166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3313 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  69.66 
 
 		 448 aa  646    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 437 aa  907    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  54.2 
 
 		 427 aa  489  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  50.34 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  48.66 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  47.37 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  48.69 
 
 		 424 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  48.07 
 
 		 418 aa  393  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  44.69 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  46.34 
 
 		 421 aa  384  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  43.93 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  44.17 
 
 		 430 aa  362  6e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  45.28 
 
 		 413 aa  361  2e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  44.77 
 
 		 421 aa  356  3.9999999999999996e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  43.23 
 
 		 446 aa  350  3e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  44.23 
 
 		 423 aa  341  1e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  29.9 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  28.41 
 
 		 441 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  29.32 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  28.43 
 
 		 428 aa  147  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  27.21 
 
 		 473 aa  146  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  28.54 
 
 		 434 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  26.47 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  26.61 
 
 		 434 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  26.38 
 
 		 438 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  26.47 
 
 		 437 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  28.05 
 
 		 452 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  28.67 
 
 		 437 aa  140  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  26.47 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  26.91 
 
 		 425 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  27.55 
 
 		 435 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  24.65 
 
 		 412 aa  138  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  28.63 
 
 		 438 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  26.13 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  26.03 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  26.03 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  25.9 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  25.9 
 
 		 437 aa  137  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  26.55 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  29.4 
 
 		 438 aa  134  3e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  27.29 
 
 		 460 aa  134  3.9999999999999996e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  26.87 
 
 		 470 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  24.53 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  27.59 
 
 		 437 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  25.88 
 
 		 424 aa  130  5.0000000000000004e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  27.03 
 
 		 437 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  27.75 
 
 		 427 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  25.62 
 
 		 469 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  26.05 
 
 		 464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  26.17 
 
 		 429 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  26.9 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  26.23 
 
 		 415 aa  126  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  25.75 
 
 		 415 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  25.75 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  23.89 
 
 		 423 aa  123  6e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  26.22 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  24.69 
 
 		 445 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  26.03 
 
 		 464 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  25.93 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.89 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  24.23 
 
 		 439 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  22.97 
 
 		 417 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  25 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  25.29 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  30.51 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 409 aa  87.4  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  25.88 
 
 		 574 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  26.07 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  25.77 
 
 		 556 aa  80.5  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  31.29 
 
 		 486 aa  79.7  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0489  FAD linked oxidase domain protein  27.86 
 
 		 425 aa  72  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  31.13 
 
 		 376 aa  69.7  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  24.34 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.11 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  25.73 
 
 		 483 aa  68.2  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.65 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  25.32 
 
 		 481 aa  65.9  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02835  conserved hypothetical protein  30.23 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.789204  normal  0.0228764 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3539  FAD/FMN-containing dehydrogenases-like protein  27.94 
 
 		 761 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.709079 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03330  hypothetical protein  21.62 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.141442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  42.03 
 
 		 69 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  27 
 
 		 475 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0203  oxidoreductase, FAD-binding  27.68 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0167  oxidoreductase, FAD-binding  26.79 
 
 		 471 aa  59.3  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.395629  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0223  oxidoreductase, FAD-binding  26.79 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.337071  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4051  FAD linked oxidase domain protein  21.05 
 
 		 443 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0277963  normal  0.0660181 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5790  FAD linked oxidase domain protein  23.91 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.79 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0199  oxidoreductase, FAD-binding  26.79 
 
 		 468 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.411918  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  32.73 
 
 		 452 aa  58.9  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0178  FAD-binding oxidoreductase  26.79 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.394744  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.49 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0180  oxidoreductase, FAD-binding  26.79 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0164  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.44 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0170  oxidoreductase, FAD-binding  25.89 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.93 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5122  oxidoreductase, FAD-binding  25.89 
 
 		 478 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.874515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2790  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.302451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3327  FAD linked oxidase domain protein  26.55 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>