More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2993 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2993  phosphatidate cytidylyltransferase  100 
 
 		 277 aa  553  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2395  phosphatidate cytidylyltransferase  68.95 
 
 		 277 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.4695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0793  hypothetical protein  47.01 
 
 		 712 aa  236  2e-61  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0551425 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0020  phosphatidate cytidylyltransferase  39.41 
 
 		 269 aa  189  4e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  37.23 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  33.58 
 
 		 271 aa  126  3e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000011055  unclonable  2.72637e-19 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  32.16 
 
 		 280 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2470  phosphatidate cytidylyltransferase  33.09 
 
 		 310 aa  122  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  34.47 
 
 		 267 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  43.7 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.85 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1039  phosphatidate cytidylyltransferase  32.09 
 
 		 262 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00281126  unclonable  0.0000000116593 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  36.78 
 
 		 265 aa  116  3.9999999999999997e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0360  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 281 aa  115  5e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.73669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0395  phosphatidate cytidylyltransferase  32.25 
 
 		 277 aa  115  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0393623  normal  0.704946 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  34.63 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  32.85 
 
 		 263 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0391  phosphatidate cytidylyltransferase  32.96 
 
 		 273 aa  112  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  43.8 
 
 		 265 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1418  phosphatidate cytidylyltransferase  30.59 
 
 		 307 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0668201 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1440  phosphatidate cytidylyltransferase  34.26 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000100946 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0543  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1198  phosphatidate cytidylyltransferase  34.63 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.126624  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0408  CDP-diglyceride synthetase  31.35 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0103813  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  50.47 
 
 		 281 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  52.73 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1434  phosphatidate cytidylyltransferase  32.43 
 
 		 261 aa  109  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.306574  normal  0.0427583 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  33.79 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1125  phosphatidate cytidylyltransferase  46.85 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  40.84 
 
 		 281 aa  108  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 284 aa  108  8.000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1946  phosphatidate cytidylyltransferase  38.33 
 
 		 266 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2917  phosphatidate cytidylyltransferase  30.5 
 
 		 268 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10160  CDP-diglyceride synthetase  30.43 
 
 		 301 aa  108  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0686  CDP-diglyceride synthetase  27.92 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.047403  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  39.51 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  51.85 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07710  phosphatidate cytidylyltransferase  30.83 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.726155  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0293  phosphatidate cytidylyltransferase  32.1 
 
 		 273 aa  107  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.111927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1470  phosphatidate cytidylyltransferase  32.63 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.402403  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  39.33 
 
 		 281 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10900  CDP-diglyceride synthetase  30.96 
 
 		 303 aa  106  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.176404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  45.38 
 
 		 290 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0934  phosphatidate cytidylyltransferase  37.08 
 
 		 277 aa  106  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1788  phosphatidate cytidylyltransferase  30.74 
 
 		 271 aa  105  6e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00193933 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  30.47 
 
 		 283 aa  105  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  30.04 
 
 		 278 aa  105  6e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.75 
 
 		 264 aa  105  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  33.81 
 
 		 281 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  38.55 
 
 		 264 aa  104  1e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1283  phosphatidate cytidylyltransferase  29.71 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0776695  normal  0.172321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1539  phosphatidate cytidylyltransferase  29.56 
 
 		 271 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  37.82 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1277  phosphatidate cytidylyltransferase  48.41 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.159257  normal  0.533898 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1254  phosphatidate cytidylyltransferase  42.66 
 
 		 287 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.711345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.36 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  43.1 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  46.9 
 
 		 296 aa  103  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4122  phosphatidate cytidylyltransferase  51.38 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  31.39 
 
 		 263 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  48.72 
 
 		 280 aa  103  4e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0269  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.06 
 
 		 211 aa  103  4e-21  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0871132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  34.25 
 
 		 296 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1291  phosphatidate cytidylyltransferase  31.16 
 
 		 293 aa  103  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.180543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  31.14 
 
 		 272 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0719671  normal  0.74343 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002751  phosphatidate cytidylyltransferase  44 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.157639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1348  phosphatidate cytidylyltransferase  30.48 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0661268  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  42.62 
 
 		 284 aa  102  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 267 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  33.33 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  47.17 
 
 		 276 aa  102  7e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1515  phosphatidate cytidylyltransferase  38.51 
 
 		 271 aa  102  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  29.39 
 
 		 264 aa  102  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1922  phosphatidate cytidylyltransferase  30.99 
 
 		 276 aa  102  9e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2592  phosphatidate cytidylyltransferase  30.55 
 
 		 274 aa  101  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.1112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0533  CDP-diglyceride synthase  29.93 
 
 		 284 aa  102  1e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.117905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1403  phosphatidate cytidylyltransferase  36.81 
 
 		 254 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.589617  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  28.83 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1876  phosphatidate cytidylyltransferase  32.41 
 
 		 273 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1106  phosphatidate cytidylyltransferase  41.73 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  28.83 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0618  phosphatidate cytidylyltransferase  34.42 
 
 		 281 aa  100  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  28.83 
 
 		 282 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  37.58 
 
 		 302 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4077  phosphatidate cytidylyltransferase  32.12 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.181588 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1972  phosphatidate cytidylyltransferase  30.34 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3863  phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3869  phosphatidate cytidylyltransferase  30.66 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  29.09 
 
 		 270 aa  99.4  5e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1916  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.05 
 
 		 236 aa  99.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000155473  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  32.07 
 
 		 343 aa  99.4  6e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  49.14 
 
 		 297 aa  99.4  6e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03232  phosphatidate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 280 aa  99.4  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  50.48 
 
 		 308 aa  99.4  6e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  34.42 
 
 		 216 aa  99  7e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  30.3 
 
 		 260 aa  99  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1525  phosphatidate cytidylyltransferase  36.61 
 
 		 276 aa  99  7e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0283302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>