More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3004 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3004  band 7 protein  100 
 
 		 303 aa  608  1e-173  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0935  band 7 protein  65.34 
 
 		 333 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21928 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0929  band 7 protein  63.9 
 
 		 336 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0932  band 7 protein  63.54 
 
 		 336 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0881  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  63.54 
 
 		 336 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0216067  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2436  band 7 protein  56.31 
 
 		 310 aa  363  2e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177964  normal  0.0711842 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  55.41 
 
 		 311 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  55.41 
 
 		 311 aa  362  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1701  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.16 
 
 		 310 aa  361  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1319  band 7 protein  58.25 
 
 		 310 aa  354  1e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.19 
 
 		 315 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  55.93 
 
 		 317 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.41 
 
 		 311 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6077  band 7 protein  55.07 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2020  band 7 protein  55.07 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2000  band 7 protein  55.07 
 
 		 311 aa  349  4e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.882585  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1300  band 7 protein  55.41 
 
 		 308 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1455  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.67 
 
 		 312 aa  348  7e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.362022 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.52 
 
 		 315 aa  347  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1188  band 7 protein  53.69 
 
 		 310 aa  345  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.283944  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1423  putative transmembrane protein  55.56 
 
 		 308 aa  345  7e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.169777  decreased coverage  0.00134863 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1364  band 7 protein  54.03 
 
 		 309 aa  345  7e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.216615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.72 
 
 		 303 aa  343  2e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1862  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.38 
 
 		 309 aa  338  4e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  53.69 
 
 		 305 aa  338  9e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.54 
 
 		 304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  53.38 
 
 		 303 aa  334  1e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1927  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.33 
 
 		 305 aa  333  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0105311 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2962  band 7 protein  54.77 
 
 		 305 aa  332  4e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2124  band 7 protein  51.53 
 
 		 303 aa  331  9e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.10084  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1055  band 7 protein  53.9 
 
 		 312 aa  328  7e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2456  band 7 protein  52.67 
 
 		 312 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0666686  normal  0.94983 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2834  SPFH/Band 7 domain protein  52.67 
 
 		 312 aa  328  9e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3500  band 7 protein  53.31 
 
 		 306 aa  328  9e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.674011  normal  0.0455255 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0051  band 7 protein  54.92 
 
 		 317 aa  326  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2254  band 7 protein  53.85 
 
 		 304 aa  322  5e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2764  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.85 
 
 		 304 aa  322  5e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.146948  normal  0.716722 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77854  stomatin family protein  51.43 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2736  band 7 protein  55.12 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50 
 
 		 316 aa  306  3e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1845  band 7 protein  51.6 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.752422  normal  0.0149368 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3399  band 7 protein  49.65 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0705  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.06 
 
 		 309 aa  296  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00195694  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3386  band 7 protein  47.02 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0131502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  51.42 
 
 		 311 aa  295  5e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0547  band 7 protein  48.6 
 
 		 314 aa  295  7e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0101124  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01287  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G09780)  50.52 
 
 		 427 aa  294  1e-78  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.348085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4128  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.25 
 
 		 311 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3501  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.6 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.136246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0451  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.6 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.024387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3676  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.6 
 
 		 310 aa  294  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.294698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3070  band 7 protein  47.77 
 
 		 315 aa  293  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.358492  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0471  band 7 protein  47.9 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0882327  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0492  band 7 protein  47.9 
 
 		 312 aa  292  4e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0661891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0495  band 7 protein  47.9 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0687258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3848  band 7 protein  47.9 
 
 		 312 aa  291  7e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.194904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0465  band 7 protein  47.33 
 
 		 311 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.163647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4505  band 7 protein  48.4 
 
 		 310 aa  290  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0455266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0464  band 7 protein  45.45 
 
 		 315 aa  289  3e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0464  band 7 protein  46.58 
 
 		 312 aa  289  4e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0416  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.19 
 
 		 310 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00860785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3387  band 7 protein  44.76 
 
 		 308 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000435032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4506  band 7 protein  44.76 
 
 		 310 aa  285  5e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.145449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0463  band 7 protein  48.12 
 
 		 309 aa  284  1.0000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0546  band 7 protein  44.52 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000115645  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0198  band 7 protein  51.06 
 
 		 318 aa  281  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3677  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.52 
 
 		 311 aa  280  2e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00253892  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4129  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.17 
 
 		 311 aa  279  3e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3502  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.52 
 
 		 311 aa  279  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000309206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0450  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.52 
 
 		 311 aa  279  4e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000868784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0470  band 7 protein  43.11 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000506406  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0491  band 7 protein  43.11 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000139691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3849  band 7 protein  43.11 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.11304  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0494  band 7 protein  43.11 
 
 		 311 aa  276  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00223241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  44.64 
 
 		 314 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0704  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.91 
 
 		 305 aa  269  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0473975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3400  band 7 protein  42.55 
 
 		 309 aa  268  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0415  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.71 
 
 		 304 aa  264  1e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00776532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  40 
 
 		 319 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4837  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.71 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  43.75 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  42.01 
 
 		 304 aa  224  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  41.73 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  41.73 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.78 
 
 		 309 aa  219  5e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  41.78 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  42.86 
 
 		 319 aa  218  8.999999999999998e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17332  predicted protein  38.83 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0626089  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  39.07 
 
 		 322 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0531  band 7 protein  37.82 
 
 		 317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.768423 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  41.06 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  41.46 
 
 		 312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.49 
 
 		 359 aa  212  7e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1890  stomatin-like protein  38.74 
 
 		 322 aa  211  7.999999999999999e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>