147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3299 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3299  protein of unknown function DUF820  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2202  hypothetical protein  38.1 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0558608 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4405  protein of unknown function DUF820  35.42 
 
 
190 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.738575  hitchhiker  0.000905365 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4343  protein of unknown function DUF820  35.42 
 
 
190 aa  125  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0961  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0173  protein of unknown function DUF820  38.99 
 
 
209 aa  119  3.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.382996  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4826  hypothetical protein  33.51 
 
 
193 aa  117  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0786797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0988  protein of unknown function DUF820  32.97 
 
 
188 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.28586 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2053  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2027  protein of unknown function DUF820  32.45 
 
 
189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5334  protein of unknown function DUF820  34.62 
 
 
195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.510489  normal  0.17641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0890  protein of unknown function DUF820  35.29 
 
 
203 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.288036  normal  0.0388608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0371  hypothetical protein  34.55 
 
 
194 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2432  hypothetical protein  32.11 
 
 
202 aa  105  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.67173  normal  0.365453 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4337  protein of unknown function DUF820  34.41 
 
 
195 aa  105  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4229  hypothetical protein  31.87 
 
 
189 aa  104  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0573  protein of unknown function DUF820  32.28 
 
 
196 aa  104  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2885  hypothetical protein  32.79 
 
 
190 aa  103  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.142642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3545  protein of unknown function DUF820  32.4 
 
 
194 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00307984 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1924  hypothetical protein  32.34 
 
 
191 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0036  hypothetical protein  31.11 
 
 
192 aa  99.8  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000477397  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1860  hypothetical protein  31.52 
 
 
184 aa  99.4  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.571985  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1442  hypothetical protein  31.89 
 
 
197 aa  99  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.434824 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0662  protein of unknown function DUF820  29.35 
 
 
198 aa  98.6  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0628  hypothetical protein  32.84 
 
 
196 aa  98.2  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0294  hypothetical protein  29.94 
 
 
188 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.223469  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2551  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3825  protein of unknown function DUF820  33.52 
 
 
187 aa  96.7  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2079  hypothetical protein  29.53 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.204058  hitchhiker  0.000474177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4308  protein of unknown function DUF820  33.7 
 
 
184 aa  95.9  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.254676  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4909  protein of unknown function DUF820  32.46 
 
 
192 aa  95.5  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2541  protein of unknown function DUF820  26.92 
 
 
194 aa  95.1  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3759  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 
209 aa  94.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5140  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
200 aa  94.7  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.317934  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2266  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
195 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0466597  hitchhiker  0.000108655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3912  protein of unknown function DUF820  31.01 
 
 
190 aa  93.6  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4290  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
195 aa  93.2  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2595  hypothetical protein  28.49 
 
 
230 aa  92.8  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0392428 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4350  protein of unknown function DUF820  30.81 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2319  protein of unknown function DUF820  27.68 
 
 
189 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2268  protein of unknown function DUF820  27.68 
 
 
189 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3807  protein of unknown function DUF820  32.24 
 
 
189 aa  90.5  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0248  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 
187 aa  90.1  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4778  protein of unknown function DUF820  30.05 
 
 
193 aa  89.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00894932  hitchhiker  0.000613613 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3717  hypothetical protein  26.92 
 
 
197 aa  89  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.200961  normal  0.0468458 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3808  protein of unknown function DUF820  25.53 
 
 
187 aa  89  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0540  hypothetical protein  32.68 
 
 
189 aa  88.6  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1255  protein of unknown function DUF820  29.61 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1626  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1601  protein of unknown function DUF820  29.73 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3925  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  87.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.948868 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5199  hypothetical protein  30.56 
 
 
234 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187228 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2001  protein of unknown function DUF820  33.51 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3054  protein of unknown function DUF820  31.91 
 
 
189 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2718  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.602399  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3157  protein of unknown function DUF820  27.07 
 
 
191 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3395  protein of unknown function DUF820  31.28 
 
 
191 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2361  hypothetical protein  28.4 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1286  protein of unknown function DUF820  28.49 
 
 
193 aa  85.9  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.332778 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0006  hypothetical protein  30.29 
 
 
206 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1588  hypothetical protein  31.02 
 
 
194 aa  85.1  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.856601  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3945  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000129802  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3895  protein of unknown function DUF820  28.19 
 
 
195 aa  84.7  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4805  hypothetical protein  25.41 
 
 
186 aa  84.7  8e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0150793 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  29.9 
 
 
251 aa  84.7  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2040  hypothetical protein  33.16 
 
 
188 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0390  protein of unknown function DUF820  29.1 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6783  hypothetical protein  27.68 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0570349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1727  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 
191 aa  82  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4350  protein of unknown function DUF820  28.72 
 
 
201 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0563  hypothetical protein  38.38 
 
 
109 aa  81.3  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1751  protein of unknown function DUF820  27.47 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0452  hypothetical protein  33.77 
 
 
188 aa  78.6  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0644787 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3475  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000439019  normal  0.0457719 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2628  protein of unknown function DUF820  29.79 
 
 
193 aa  78.6  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2315  protein of unknown function DUF820  32.11 
 
 
188 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0247233  normal  0.178309 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1810  hypothetical protein  29.47 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00248062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5107  protein of unknown function DUF820  27.93 
 
 
188 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.604393  normal  0.621809 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4644  hypothetical protein  27.93 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.148884 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  31.94 
 
 
187 aa  73.6  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  30.43 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5185  protein of unknown function DUF820  30.77 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2565  protein of unknown function DUF820  26.97 
 
 
194 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1645  protein of unknown function DUF820  30.06 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0741  protein of unknown function DUF820  25.68 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3386  protein of unknown function DUF820  22.73 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.127932  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  30.56 
 
 
187 aa  69.7  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4056  prevent-host-death family protein  28.49 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000345405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2886  hypothetical protein  25.71 
 
 
190 aa  69.7  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3351  protein of unknown function DUF820  27.81 
 
 
181 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00323949  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2962  protein of unknown function DUF820  29.33 
 
 
191 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3531  hypothetical protein  28.77 
 
 
183 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.151198  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1737  prevent-host-death family protein  29.41 
 
 
241 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000358134  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2002  protein of unknown function DUF820  32.19 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.74571  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3209  hypothetical protein  29.45 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0292  hypothetical protein  22.75 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633898  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2156  prevent-host-death family protein  27.82 
 
 
242 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000223866  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1422  hypothetical protein  29.73 
 
 
129 aa  62  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0659527  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2818  protein of unknown function DUF820  26.29 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1085  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  61.2  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>