More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3252 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3252  cysteine synthase B  100 
 
 		 291 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5857  cysteine synthase B  76.55 
 
 		 290 aa  470  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6440  cysteine synthase B  69.97 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.417307  normal  0.797565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2362  cysteine synthase B  70 
 
 		 290 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.688309  normal  0.140538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0684  cysteine synthase B  68.6 
 
 		 294 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2504  cysteine synthase B  64.71 
 
 		 295 aa  374  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1251  cysteine synthase B  61.03 
 
 		 297 aa  354  1e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.122681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1352  cysteine synthase B  61.25 
 
 		 297 aa  349  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.078483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2454  cysteine synthase  58.22 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0944548  normal  0.580019 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2832  cysteine synthase B  58.22 
 
 		 294 aa  349  3e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0964  cysteine synthase B  60.34 
 
 		 297 aa  345  7e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1861  cysteine synthase B  59.66 
 
 		 295 aa  345  7e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1654  cysteine synthase B  60 
 
 		 299 aa  344  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0738123  normal  0.776685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4064  cysteine synthase B  60 
 
 		 312 aa  344  8e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.606315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1255  cysteine synthase B  60 
 
 		 312 aa  344  8e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.152363  hitchhiker  0.00382615 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1296  cysteine synthase B  58.5 
 
 		 300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3726  cysteine synthase B  58.5 
 
 		 300 aa  340  2e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1215  cysteine synthase B  59.31 
 
 		 312 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4219  cysteine synthase B  58.97 
 
 		 313 aa  338  5e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0547109  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1287  cysteine synthase B  60.2 
 
 		 299 aa  338  7e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.257463 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3031  cysteine synthase B  59.31 
 
 		 296 aa  338  7e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2386  cysteine synthase B  56.8 
 
 		 301 aa  336  1.9999999999999998e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.509251  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3172  cysteine synthase B  57.09 
 
 		 300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.248825 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0797  cysteine synthase B  58.97 
 
 		 299 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1306  cysteine synthase B  58.08 
 
 		 302 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000334367  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02321  cysteine synthase B (O-acetylserine sulfhydrolase B)  58.7 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2557  cysteine synthase B  58.7 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02282  hypothetical protein  58.7 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2793  cysteine synthase B  58.7 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1258  cysteine synthase B  58.7 
 
 		 303 aa  335  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00111513 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1240  cysteine synthase B  58.36 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0351057  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2576  cysteine synthase B  58.7 
 
 		 303 aa  335  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.717552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1285  cysteine synthase  59.04 
 
 		 300 aa  335  7e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1987  cysteine synthase B  56.8 
 
 		 306 aa  335  7e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2900  cysteine synthase B  56.46 
 
 		 301 aa  334  7.999999999999999e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2707  cysteine synthase B  58.36 
 
 		 303 aa  333  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.397465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1636  cysteine synthase B  57.93 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1100  cysteine synthase B  57.59 
 
 		 297 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52210  cysteine synthase B  58.28 
 
 		 299 aa  333  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.183215 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3651  cysteine synthase B  58.36 
 
 		 303 aa  333  3e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.370065  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1692  cysteine synthase B  57.24 
 
 		 300 aa  332  4e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3697  cysteine synthase B  56.9 
 
 		 313 aa  332  5e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.703798  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2240  cysteine synthase B  57.53 
 
 		 297 aa  332  5e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4578  cysteine synthase B  57.59 
 
 		 299 aa  330  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1899  cysteine synthase B  56.99 
 
 		 295 aa  330  2e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.512952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1014  cysteine synthase B  56.61 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.440167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0576  cysteine synthase B  56.61 
 
 		 300 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353475  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1132  cysteine synthase  58.08 
 
 		 301 aa  330  2e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134492 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1055  cysteine synthase B  56.61 
 
 		 325 aa  329  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0858  cysteine synthase B  55.44 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.947605 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1026  cysteine synthase B  56.46 
 
 		 300 aa  329  3e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2634  cysteine synthase B  57.34 
 
 		 303 aa  329  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.031236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2249  cysteine synthase B  56.61 
 
 		 300 aa  329  4e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2700  cysteine synthase B  57 
 
 		 303 aa  328  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.227311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4168  cysteine synthase B  56.27 
 
 		 300 aa  328  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1733  cysteine synthase B  56.55 
 
 		 301 aa  328  6e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.217633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2585  cysteine synthase B  57 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2806  cysteine synthase B  57 
 
 		 303 aa  328  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0787  cysteine synthase B  55.1 
 
 		 300 aa  328  7e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.280782 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0508  cysteine synthase B  57.79 
 
 		 303 aa  328  8e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2378  cysteine synthase B  55.44 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098453  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0664  cysteine synthase B  55.25 
 
 		 301 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2947  cysteine synthase B  56.66 
 
 		 303 aa  327  2.0000000000000001e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.209095  normal  0.369793 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0917  cysteine synthase B  55.78 
 
 		 300 aa  326  3e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3188  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 292 aa  326  3e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.124444  normal  0.617635 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3598  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 288 aa  325  4.0000000000000003e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0588  cysteine synthase  57.24 
 
 		 303 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0731  cysteine synthase B  55.59 
 
 		 311 aa  326  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.895889 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2560  cysteine synthase B  56.27 
 
 		 300 aa  325  5e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0931  cysteine synthase B  55.93 
 
 		 300 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0935  cysteine synthase B  55.93 
 
 		 300 aa  325  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3091  cysteine synthase B  57.45 
 
 		 292 aa  325  6e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0134095  normal  0.472051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3277  cysteine synthase B  54.61 
 
 		 293 aa  325  6e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3011  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 292 aa  324  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.421236  normal  0.0437724 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0064  cysteine synthase B  56.55 
 
 		 295 aa  324  9e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1646  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 303 aa  324  9e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2676  cysteine synthase B  56.31 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3291  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 292 aa  324  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00528645  normal  0.163316 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0211  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0418  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2984  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 300 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0938  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2874  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.466504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2562  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0754  cysteine synthase B  55.59 
 
 		 300 aa  322  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1100  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 292 aa  323  3e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00123647  normal  0.0556364 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0998  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 292 aa  322  3e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2937  cysteine synthase B  54.92 
 
 		 303 aa  322  3e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2212  cysteine synthase B  54.24 
 
 		 307 aa  322  5e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.199065 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1067  cysteine synthase B  57.8 
 
 		 292 aa  322  5e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000450075  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2993  cysteine synthase B  57.29 
 
 		 300 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.254167  hitchhiker  0.00110964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1006  cysteine synthase B  57.09 
 
 		 292 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000380642  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0990  cysteine synthase B  57.29 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2102  cysteine synthase B  55.25 
 
 		 296 aa  321  9.999999999999999e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37080  cysteine synthase B  55.86 
 
 		 299 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1005  cysteine synthase B  55.82 
 
 		 294 aa  318  5e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.817675  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3199  cysteine synthase B  54.27 
 
 		 293 aa  317  1e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.707785  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2765  cysteine synthase B  54.11 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.288853  hitchhiker  0.00234405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1303  cysteine synthase B  54.11 
 
 		 292 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.498371  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1412  cysteine synthase B  53.77 
 
 		 292 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.203131  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>