More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2930 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2930  Carbonate dehydratase  100 
 
 
215 aa  448  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4763  carbonate dehydratase  59.72 
 
 
211 aa  286  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755783  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0643  Carbonate dehydratase  60.89 
 
 
223 aa  267  1e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1859  carbonate dehydratase  58.16 
 
 
203 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0117896  unclonable  0.00000151742 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2421  carbonate dehydratase  56.1 
 
 
204 aa  255  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.658807  decreased coverage  0.000000897123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2124  carbonate dehydratase  58.55 
 
 
201 aa  254  7e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0724956  hitchhiker  0.000201034 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1854  carbonate dehydratase  58.55 
 
 
201 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00119541  decreased coverage  0.000000000969176 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2474  carbonic anhydrase family protein  58.55 
 
 
201 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1988  carbonate dehydratase  57.07 
 
 
204 aa  250  1e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.510163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2185  carbonate dehydratase  54.68 
 
 
203 aa  249  3e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000305693  hitchhiker  0.00975716 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1909  carbonic anhydrase  56.99 
 
 
201 aa  248  4e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0250293  hitchhiker  0.00000107461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1642  carbonate dehydratase  56.41 
 
 
203 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00101631  normal  0.513692 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3483  carbonic anhydrase  56.84 
 
 
199 aa  248  5e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.343954  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1987  Carbonate dehydratase  57.07 
 
 
205 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000142238  hitchhiker  0.00000000100823 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2360  carbonate dehydratase  57.07 
 
 
205 aa  245  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000972016  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1762  carbonate dehydratase  57.07 
 
 
204 aa  245  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00095735  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1754  carbonate dehydratase  54 
 
 
210 aa  245  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1369  Carbonate dehydratase  54.59 
 
 
206 aa  244  9e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.683056 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2372  carbonate dehydratase  56.54 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000458003  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2126  carbonate dehydratase  55.96 
 
 
205 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.101359  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2475  carbonate dehydratase  56.54 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000508683  hitchhiker  0.00965957 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1811  carbonate dehydratase  55.38 
 
 
201 aa  239  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00306121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1023  carbonic anhydrase  50.95 
 
 
213 aa  237  8e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.76145  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2596  Carbonate dehydratase  51.98 
 
 
220 aa  237  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4077  Carbonate dehydratase  48.13 
 
 
215 aa  235  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0118  putative carbonic anhydrase  51.2 
 
 
222 aa  235  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3997  carbonate dehydratase  50.72 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4665  Carbonate dehydratase  53.88 
 
 
209 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4773  carbonic anhydrase  50.5 
 
 
214 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.115077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5382  putative carbonic anhydrase  49.75 
 
 
215 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61860  putative carbonic anhydrase  49.75 
 
 
215 aa  231  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0165234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2828  carbonic anhydrase  49.05 
 
 
212 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.63838  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03457  carbonic anhydrase  53.43 
 
 
222 aa  231  8.000000000000001e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002555  carbonic anhydrase  50.48 
 
 
222 aa  230  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.997557  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0859  carbonate dehydratase  50.99 
 
 
212 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0134  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  229  2e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00124  hypothetical protein  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00125  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3476  Carbonate dehydratase  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0136  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0994  carbonic anhydrase  50.99 
 
 
212 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0530644  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0130  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.79719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0128  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3533  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  229  3e-59  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3123  carbonic anhydrase  50.49 
 
 
213 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1155  carbonic anhydrase  50.49 
 
 
213 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.364048  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0119  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
220 aa  228  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3478  carbonate dehydratase  46.51 
 
 
291 aa  228  8e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1018  carbonic anhydrase  46.51 
 
 
310 aa  228  8e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3350  carbonic anhydrase  46.73 
 
 
220 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00775691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1041  carbonate dehydratase (carbonic anhydrase)  50 
 
 
212 aa  227  1e-58  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.151449  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0840  carbonic anhydrase  48.36 
 
 
230 aa  227  1e-58  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0252218  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0788  carbonic anhydrase  48.77 
 
 
219 aa  226  2e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.969871  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0390  carbonate dehydratase  50.99 
 
 
209 aa  225  3e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.286988  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0674  carbonic anhydrase  49.75 
 
 
220 aa  225  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2616  carbonic anhydrase 2  54.5 
 
 
219 aa  225  3e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0186  carbonic anhydrase  50.26 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.316931  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0203  carbonic anhydrase  50.26 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0190  carbonic anhydrase  50.26 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.483566 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0195  carbonic anhydrase  50.26 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1746  Carbonate dehydratase  47.66 
 
 
221 aa  225  5.0000000000000005e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0187  carbonic anhydrase  50.26 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13235  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1903  carbonate dehydratase  45.21 
 
 
220 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2395  dihydroorotase homodimeric type  48.51 
 
 
209 aa  224  6e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.316907  normal  0.063783 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1969  carbonate dehydratase  44.75 
 
 
220 aa  224  8e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.8834  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2858  carbonate dehydratase  48.19 
 
 
207 aa  223  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2171  Carbonate dehydratase  50.26 
 
 
200 aa  223  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.485129  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4260  carbonate dehydratase  51.87 
 
 
196 aa  223  1e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0105  carbonic anhydrase  50.75 
 
 
223 aa  223  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2421  carbonate dehydratase  48.51 
 
 
210 aa  221  4e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.011546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5764  carbonic anhydrase  47.67 
 
 
219 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.625741  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0277  carbonic anhydrase protein  48 
 
 
226 aa  220  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101994  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2056  carbonate dehydratase  48.56 
 
 
213 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.106365  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0456  carbonate dehydratase  47.6 
 
 
219 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.162063  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3056  Carbonate dehydratase  48.44 
 
 
220 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0137  carbonate dehydratase  49.25 
 
 
223 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0127  Carbonate dehydratase  48.5 
 
 
226 aa  219  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0378  carbonate dehydratase  46.8 
 
 
261 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  normal  0.578171 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3778  carbonate dehydratase  48.44 
 
 
220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0135  Carbonate dehydratase  48.5 
 
 
226 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2839  carbonate dehydratase  46.8 
 
 
256 aa  218  5e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.66431 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0731  Carbonate dehydratase  47.69 
 
 
380 aa  218  7.999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4734  Carbonate dehydratase  43.54 
 
 
255 aa  217  8.999999999999998e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0099  GCN5-related N-acetyltransferase:carbonic anhydrase  48.5 
 
 
387 aa  216  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.609712  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1874  Carbonate dehydratase  43.9 
 
 
217 aa  216  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.754664 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2927  carbonate dehydratase  46.31 
 
 
255 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2942  carbonate dehydratase  46.31 
 
 
255 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.908215 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2313  carbonate dehydratase  46.31 
 
 
255 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0397  carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0095  beta carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3086  beta carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0580  carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2278  beta carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0418  putative carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2030  carbonate dehydratase  48.69 
 
 
221 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.177526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2009  beta carbonic anhydrase  46.31 
 
 
256 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2976  carbonate dehydratase  46.31 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1332  carbonate dehydratase  46.15 
 
 
223 aa  215  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.547264  hitchhiker  0.0031824 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6270  carbonate dehydratase  46.04 
 
 
255 aa  215  4e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4254  putative carbonic anhydrase  47.29 
 
 
258 aa  214  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.22351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>