81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3005 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 144 aa  282  9e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0880  hypothetical protein  29.2 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0306317  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  36.49 
 
 		 147 aa  70.1  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0931  protein of unknown function DUF107  28.47 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.890886  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0928  protein of unknown function DUF107  27.74 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  27.78 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  30 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.41 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  31.91 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3072  hypothetical protein  30 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0660116  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  35.57 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  32.62 
 
 		 155 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  31.91 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.29 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  27.86 
 
 		 159 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  30.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1846  hypothetical protein  31.94 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204323  normal  0.0132683 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  31.47 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  32.84 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  32.12 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.41 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  30.94 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  30 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0934  hypothetical protein  32.48 
 
 		 139 aa  50.8  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.31168 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  27.14 
 
 		 153 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  27.08 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  31.39 
 
 		 144 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  32.17 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  28.08 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  31.16 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  29.53 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  32.03 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  25.9 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  28.77 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  25.17 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  27.41 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  27.52 
 
 		 153 aa  47.8  0.00005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  26.21 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  31.58 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  30.28 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  24.29 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  24.29 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  28.26 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  27.41 
 
 		 143 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  26.67 
 
 		 145 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1227  protein of unknown function DUF107  26.67 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  33.82 
 
 		 458 aa  45.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  27.66 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  27.66 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  30.23 
 
 		 146 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  24.29 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  27.41 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  26.12 
 
 		 136 aa  44.3  0.0006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  29.14 
 
 		 153 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  24.29 
 
 		 142 aa  43.5  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  29.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  26.76 
 
 		 150 aa  42.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1879  hypothetical protein  26.57 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0165803  normal  0.0358717 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  23.57 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  30.82 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  28.17 
 
 		 147 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  29.32 
 
 		 144 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  24.29 
 
 		 154 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  31.85 
 
 		 150 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  28.66 
 
 		 437 aa  42  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  22.86 
 
 		 142 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  23.81 
 
 		 158 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  28.1 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1951  hypothetical protein  28.99 
 
 		 154 aa  40.8  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.370736  normal  0.0226545 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0563  hypothetical protein  33.6 
 
 		 156 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.308854  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5311  hypothetical protein  30.51 
 
 		 144 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.03679  normal  0.249552 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>