More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3289 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3289  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 328 aa  685    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3221  glycosyl transferase family protein  30.61 
 
 		 328 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2246  glycosyl transferase family 2  25.52 
 
 		 341 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0322727  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3095  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 		 337 aa  94  3e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0262384  normal  0.253171 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  24.73 
 
 		 691 aa  93.2  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 691 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 691 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1328  glycosyl transferase family protein  29.1 
 
 		 332 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 325 aa  89.7  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2689  glycosyl transferase family protein  27.2 
 
 		 331 aa  87.4  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0468436  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  26.12 
 
 		 700 aa  87.4  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 		 703 aa  86.3  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.09 
 
 		 683 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  28.11 
 
 		 298 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 		 322 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3118  glycosyl transferase family protein  28.34 
 
 		 334 aa  84  0.000000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2759  glycosyl transferase family 2  29.58 
 
 		 337 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1748  glycosyl transferase family protein  25.81 
 
 		 300 aa  83.6  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.24 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0351  glycosyl transferase family protein  27.13 
 
 		 994 aa  82.8  0.000000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.792541  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  26.27 
 
 		 308 aa  81.6  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  28.81 
 
 		 652 aa  82.4  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  25.82 
 
 		 1077 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  24.58 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 1106 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0235  glycosyl transferase  30.24 
 
 		 320 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000204956  normal  0.587039 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3077  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 313 aa  79  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.243281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3136  glycosyl transferase family 2  26.2 
 
 		 320 aa  79  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0061  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1576  glycosyl transferase family protein  24.29 
 
 		 313 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1007  glycosyl transferase family protein  25.31 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.47724 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0792  glycosyl transferase family protein  26.61 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.77414 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  25.99 
 
 		 841 aa  77  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1099  hypothetical protein  23.88 
 
 		 336 aa  76.6  0.0000000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.299802 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1638  glycosyl transferase family 2  27.05 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2751  polysaccharide deacetylase  25.52 
 
 		 1118 aa  76.3  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.880093 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.13 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1013  glycosyl transferase family 2  26.69 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00302426  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0907  glycosyl transferase family protein  26.4 
 
 		 415 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00249013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4145  glycosyl transferase family protein  24.32 
 
 		 334 aa  75.9  0.0000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.417391 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0851  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 1152 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  29.49 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0426  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 366 aa  75.1  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0815896  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  24.02 
 
 		 325 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3821  glycosyl transferase family 2  25.94 
 
 		 1739 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6543  glycosyl transferase family protein  24.71 
 
 		 329 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.118819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2596  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 315 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00437692  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  25.28 
 
 		 841 aa  74.3  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0773  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 		 369 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4474  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.82 
 
 		 308 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1825  glycosyl transferase family protein  26.1 
 
 		 324 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  24.24 
 
 		 313 aa  72.8  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0509  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 		 1075 aa  72  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.253023  normal  0.0268717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.52 
 
 		 307 aa  72.4  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1368  glycosyl transferase family protein  25.52 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.537191  normal  0.711331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2879  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 328 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677444 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2407  glycosyl transferase family protein  21.97 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.116461  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  27.63 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1348  glycosyl transferase family protein  22.63 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 361 aa  71.6  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 		 272 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 318 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  27.96 
 
 		 1837 aa  70.5  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4989  glycosyl transferase family protein  27.54 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3795  glycosyl transferase family protein  24.78 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  23.65 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  22.36 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  27.78 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1867  glycosyl transferase  24.3 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4143  glycosyl transferase family 2  23.7 
 
 		 345 aa  69.3  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000205364 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  25.22 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  24.71 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12413  glycosyltransferase  23.34 
 
 		 330 aa  69.3  0.00000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1593  glycosyl transferase family protein  26.92 
 
 		 317 aa  69.3  0.00000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1595  polysaccharide deacetylase  24.47 
 
 		 1101 aa  68.6  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  26.67 
 
 		 304 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4265  glycosyl transferase family protein  23.55 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  25.71 
 
 		 1340 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2920  glycosyl transferase family protein  27.42 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1840  glycosyl transferase family 2  25.49 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.939946  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0562  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.53 
 
 		 403 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  23.33 
 
 		 860 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  25.12 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3682  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.735798  normal  0.011793 
 
 
-
 
NC_002950  PG2223  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.88 
 
 		 322 aa  67.4  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000156905 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3277  glycosyl transferase family protein  23.69 
 
 		 273 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  22.31 
 
 		 752 aa  67  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0123  glycosyl transferase family protein  28 
 
 		 346 aa  67  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000000010329 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1816  glycosyl transferase family 2  27.22 
 
 		 333 aa  67  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  26.16 
 
 		 1120 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2344  glycosyl transferase family 2  24.2 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.415521  hitchhiker  0.0000247035 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0757  glycosyl transferase family protein  24.43 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  28.11 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2173  glycosyl transferase family 2  26.8 
 
 		 337 aa  66.2  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4741  glycosyl transferase family protein  22.83 
 
 		 308 aa  66.2  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>