16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3243 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3243  hypothetical protein  100 
 
 		 131 aa  276  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.984975  normal  0.679111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3623  hypothetical protein  63.21 
 
 		 135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.599999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6938  hypothetical protein  51.11 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2873  hypothetical protein  48.19 
 
 		 131 aa  87  8e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0008  hypothetical protein  40.91 
 
 		 111 aa  79.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0004  hypothetical protein  39.77 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.408251  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0980  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00330636  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0030  hypothetical protein  38.64 
 
 		 113 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.593403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1174  hypothetical protein  36.84 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000759972 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0716  monoheme cytochrome c, putative  32.29 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0008  monoheme cytochrome c, putative  31.25 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000351615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0008  monoheme cytochrome c, putative  31.25 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0100224 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0008  monoheme cytochrome c, putative  31.25 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2982  hypothetical protein  35.19 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0917  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.606921  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>