290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3037 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3037  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 736 aa  1519    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.117014 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6744  TonB-dependent receptor  54.61 
 
 		 731 aa  826    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4665  TonB-dependent receptor  57.88 
 
 		 739 aa  847    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.785854 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6883  TonB-dependent receptor  38.21 
 
 		 821 aa  532  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1328  TonB-dependent receptor  33.57 
 
 		 798 aa  405  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0322179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4532  TonB-dependent receptor  31.56 
 
 		 813 aa  385  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.885203  normal  0.799433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08506  outer membrane receptor protein  32.44 
 
 		 846 aa  355  2e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0312  iron(III) dicitrate transport protein, outer membrane receptor  31.62 
 
 		 807 aa  348  2e-94  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.670307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  23 
 
 		 710 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3851  TonB-dependent siderophore receptor  22.71 
 
 		 711 aa  118  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3231  TonB-dependent siderophore receptor  22.46 
 
 		 687 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.854124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  23.71 
 
 		 675 aa  114  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1512  TonB-dependent receptor  24.57 
 
 		 782 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.116652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0923  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 777 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  24.55 
 
 		 703 aa  110  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  24.82 
 
 		 696 aa  110  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.25 
 
 		 704 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1207  iron(III) dicitrate transport protein fecA  23.41 
 
 		 782 aa  107  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1038  TonB-dependent siderophore receptor  23.41 
 
 		 782 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  24.51 
 
 		 717 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4596  TonB-dependent siderophore receptor  23.49 
 
 		 774 aa  103  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0865  TonB-dependent receptor  22.26 
 
 		 700 aa  101  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0848071  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4613  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.34 
 
 		 774 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  22.09 
 
 		 713 aa  100  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13430  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  22.64 
 
 		 784 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5806  ferric citrate outer membrane transporter  23.63 
 
 		 731 aa  95.1  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1204  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  23.08 
 
 		 784 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.814963  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02035  outer membrane iron(III) dicitrate receptor  23.77 
 
 		 705 aa  94  8e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3090  ferric vibrioferrin receptor  23.55 
 
 		 690 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0290295  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4646  TonB-dependent siderophore receptor  21.98 
 
 		 708 aa  92.4  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001068  vibrioferrin receptor PvuA  23.95 
 
 		 712 aa  87.8  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47190  Fe(III) dicitrate transport protein FecA  19.83 
 
 		 784 aa  87.8  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0897  TonB-dependent siderophore receptor  22.79 
 
 		 809 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448435  normal  0.28892 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3142  TonB-dependent siderophore receptor  22.65 
 
 		 688 aa  87.4  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0867  FecA-like outer membrane receptor  22.79 
 
 		 809 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.272294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0911  TonB-dependent siderophore receptor  22.94 
 
 		 809 aa  87.4  9e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11228 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1280  TonB-dependent siderophore receptor  23.68 
 
 		 731 aa  87  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0800812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 721 aa  85.5  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0743  TonB-dependent siderophore receptor  21.9 
 
 		 774 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.689224  normal  0.515767 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4868  iron(III) dicitrate transport protein FecA  21.59 
 
 		 774 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04157  ferric citrate outer membrane transporter  21.59 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3709  TonB-dependent siderophore receptor  21.9 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0483354  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  31.67 
 
 		 720 aa  82.8  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04120  hypothetical protein  21.59 
 
 		 774 aa  83.2  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  22.55 
 
 		 721 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2308  TonB-dependent siderophore receptor  21.23 
 
 		 693 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00270239  normal  0.034674 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  23.53 
 
 		 809 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2704  TonB-dependent receptor  21.82 
 
 		 700 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0445  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 734 aa  80.1  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000342866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3784  TonB-dependent siderophore receptor  22.21 
 
 		 807 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1657  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 715 aa  76.6  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.818594 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  22.11 
 
 		 726 aa  75.9  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1382  TonB-dependent receptor  23.56 
 
 		 717 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.530841  hitchhiker  0.000808374 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  21.71 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  22.73 
 
 		 726 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  19.03 
 
 		 762 aa  71.2  0.00000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  23.14 
 
 		 799 aa  70.1  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  29.68 
 
 		 723 aa  69.7  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2724  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.424768 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  22.41 
 
 		 678 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1377  TonB-dependent receptor  23.01 
 
 		 713 aa  67.8  0.0000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.632054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  20.71 
 
 		 733 aa  65.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  21.4 
 
 		 727 aa  65.1  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1028  TonB-dependent receptor  21.37 
 
 		 769 aa  64.3  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.952547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0818  TonB-dependent receptor, plug  35.48 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000136965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  22.99 
 
 		 706 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  22.75 
 
 		 688 aa  62.8  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  22.47 
 
 		 696 aa  62.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  21.85 
 
 		 859 aa  62.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  20.38 
 
 		 726 aa  62.4  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  22.99 
 
 		 721 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  22.8 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  22.8 
 
 		 706 aa  61.6  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2386  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 742 aa  60.8  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000185534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  22.07 
 
 		 696 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3922  TonB-dependent siderophore receptor  20.29 
 
 		 709 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000715438  normal  0.0397715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  23.64 
 
 		 812 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4743  TonB-dependent receptor, putative  19.97 
 
 		 690 aa  59.7  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  21.26 
 
 		 698 aa  59.3  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4363  TonB-dependent siderophore receptor  20.85 
 
 		 706 aa  60.1  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000323777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 681 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  22.61 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2458  TonB-dependent siderophore receptor  23.3 
 
 		 742 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4362  TonB-dependent siderophore receptor  20.68 
 
 		 706 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000023504  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3953  TonB-dependent siderophore receptor  21.28 
 
 		 701 aa  59.3  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000731032  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  21.34 
 
 		 714 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4307  TonB-dependent siderophore receptor  20.42 
 
 		 706 aa  57.8  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000234699  hitchhiker  0.000000000225287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0732  TonB-dependent receptor  22.88 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.244967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  21.49 
 
 		 862 aa  57.4  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  21.47 
 
 		 700 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  22.43 
 
 		 678 aa  57.8  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4042  TonB-dependent siderophore receptor  20.26 
 
 		 697 aa  57.8  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.296308  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 729 aa  57.4  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4127  TonB-dependent siderophore receptor  20.03 
 
 		 702 aa  57  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00050238  normal  0.542591 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2565  TonB-dependent siderophore receptor  25.95 
 
 		 740 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000192113  hitchhiker  0.000234826 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  22.35 
 
 		 793 aa  57.4  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1724  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000700289  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 753 aa  56.6  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1767  TonB-dependent siderophore receptor  35.11 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000312172  normal  0.573538 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6067  TonB-dependent receptor  20.85 
 
 		 716 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>