More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2923 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2923  Rhodanese domain protein  100 
 
 		 99 aa  195  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.669081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0296  Rhodanese domain protein  68.42 
 
 		 97 aa  137  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5944  Rhodanese domain protein  51.04 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0969772 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  53.68 
 
 		 392 aa  106  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.04 
 
 		 375 aa  100  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.96 
 
 		 395 aa  95.5  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2634  NADH oxidase/rhodanese-related sulfurtransferase  45.83 
 
 		 105 aa  90.9  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0095  Rhodanese domain protein  46.46 
 
 		 106 aa  85.1  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.819142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0428  Rhodanese domain protein  45.36 
 
 		 116 aa  84.3  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000514418  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.9 
 
 		 386 aa  83.6  8e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  47.87 
 
 		 113 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1246  Rhodanese domain protein  44.68 
 
 		 130 aa  80.5  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000851542  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.81 
 
 		 392 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2891  Rhodanese domain protein  48.39 
 
 		 98 aa  77.4  0.00000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1502  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 		 113 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.184229  normal  0.558017 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  43.01 
 
 		 145 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0151  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0364235  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2763  Rhodanese domain protein  47.87 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0148242  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.16 
 
 		 387 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1149  Rhodanese domain protein  41.67 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000462843  hitchhiker  0.00000263083 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.01 
 
 		 390 aa  73.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  42.42 
 
 		 379 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.58 
 
 		 383 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3760  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.68 
 
 		 393 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.62685  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.67 
 
 		 390 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4871  rhodanese-like domain-containing protein  45.16 
 
 		 101 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  44.33 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3913  rhodanese-like protein  42.31 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.103396  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  37.11 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2644  Rhodanese domain protein  39.36 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00713239  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4560  rhodanese domain-containing protein  45.16 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4479  rhodanese-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0848615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2696  rhodanese-like protein  45.56 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  43.01 
 
 		 390 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4865  rhodanese-like domain protein  44.09 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.74 
 
 		 348 aa  71.2  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4626  rhodanese-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4461  rhodanese-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4981  rhodanese-like domain-containing protein  44.09 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4847  rhodanese-like domain protein  44.09 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3405  rhodanese domain-containing protein  42.55 
 
 		 101 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2864  rhodanese-like domain-containing protein  41.3 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2549  rhodanese-like domain-containing protein  41.3 
 
 		 109 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2737  rhodanese domain protein  39.25 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.367158  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0667  Rhodanese domain protein  44.68 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  43.33 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0563  Rhodanese domain protein  44.09 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000600861  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2254  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.62 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4841  rhodanese-like domain protein  44.09 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000626615  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.05 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1280  rhodanese-like protein  41.67 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.678095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  39.36 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  40.2 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0870  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 		 98 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0611  rhodanese-like protein  40.86 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  41.05 
 
 		 390 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  42.11 
 
 		 393 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0690  rhodanese domain-containing protein  43.62 
 
 		 98 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.623453  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2139  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.3 
 
 		 386 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000312689  normal  0.0185629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.95 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2851  Rhodanese domain-containing protein  37.5 
 
 		 220 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1649  hypothetical protein  36.79 
 
 		 173 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.616423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  36.17 
 
 		 150 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  37.5 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2023  Rhodanese domain protein  39.08 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0395  rhodanese-like domain protein  43.01 
 
 		 101 aa  67.4  0.00000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.109777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  39.39 
 
 		 393 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4247  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.63 
 
 		 386 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.020881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2892  Rhodanese domain protein  43.62 
 
 		 121 aa  67  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000724  phage shock protein E  42.71 
 
 		 116 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2536  rhodanese domain-containing protein  39.08 
 
 		 145 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2364  rhodanese-like domain protein  42.68 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1997  Rhodanese domain protein  42.68 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.885175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  42.86 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1981  rhodanese-like protein  38.78 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.726838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  38.95 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1132  rhodanese domain-containing protein  40.2 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.237662  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  43.01 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2399  rhodanese-like protein  43.75 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  40.51 
 
 		 345 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0564  Rhodanese domain protein  42.55 
 
 		 98 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000375905  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  35.48 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1456  hypothetical protein  37.08 
 
 		 379 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  37.11 
 
 		 459 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  33.33 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  43.21 
 
 		 277 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06606  hypothetical protein  44.44 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0713  rhodanese-like protein  36.54 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.082726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3458  Rhodanese domain protein  37.11 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  41.94 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.89 
 
 		 383 aa  64.7  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3510  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.48 
 
 		 395 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  36.17 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0794  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase/rhodanese domain-containing protein  39.78 
 
 		 558 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02700  Molybdopterin biosynthesis protein, MoeB  41.49 
 
 		 377 aa  64.3  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  38.95 
 
 		 460 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5122  Rhodanese domain protein  38 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.572476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  43.42 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2085  rhodanese domain-containing protein  34.78 
 
 		 194 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252289  normal  0.0462986 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1901  Rhodanese domain protein  37.38 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>