More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2953 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2953  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 372 aa  769    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0857  glycosyl transferase group 1  43.55 
 
 		 378 aa  319  5e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0168119 
 
 
-
 
NC_002950  PG0129  mannosyltransferase  42.25 
 
 		 374 aa  302  5.000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00122575 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0978  glycosyl transferase group 1  40.32 
 
 		 378 aa  302  7.000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.625979  hitchhiker  0.00043945 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5959  glycosyl transferase group 1  38.56 
 
 		 376 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519919  normal  0.10834 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0625  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 372 aa  269  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2511  glycosyl transferase group 1  39.14 
 
 		 376 aa  251  2e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.093555  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2129  glycosyl transferase, group 1  37.55 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.819184  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1558  glycosyl transferase group 1  27.81 
 
 		 374 aa  169  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.899676  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  31.2 
 
 		 408 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  28.83 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1652  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 382 aa  162  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1492  glycosyl transferase, group 1  33.11 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3800  glycosyl transferase, group 1  28.13 
 
 		 386 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0239  glycosyl transferase group 1  32.99 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.836427 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3369  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 		 417 aa  157  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4137  glycosyl transferase group 1  35.4 
 
 		 431 aa  156  6e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0464  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 394 aa  156  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4604  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 371 aa  155  8e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000112819  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0139  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00161479 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4314  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0529  mannosyltransferase, putative  30.71 
 
 		 372 aa  149  5e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.142302  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0533  putative mannosyltransferase  30.89 
 
 		 372 aa  149  8e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1530  glycosyl transferase group 1  28.18 
 
 		 393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 371 aa  146  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2483  mannosyltransferase B  26.36 
 
 		 375 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0534516  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3332  glycosyl transferase, group 1  29.87 
 
 		 370 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.231973 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1265  glycosyl transferase, group 1  26.8 
 
 		 376 aa  144  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2193  glycosyltransferase  26.17 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00106475  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3778  glycosyl transferase, group 1  32.86 
 
 		 382 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.729941  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4385  glycosyl transferase group 1  26.51 
 
 		 378 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.610092  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0732  glycosyl transferase, group 1  30.07 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4438  glycosyl transferase group 1  29.43 
 
 		 381 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 		 366 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0928  a-glycosyltransferase  25.14 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110486 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2130  glycosyl transferase, group 1  31.25 
 
 		 370 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.799297  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  29.68 
 
 		 389 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3359  glycosyl transferase group 1  31.48 
 
 		 434 aa  132  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0936  glycosyl transferase, group 1  27.4 
 
 		 382 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.22828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3860  glycosyl transferase, group 1  28.48 
 
 		 442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.185874 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5201  group 1 glycosyl transferase  29.9 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.131899  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4383  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 535 aa  130  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.315819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 369 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  27.63 
 
 		 381 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0741  glycosyl transferase group 1  30.57 
 
 		 435 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0084  glycosyl transferase group 1  34.1 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.248022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0081  mannosyltransferase  34.1 
 
 		 346 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.54497  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0853  glycosyl transferase group 1  29.44 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3799  glycosyl transferase, group 1  28.28 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2316  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0752  glycosyl transferase, group 1  29.77 
 
 		 423 aa  127  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0456  glycosyl transferase group 1  29.57 
 
 		 366 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2367  glycosyl transferase group 1  27.9 
 
 		 387 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1385  glycosyl transferase group 1  26.25 
 
 		 398 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0289  glycosyl transferase group 1  28.28 
 
 		 378 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4162  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3312  glycosyl transferase group 1  28.65 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4204  glycosyl transferase, group 1  28.65 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.369966 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2838  glycosyl transferase group 1  31 
 
 		 373 aa  126  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.326547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0016  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 361 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  29.74 
 
 		 384 aa  125  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1956  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.2 
 
 		 384 aa  124  2e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0017  glycosyl transferase group 1  29.59 
 
 		 377 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4936  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 		 443 aa  124  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3522  glycosyl transferase group 1  27.78 
 
 		 385 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.828408  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1801  glycosyl transferase WbpY  29.97 
 
 		 380 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0707089 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3360  glycosyl transferase, group 1  30.22 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.730903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2167  mannosyltransferase B  30.34 
 
 		 381 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2365  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 364 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.230735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2150  glycosyl transferase, group 1  27.85 
 
 		 397 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0476  glycosyl transferase group 1  26.9 
 
 		 361 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1969  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 		 372 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0690  glycosyl transferase, group 1  30.11 
 
 		 394 aa  122  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0494  glycosyl transferase group 1  30.63 
 
 		 398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0774  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.86 
 
 		 361 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2011  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1380  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3732  glycosyl transferase group 1  27.79 
 
 		 371 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.566846  normal  0.583868 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2313  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 364 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2764  glycosyl transferase, group 1  29.07 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1156  glycosyl transferase group 1  28.94 
 
 		 371 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.242648  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2361  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 377 aa  119  7e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0208064 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2028  glycosyltransferase  32.58 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.949426  normal  0.904409 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3278  glycosyl transferase group 1  26.11 
 
 		 850 aa  119  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0049  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2078  glycosyl transferase group 1  30.77 
 
 		 464 aa  119  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.382452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0051  glycosyl transferase group 1  30.96 
 
 		 366 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  30.22 
 
 		 357 aa  117  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0273  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 420 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1681  glycosyl transferase group 1  31.56 
 
 		 366 aa  117  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.082633  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1702  glycosyl transferase, group 1  26.89 
 
 		 360 aa  116  6e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0663  glycosyl transferase group 1  29.03 
 
 		 433 aa  116  7.999999999999999e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  decreased coverage  0.002459  normal  0.0324915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0722  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 524 aa  115  7.999999999999999e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.799351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5204  group 1 glycosyl transferase  26.21 
 
 		 364 aa  116  7.999999999999999e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3121  glycosyl transferase, group 1  25.52 
 
 		 383 aa  115  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000483528  unclonable  0.0000199281 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  29.1 
 
 		 1261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>