724 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0706  acyltransferase 3  29.4 
 
 
353 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4028  acyltransferase  27.57 
 
 
354 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0653522  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4367  acyltransferase 3  25.47 
 
 
408 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.689803  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0103  acyltransferase 3  28.82 
 
 
584 aa  63.5  0.000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1379  putative acyltransferase transmembrane protein  27.49 
 
 
374 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0870  acyltransferase 3  34.69 
 
 
695 aa  62  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2849  acyltransferase 3  31.67 
 
 
384 aa  61.6  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3619  acyltransferase 3  26.42 
 
 
382 aa  60.8  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0197  acyltransferase 3  27.39 
 
 
371 aa  60.5  0.00000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3905  acyltransferase 3  24.86 
 
 
357 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0488  acyltransferase 3  26.43 
 
 
372 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0297786  hitchhiker  0.00634173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1595  acyltransferase 3  25.51 
 
 
508 aa  59.7  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.915882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4066  acyltransferase 3  28.15 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2124  acyltransferase 3  30 
 
 
350 aa  58.2  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3908  acyltransferase 3  32.54 
 
 
372 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0921466  normal  0.247084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2367  acyltransferase 3  25.84 
 
 
389 aa  57  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402502 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2119  acyltransferase 3  25.91 
 
 
356 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0270936  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0890  acyltransferase 3  24.29 
 
 
387 aa  57  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0084  acyltransferase 3  23.19 
 
 
378 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4566  acyltransferase 3  29.13 
 
 
398 aa  56.6  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.732432  normal  0.281548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1144  acyltransferase 3  23.97 
 
 
376 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.136907  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0601  acyltransferase 3  28.66 
 
 
353 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.934375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0630  acyltransferase 3  26.92 
 
 
394 aa  54.7  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.344764 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4275  acyltransferase 3  25.33 
 
 
379 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.271112  hitchhiker  0.000000000988837 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2192  acyltransferase 3  25.58 
 
 
359 aa  53.5  0.000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.735291  normal  0.409572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0580  acyltransferase 3  25.79 
 
 
381 aa  52.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2461  acyltransferase 3  25.6 
 
 
437 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2626  acyltransferase 3  25.47 
 
 
358 aa  52  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.571513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0996  hypothetical protein  23.82 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0376747  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1793  acyltransferase 3  26.56 
 
 
393 aa  51.6  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.130977  hitchhiker  0.00741592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2826  acyltransferase 3  23.31 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1225  acyltransferase 3  26.29 
 
 
385 aa  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0125  acyltransferase 3  23.66 
 
 
433 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2335  exopolysaccharide production protein ExoZ, putative  27.81 
 
 
356 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.107926  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2067  acyltransferase 3  24.48 
 
 
400 aa  50.4  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2606  acyltransferase 3  26.9 
 
 
603 aa  50.8  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00250155  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  27.14 
 
 
638 aa  50.4  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4561  acyltransferase 3  29.6 
 
 
626 aa  50.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.064478  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3866  acyltransferase 3  24.42 
 
 
379 aa  50.4  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  38.62 
 
 
635 aa  49.7  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3493  acyltransferase 3  27.76 
 
 
362 aa  49.7  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0867456  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1753  acyltransferase 3  24.58 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.220043  normal  0.062316 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_7246  acyltransferase  29.49 
 
 
354 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  33.52 
 
 
662 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2523  hypothetical protein  38.75 
 
 
657 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4467  acyltransferase 3  25.32 
 
 
357 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>