125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3045 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3045  glutathionylspermidine synthase  100 
 
 
391 aa  809    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5050  glutathionylspermidine synthase  64.36 
 
 
390 aa  518  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.440506 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1647  glutathionylspermidine synthase subfamily protein  51.88 
 
 
393 aa  420  1e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1541  glutathionylspermidine synthase family protein  50.5 
 
 
392 aa  398  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0090  glutathionylspermidine synthase  48.62 
 
 
393 aa  390  1e-107  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.346525  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1661  glutathionylspermidine synthase family protein  47.36 
 
 
391 aa  372  1e-102  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1553  glutathionylspermidine synthase family protein  48.21 
 
 
390 aa  369  1e-101  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0396  glutathionylspermidine synthase family protein  48.31 
 
 
389 aa  364  2e-99  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.338468  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1585  glutathionylspermidine synthase family protein  48.83 
 
 
389 aa  362  6e-99  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0421  glutathionylspermidine synthase family protein  48.05 
 
 
389 aa  362  8e-99  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1471  glutathionylspermidine synthase  44.33 
 
 
392 aa  345  5e-94  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1327  glutathionylspermidine synthase  32.53 
 
 
407 aa  156  7e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2241  glutathionylspermidine synthase  32.16 
 
 
373 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1876  glutathionylspermidine synthase  34.3 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2484  glutathionylspermidine synthase  35.16 
 
 
382 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.158582  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4889  glutathionylspermidine synthase  30.31 
 
 
377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5551  glutathionylspermidine synthase  31.65 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5363  glutathionylspermidine synthetase  32.27 
 
 
384 aa  140  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2359  glutathionylspermidine synthase  28.03 
 
 
381 aa  140  3.9999999999999997e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.94612  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8737  glutathionylspermidine synthase  29.23 
 
 
393 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.520818  normal  0.189444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02910  predicted enzyme  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0663  glutathionylspermidine synthase  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.553236  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02860  hypothetical protein  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5279  glutathionylspermidine synthase  32.35 
 
 
385 aa  139  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.428801  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3215  glutathionylspermidine synthase family protein  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3502  glutathionylspermidine synthase family protein  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000151418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0660  glutathionylspermidine synthase  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.199544 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3332  glutathionylspermidine synthase family protein  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3470  glutathionylspermidine synthase family protein  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000295312  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4351  glutathionylspermidine synthase family protein  31.75 
 
 
386 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00967413  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4737  glutathionylspermidine synthase domain protein  30.03 
 
 
387 aa  139  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.461524  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4644  glutathionylspermidine synthase domain protein  29.75 
 
 
387 aa  139  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4794  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  29.75 
 
 
387 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4653  glutathionylspermidine synthase domain protein  29.75 
 
 
387 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4773  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  29.48 
 
 
387 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3446  glutathionylspermidine synthase  31.12 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3439  glutathionylspermidine synthase  31.12 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3374  glutathionylspermidine synthase  31.12 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.473418 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3369  glutathionylspermidine synthase  31.12 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3541  glutathionylspermidine synthase  31.12 
 
 
387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3807  glutathionylspermidine synthase  28.93 
 
 
387 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5702  glutathionylspermidine synthase domain protein  28.93 
 
 
387 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.515802  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0311  Trypanothione synthase  31.61 
 
 
386 aa  136  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4657  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  28.93 
 
 
387 aa  136  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.717463 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04053  predicted synthetase/amidase  28.93 
 
 
387 aa  134  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7051  glutathionylspermidine synthase  31.29 
 
 
386 aa  134  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145247  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3827  glutathionylspermidine synthase  28.93 
 
 
387 aa  134  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000494371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3779  glutathionylspermidine synthase  30.97 
 
 
386 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.326667  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4430  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  28.93 
 
 
387 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4746  glutathionylspermidine synthase domain-containing protein  28.93 
 
 
387 aa  133  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.260545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3450  glutathionylspermidine synthase  30.59 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3621  glutathionylspermidine synthase  28.8 
 
 
386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0571  putative glutathionylspermidine synthase  30.34 
 
 
386 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0651  glutathionylspermidine synthase  30.34 
 
 
386 aa  129  6e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0287  hypothetical protein  29.63 
 
 
386 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0321  glutathionylspermidine synthase  32.43 
 
 
386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000368452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4275  glutathionylspermidine synthase  28.99 
 
 
386 aa  127  4.0000000000000003e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.747428  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01618  glutathionylspermidine synthase  29.21 
 
 
388 aa  127  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3071  glutathionylspermidine synthase  29.82 
 
 
400 aa  125  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.742359  normal  0.268432 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3426  hypothetical protein  29.82 
 
 
400 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3591  hypothetical protein  30.85 
 
 
406 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.274003  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1573  glutathionylspermidine synthase  31.64 
 
 
401 aa  123  5e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0108547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01240  glutathionylspermidine synthase  32.36 
 
 
388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.636699  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2755  glutathionylspermidine synthase  31.22 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0039837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5405  glutathionylspermidine synthase  32.43 
 
 
384 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.500047  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5565  glutathionylspermidine synthase  30.22 
 
 
384 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1405  glutathionylspermidine synthase  31.08 
 
 
385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4277  glutathionylspermidine synthase  31.28 
 
 
386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.124865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1247  glutathionylspermidine synthase  29.35 
 
 
407 aa  117  5e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.37102  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5199  glutathionylspermidine synthase  32.65 
 
 
387 aa  117  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.644517  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003906  glutathionylspermidine synthase  29.01 
 
 
388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.763675  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3053  glutathionylspermidine synthase  29.75 
 
 
406 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00288809  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1698  glutathionylspermidine synthase  31.18 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.231799  normal  0.406179 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3915  glutathionylspermidine synthase  30.71 
 
 
385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.402968  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3849  glutathionylspermidine synthase  31.86 
 
 
392 aa  114  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5048  glutathionylspermidine synthase  29.54 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.875853  normal  0.0509044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5121  glutathionylspermidine synthase  31.59 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.185627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0115  glutathionylspermidine synthase  31.12 
 
 
387 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4658  glutathionylspermidine synthase  31.3 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.46187 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1219  glutathionylspermidine synthase  27.54 
 
 
387 aa  109  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02190  synthetase/amidase  30.2 
 
 
388 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3780  glutathionylspermidine synthase family protein  29.22 
 
 
385 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6550  putative glutathionylspermidine synthase family protein  29.36 
 
 
386 aa  107  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.544489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01335  putative glutathionylspermidine synthase  27.55 
 
 
385 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.971977  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4716  glutathionylspermidine synthase domain protein  25.98 
 
 
352 aa  104  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1235  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  25.6 
 
 
629 aa  99.8  9e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.114299 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2757  glutathionylspermidine synthase  29.59 
 
 
412 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3723  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  26.15 
 
 
642 aa  96.7  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4300  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.93 
 
 
619 aa  90.1  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0708  Glutathionylspermidine amidase  24.93 
 
 
619 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3455  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.93 
 
 
619 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0705  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.93 
 
 
619 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3274  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.93 
 
 
619 aa  90.1  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3415  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.93 
 
 
619 aa  90.1  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3393  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.1 
 
 
620 aa  89.4  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3392  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.25 
 
 
618 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.560331  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3386  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.25 
 
 
618 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.696441 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3321  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.25 
 
 
618 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0646215  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3312  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.25 
 
 
618 aa  89.4  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193053  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3486  bifunctional glutathionylspermidine amidase/glutathionylspermidine synthetase  24.25 
 
 
618 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>