More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3077 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3858  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.94 
 
 		 978 aa  716    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.738511  hitchhiker  0.000383652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3077  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  100 
 
 		 991 aa  2066    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5063  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  71.33 
 
 		 1009 aa  1486    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.424632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11033  FAD linked oxidase-like protein  48.78 
 
 		 967 aa  937    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1924  FAD linked oxidase-like  41.23 
 
 		 967 aa  737    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0626  hypothetical protein  38.17 
 
 		 930 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2417  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  61.83 
 
 		 977 aa  1258    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3429  oxidoreductase  56.69 
 
 		 975 aa  1181    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2130  FAD linked oxidase domain protein  38.56 
 
 		 973 aa  676    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0843  FAD linked oxidase domain-containing protein  51.61 
 
 		 1011 aa  1076    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.505983 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3155  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  56.28 
 
 		 983 aa  1150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0560  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.77 
 
 		 976 aa  712    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.389138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4725  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  63.91 
 
 		 976 aa  1323    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.881602  hitchhiker  0.000909988 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4649  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  54.17 
 
 		 1034 aa  1122    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4811  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  52.24 
 
 		 971 aa  1028    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2129  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  50.91 
 
 		 968 aa  989    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702869  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2375  FAD linked oxidase-like protein  38.85 
 
 		 952 aa  631  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3126  FAD linked oxidase domain-containing protein  37.53 
 
 		 962 aa  611  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0457  FAD linked oxidase domain protein  37.12 
 
 		 1014 aa  599  1e-170  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.873167  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5632  D-lactate dehydrogenase  35.61 
 
 		 1007 aa  585  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1163  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.22 
 
 		 961 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.25056  normal  0.360544 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2904  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  36.13 
 
 		 1025 aa  582  1.0000000000000001e-165  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.83736  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4692  FAD linked oxidase domain protein  36.94 
 
 		 996 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0507445  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6956  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.58 
 
 		 1007 aa  580  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2438  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.18 
 
 		 1015 aa  579  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.944739  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0509  FAD linked oxidase domain protein  35.36 
 
 		 1024 aa  573  1.0000000000000001e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5731  D-lactate dehydrogenase / anaerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit C  36.18 
 
 		 984 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3324  D-lactate dehydrogenase  35.8 
 
 		 973 aa  568  1e-160  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3054  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.54 
 
 		 1032 aa  569  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4256  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.83 
 
 		 1005 aa  559  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0600  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.65 
 
 		 1025 aa  562  1e-158  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2720  FAD linked oxidase-like protein  34.45 
 
 		 1024 aa  557  1e-157  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2940  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 1055 aa  556  1e-157  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4721  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.84 
 
 		 990 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00766177 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4574  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.21 
 
 		 990 aa  553  1e-156  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0207313 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4204  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  35.55 
 
 		 990 aa  553  1e-156  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0106272  normal  0.500842 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3025  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.74 
 
 		 1038 aa  555  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.473379 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0210  FAD linked oxidase domain protein  35.05 
 
 		 1032 aa  551  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.23019 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2125  FAD linked oxidase domain protein  34.18 
 
 		 1015 aa  550  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2905  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.46 
 
 		 995 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.129344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2896  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.19 
 
 		 1035 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.228282  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3402  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.53 
 
 		 989 aa  543  1e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2547  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.02 
 
 		 1023 aa  540  9.999999999999999e-153  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.846231  normal  0.179542 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3764  FAD linked oxidase domain protein  33.04 
 
 		 1070 aa  539  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0200676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  34.13 
 
 		 1046 aa  537  1e-151  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.433377  normal  0.249121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3485  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.25 
 
 		 983 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1400  FAD linked oxidase domain protein  34.12 
 
 		 1023 aa  531  1e-149  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0464  hypothetical protein  32.59 
 
 		 984 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0289  FAD linked oxidase domain protein  32.75 
 
 		 976 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2768  FAD linked oxidase domain protein  33.63 
 
 		 974 aa  512  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.834372  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08570  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  32.63 
 
 		 945 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.695725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1983  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  33.13 
 
 		 1031 aa  506  9.999999999999999e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2770  putative FAD-dependent oxidoreductase  32.35 
 
 		 999 aa  503  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2991  FAD linked oxidase-like  33.84 
 
 		 1013 aa  503  1e-141  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.207062 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1181  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.37 
 
 		 1037 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.998854 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0810  hypothetical protein  32.14 
 
 		 1050 aa  502  1e-140  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6755  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  32.13 
 
 		 999 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0858  FAD linked oxidase domain protein  32.37 
 
 		 1052 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0862  FAD linked oxidase domain protein  32.31 
 
 		 1050 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.961575  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0764  FAD linked oxidase domain protein  30.77 
 
 		 987 aa  484  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1074  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.34 
 
 		 1022 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.899734  decreased coverage  0.000498092 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4859  FAD linked oxidase domain protein  30.51 
 
 		 1043 aa  472  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0821468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4130  FAD linked oxidase domain protein  32.1 
 
 		 975 aa  469  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.419398  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2176  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.19 
 
 		 1018 aa  464  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0114816 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2718  FAD linked oxidase-like  31.6 
 
 		 1010 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.400601 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2371  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  30.29 
 
 		 1024 aa  459  1e-127  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.475276  normal  0.254542 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0957  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.86 
 
 		 950 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4442  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding:FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.4 
 
 		 966 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1746  FAD linked oxidase-like  30.25 
 
 		 1013 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04320  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  31.21 
 
 		 989 aa  453  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2161  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.78 
 
 		 1024 aa  452  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.126356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02063  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1011 aa  451  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2117  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  30.15 
 
 		 973 aa  452  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.715118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003726  Fe-S oxidoreductase  30.23 
 
 		 1011 aa  450  1e-125  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000740961  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2533  FAD linked oxidase, C-terminal:FAD linked oxidase, N-terminal  30.86 
 
 		 1015 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.799372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1787  D-lactate dehydrogenase (cytochrome)  31.22 
 
 		 948 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0362  FAD linked oxidase domain protein  29.8 
 
 		 1006 aa  448  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2062  FAD linked oxidase  29.7 
 
 		 1010 aa  447  1.0000000000000001e-124  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1550  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.29 
 
 		 1026 aa  448  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.273909  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01656  predicted FAD-linked oxidoreductase  29.81 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1768  oxidoreductase, FAD-binding  29.81 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2805  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.26 
 
 		 1015 aa  444  1e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1739  oxidase, FAD binding  29.98 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1659  FAD linked oxidase domain protein  28.89 
 
 		 1021 aa  446  1e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370272  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1903  oxidoreductase, FAD-binding  29.71 
 
 		 1018 aa  443  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.610317  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1691  FAD linked oxidase domain protein  29.32 
 
 		 1019 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01645  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0369  FAD linked oxidase domain protein  29.48 
 
 		 1002 aa  446  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3570  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.96 
 
 		 1027 aa  445  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.824304  normal  0.375577 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1944  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.81 
 
 		 1018 aa  445  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000150005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1845  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 		 1018 aa  444  1e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2596  hypothetical protein  29.98 
 
 		 1018 aa  444  1e-123  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1955  FAD linked oxidase domain protein  29.81 
 
 		 1018 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181771  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1888  oxidoreductase, FAD-binding  29.81 
 
 		 1018 aa  441  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1477  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 1018 aa  442  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000065688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2402  oxidoreductase, FAD-binding  29.62 
 
 		 1018 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0186702 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1461  FAD linked oxidase domain protein  30.18 
 
 		 1018 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.236754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0818  hypothetical protein  30.17 
 
 		 1021 aa  440  9.999999999999999e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.103467  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1509  oxidoreductase, FAD-binding  29.42 
 
 		 1018 aa  437  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.784999  hitchhiker  0.0000155929 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2714  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.4 
 
 		 1023 aa  439  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488036  normal  0.0122015 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>