115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3051 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3051  DoxX family protein  100 
 
 		 136 aa  271  3e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.127697 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01610  hypothetical protein  51.69 
 
 		 123 aa  120  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  49.26 
 
 		 143 aa  117  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  44.44 
 
 		 153 aa  110  7.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  43.22 
 
 		 137 aa  102  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3635  DoxX family protein  40.87 
 
 		 131 aa  90.5  7e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176177  hitchhiker  0.000433315 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0824  DoxX family protein  40.91 
 
 		 147 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0639123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4101  DoxX family protein  43.81 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0096  DoxX  35.2 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  36.72 
 
 		 183 aa  60.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  35.94 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1461  DoxX  33.33 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6367  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7034  DoxX family protein  33.33 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.182123  normal  0.352709 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1964  DoxX  33.33 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5453  DoxX family protein  35.83 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.403659  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  36.72 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5722  DoxX family protein  29.23 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.486124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  36.72 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0829  DoxX family protein  33.06 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  31.25 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0526  DoxX family protein  32.09 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0728  hypothetical protein  33.81 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0830  DoxX family protein  30.71 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  35.83 
 
 		 185 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  31.51 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2661  DoxX family protein  34.29 
 
 		 140 aa  51.6  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.204335  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1056  hypothetical protein  36.72 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.461065  normal  0.259648 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1765  DoxX  29.13 
 
 		 127 aa  51.2  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  35.54 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3308  DoxX family protein  29.69 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4829  DoxX family protein  31.9 
 
 		 133 aa  50.8  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1344  DoxX family protein  36.22 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.197764  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2934  DoxX family protein  34.4 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2081  DoxX family protein  30.53 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0953416  normal  0.292835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0240  hypothetical protein  31.03 
 
 		 145 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0059  DoxX family protein  30.95 
 
 		 128 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.41597  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  34.62 
 
 		 172 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  30.28 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  31.62 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  33.87 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1503  DoxX family protein  30.89 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  33.56 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2637  DoxX family protein  33.33 
 
 		 153 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.920826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1247  DoxX family protein  35.11 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000114768  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.99 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  32.03 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2974  DoxX  32.09 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00548742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0320  DoxX family protein  24.79 
 
 		 144 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4310  DoxX family protein  31.34 
 
 		 147 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  31.25 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.12 
 
 		 146 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  29.66 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  29.46 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  31.51 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  33.33 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1616  DoxX  37.08 
 
 		 216 aa  45.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1799  DoxX family protein  37.08 
 
 		 197 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.534282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1879  DoxX family protein  32.06 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371947 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0476  DoxX family protein  29.92 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0125441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0384  DoxX family protein  27.5 
 
 		 150 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.762474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  32.23 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  30.07 
 
 		 378 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0010  DoxX family protein  29.66 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1531  DoxX family protein  32.69 
 
 		 197 aa  44.7  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1889  DoxX family protein  30.15 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1219  DoxX family protein  25.9 
 
 		 156 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.901202  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3606  DoxX family protein  27.73 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.142156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  34.31 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0934  DoxX  31.45 
 
 		 140 aa  44.3  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000957  hypothetical protein  31.03 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000422925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1630  DoxX family protein  32.61 
 
 		 140 aa  44.7  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0370029  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4416  DoxX family protein  31.01 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.386618  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1133  hypothetical protein  34.65 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0161516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  26.47 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1456  hypothetical protein  37.36 
 
 		 198 aa  43.5  0.0009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.32928  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0540  DoxX family protein  28.15 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2244  DoxX  32.61 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201845  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1221  DoxX family protein  33.58 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.806219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1292  DoxX family protein  33.58 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0246117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1222  DoxX family protein  33.58 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3555  DoxX family protein  29.69 
 
 		 130 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.453371 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0221  hypothetical protein  27.45 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  29.55 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0104  putative integral membrane protein  23.33 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.489951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2305  DoxX family protein  33.71 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0149049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2495  DoxX family protein  33.71 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.640487  hitchhiker  0.00764206 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2754  DoxX family protein  27.05 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175423  hitchhiker  0.00133286 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3493  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3527  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0510711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3423  hypothetical protein  31.25 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3420  putative inner membrane protein YqjF  31.25 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  28.91 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  35.66 
 
 		 172 aa  41.6  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3509  DoxX family protein  27.14 
 
 		 130 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2748  DoxX family protein  35.96 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.505798 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  29.27 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3155  DoxX family protein  32.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00658945 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0190  DoxX  31.06 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000463146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2997  DoxX family protein  32.58 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>