More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3167 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  100 
 
 
386 aa  806    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  83.2 
 
 
385 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  72.19 
 
 
393 aa  606  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  46.34 
 
 
387 aa  361  1e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  46.34 
 
 
387 aa  357  2.9999999999999997e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  46.89 
 
 
387 aa  354  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  44.39 
 
 
387 aa  343  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  46.45 
 
 
388 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  44.47 
 
 
397 aa  318  7.999999999999999e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  43.35 
 
 
378 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  43.05 
 
 
396 aa  315  9e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  43.39 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  41.73 
 
 
385 aa  313  2.9999999999999996e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  43.7 
 
 
359 aa  312  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  43.31 
 
 
387 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  41.29 
 
 
409 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  41.81 
 
 
409 aa  289  7e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  41.31 
 
 
396 aa  288  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  42.56 
 
 
398 aa  286  2.9999999999999996e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  40.46 
 
 
419 aa  285  8e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  39.42 
 
 
378 aa  278  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  38.26 
 
 
376 aa  278  1e-73  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  42.56 
 
 
413 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  41.34 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  41.99 
 
 
389 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  41.18 
 
 
398 aa  270  5e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  38.07 
 
 
388 aa  268  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  38.17 
 
 
382 aa  267  2e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  38.52 
 
 
397 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  38.1 
 
 
371 aa  264  2e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  39.4 
 
 
369 aa  262  6e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  37.08 
 
 
378 aa  262  8.999999999999999e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  39.74 
 
 
398 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  39.26 
 
 
403 aa  258  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  36.72 
 
 
377 aa  247  3e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  37.96 
 
 
379 aa  246  4.9999999999999997e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  39.38 
 
 
390 aa  246  6e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  39.57 
 
 
418 aa  246  6.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  35.48 
 
 
396 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  34.78 
 
 
394 aa  230  4e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  34.64 
 
 
386 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  34.55 
 
 
376 aa  216  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  34.42 
 
 
371 aa  212  7.999999999999999e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 
376 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  34.15 
 
 
371 aa  209  7e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  32 
 
 
378 aa  205  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  34.8 
 
 
367 aa  204  3e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  31.76 
 
 
388 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  32.89 
 
 
373 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  30.16 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  30.48 
 
 
377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  32.27 
 
 
373 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
372 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  30.75 
 
 
376 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  31.93 
 
 
359 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  29.68 
 
 
377 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  31.81 
 
 
391 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  32.65 
 
 
393 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  29.37 
 
 
377 aa  188  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  29.37 
 
 
377 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  29.37 
 
 
377 aa  188  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  31.62 
 
 
388 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  33.14 
 
 
367 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  33.25 
 
 
409 aa  179  7e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 
395 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  30 
 
 
380 aa  178  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 
389 aa  177  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  30.21 
 
 
369 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  29.05 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  30.37 
 
 
374 aa  173  5e-42  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  29.18 
 
 
382 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  28.64 
 
 
398 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  28.91 
 
 
382 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  27.63 
 
 
371 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  32.23 
 
 
397 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  27.25 
 
 
371 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  29.32 
 
 
381 aa  152  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  29.95 
 
 
384 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1865  oxidoreductase domain protein  29.63 
 
 
367 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  29.1 
 
 
385 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1096  oxidoreductase domain-containing protein  28.01 
 
 
370 aa  144  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.029157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  27.14 
 
 
381 aa  142  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  28.06 
 
 
374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  26.91 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  28.54 
 
 
380 aa  137  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.65 
 
 
366 aa  137  4e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  27.59 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  29.31 
 
 
396 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  29.57 
 
 
372 aa  133  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2755  oxidoreductase domain-containing protein  28.75 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.943546  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  28.72 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  27.74 
 
 
383 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3257  oxidoreductase domain protein  29.35 
 
 
347 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.979358  normal  0.603844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3006  oxidoreductase domain protein  30.08 
 
 
347 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.83 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2945  oxidoreductase domain-containing protein  27.72 
 
 
348 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.196748  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0284  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.72 
 
 
348 aa  128  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.683563  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  27.57 
 
 
348 aa  126  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  31.49 
 
 
364 aa  126  7e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5337  oxidoreductase domain protein  27.01 
 
 
394 aa  125  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.102157  normal  0.719098 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>