More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3185 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3185  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 762 aa  1578    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.97115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0150  phytochrome sensor signal transduction histidine kinase  44.98 
 
 		 752 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4127  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.96 
 
 		 743 aa  718    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.313016  normal  0.0728263 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3820  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.18 
 
 		 755 aa  651    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.869603  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.81 
 
 		 757 aa  671    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1003  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.37 
 
 		 751 aa  489  1e-136  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.972748  hitchhiker  0.000165551 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4451  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 775 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2403  ATP-binding region, ATPase-like  35.19 
 
 		 776 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0308443 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3780  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 779 aa  458  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.689927  normal  0.970382 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3425  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.6 
 
 		 775 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0531418  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4450  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 758 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0035  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 769 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2402  ATP-binding region, ATPase-like  33.11 
 
 		 762 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0299776 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4111  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 760 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 760 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.26 
 
 		 749 aa  439  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.541129  normal  0.358425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3852  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 765 aa  430  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2818  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.29 
 
 		 769 aa  426  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0945314 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 799 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.721204  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0099  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 746 aa  425  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3424  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 758 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25862  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0383  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 		 746 aa  421  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.269133 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0539  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.9 
 
 		 751 aa  411  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.802089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2206  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 		 762 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15596  normal  0.128973 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4021  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 		 1013 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 760 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 791 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4270  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 751 aa  377  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.235212 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 774 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.960478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1956  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 748 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.727974  normal  0.121547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2356  phytochrome family protein, putative  30.67 
 
 		 755 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.634458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 748 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2162  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 745 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.894867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1796  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 756 aa  341  4e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.232536 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5067  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.9 
 
 		 1002 aa  338  1.9999999999999998e-91  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2377  ATP-binding region, ATPase-like  31.31 
 
 		 759 aa  337  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.974028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1902  bacteriophytochrome histidine kinase  31.04 
 
 		 745 aa  335  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.333534  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1986  putative GAF sensor protein  38.79 
 
 		 798 aa  333  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.932658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3504  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  31.2 
 
 		 745 aa  332  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.280312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0125  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 759 aa  327  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.812946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1511  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1002 aa  323  8e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1484  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 1002 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4519  putative GAF sensor protein  36.88 
 
 		 755 aa  310  9e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 775 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3788  phytochrome  33.74 
 
 		 772 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317187 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2652  bacteriophytochrome, putative  28.99 
 
 		 993 aa  304  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.163581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  34.6 
 
 		 842 aa  303  8.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  33.83 
 
 		 856 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 771 aa  301  3e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3080  bacteriophytochrome  32.3 
 
 		 783 aa  298  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2793  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 763 aa  297  4e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.172208  normal  0.714834 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33.27 
 
 		 849 aa  297  6e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  35.2 
 
 		 855 aa  296  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.07 
 
 		 847 aa  294  4e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1419  putative PAS/PAC sensor protein  35.82 
 
 		 770 aa  291  3e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2385  phytochrome:GAF:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:HWE histidine kinase  29.44 
 
 		 1003 aa  291  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.460117  normal  0.215255 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3686  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 709 aa  289  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.206553 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.52 
 
 		 844 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3141  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 762 aa  287  5e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.583701  normal  0.345899 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6428  bacteriophytochrome  35.39 
 
 		 723 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.688062  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3458  putative PAS/PAC sensor protein  35.12 
 
 		 760 aa  284  5.000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0932578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13140  bacteriophytochrome (light-regulated signal transduction histidine kinase)  35.65 
 
 		 772 aa  283  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  32.34 
 
 		 847 aa  280  5e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  32.34 
 
 		 847 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3673  putative PAS/PAC sensor protein  35.05 
 
 		 738 aa  280  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.483009  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  34.72 
 
 		 852 aa  279  2e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0975  putative bacteriophytochrome  29.13 
 
 		 728 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.04 
 
 		 846 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10700  putative bacteriophytochrome  29.43 
 
 		 728 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03310  GAF domain protein  34.12 
 
 		 625 aa  269  1e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0453757  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1309  putative PAS/PAC sensor protein  31.64 
 
 		 722 aa  270  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543635 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  34.23 
 
 		 856 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2978  putative GAF sensor protein  32.9 
 
 		 567 aa  268  2e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186  normal  0.0306937 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3985  putative PAS/PAC sensor protein  33.08 
 
 		 732 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.525883  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4191  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  32.95 
 
 		 980 aa  264  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3740  phytochrome  33.33 
 
 		 732 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.103591  decreased coverage  0.000116427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00897  GAF:ATP-binding region, ATPase-like:Histidine kinase A, N-terminal  27.85 
 
 		 884 aa  263  1e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.717501  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2169  putative GAF sensor protein  30.65 
 
 		 812 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0312851 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2910  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.24 
 
 		 783 aa  262  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0200681  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4111  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with phytochrome (GAF) sensor  32.77 
 
 		 931 aa  261  4e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  32.39 
 
 		 844 aa  260  8e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1726  putative PAS/PAC sensor protein  32.36 
 
 		 731 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4279  diguanylate phosphodiesterase  33.27 
 
 		 936 aa  258  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3914  Phytochrome central region domain protein  30.89 
 
 		 509 aa  257  7e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.218618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3546  sensor protein (histidine protein kinase), acting on arcA  42.38 
 
 		 586 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00933538  normal  0.0548176 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03481  Multi-sensor Signal Transduction Histidine Kinase  28.16 
 
 		 908 aa  253  9.000000000000001e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0652805  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2444  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 721 aa  243  7e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0911916  normal  0.976086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 		 875 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3089  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.33 
 
 		 740 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.552133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.06 
 
 		 594 aa  234  3e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.574326  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  27.04 
 
 		 895 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  44.66 
 
 		 931 aa  233  1e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7207  putative PAS/PAC sensor protein  29.18 
 
 		 508 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2512  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 798 aa  228  3e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.505413  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 874 aa  223  8e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 864 aa  223  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.57 
 
 		 871 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1497  putative GAF sensor protein  30.58 
 
 		 689 aa  219  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2235  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 865 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  33.64 
 
 		 822 aa  219  2e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>