More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2852 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2852  Cof-like hydrolase  100 
 
 		 265 aa  547  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.592712  normal  0.107324 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0709  HAD family hydrolase  51.74 
 
 		 262 aa  280  2e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0719  HAD family hydrolase  51.35 
 
 		 262 aa  279  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00565065  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1549  Cof-like hydrolase  45.38 
 
 		 279 aa  248  5e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.678007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06933  hypothetical protein  42.59 
 
 		 265 aa  224  8e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000934  predicted hydrolase  42.59 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.330573  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3216  Cof-like hydrolase  39.25 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000076604  hitchhiker  0.00135645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2525  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.92 
 
 		 282 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3081  Cof-like hydrolase  35.36 
 
 		 283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.313968  hitchhiker  0.00000030315 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1574  Cof-like hydrolase  37.84 
 
 		 261 aa  193  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.34557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3309  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.04 
 
 		 281 aa  188  5.999999999999999e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0905  Cof-like hydrolase  35.11 
 
 		 263 aa  144  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000138509  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0393  Cof-like hydrolase  32.33 
 
 		 269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1335  Cof-like hydrolase  33.33 
 
 		 270 aa  129  7.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.136423 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1251  Cof-like hydrolase  30.8 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202118  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2405  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  27.91 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1377  HAD superfamily hydrolase  31.18 
 
 		 270 aa  123  4e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.110042  hitchhiker  0.00000000000523684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2526  sugar phosphatase SupH  29.55 
 
 		 271 aa  119  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0998065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1793  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  29.15 
 
 		 269 aa  118  9e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.324577  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00789  predicted hydrolase  29.55 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2820  Cof-like hydrolase  29.55 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0181531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00806  hypothetical protein  29.55 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2501  phosphatase YbjI  31.72 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0893  sugar phosphatase SupH  29.55 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.380533  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2798  Cof-like hydrolase  31.72 
 
 		 271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.373732  normal  0.741017 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00811  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2798  Cof-like hydrolase  31.72 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.260626  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0906  phosphatase YbjI  31.72 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.742575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0880  sugar phosphatase SupH  29.55 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0971  phosphatase YbjI  32.1 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0847  sugar phosphatase SupH  29.55 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0871  phosphatase YbjI  31.72 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.464954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0939  phosphatase YbjI  32.1 
 
 		 271 aa  116  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00828  hypothetical protein  31.72 
 
 		 271 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1878  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  28.96 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0971  sugar phosphatase SupH  29.55 
 
 		 271 aa  115  5e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.526488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2088  HAD superfamily hydrolase  30.26 
 
 		 269 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.656055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1000  phosphatase YbjI  31.34 
 
 		 271 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2822  Cof-like hydrolase  29.92 
 
 		 271 aa  115  8.999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1316  Cof-like hydrolase  30.3 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.293614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0903  phosphatase YbjI  30.97 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0062  HAD superfamily hydrolase  31.09 
 
 		 270 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1019  phosphatase YbjI  30.97 
 
 		 271 aa  112  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.130253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2600  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.20198  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2548  Cof-like hydrolase  27.78 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0286905  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2739  Cof-like hydrolase  27.31 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1105  HAD superfamily hydrolase  30.94 
 
 		 273 aa  109  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0916  phosphatase YbjI  31.72 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0883  sugar phosphatase SupH  29.17 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.815425  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0972  sugar phosphatase SupH  29.17 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.639249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0910  sugar phosphatase SupH  29.17 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0943  sugar phosphatase SupH  29.17 
 
 		 269 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0997  phosphatase YbjI  31.72 
 
 		 271 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.100252 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0993  sugar phosphatase SupH  29.17 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0053  Cof-like hydrolase  33.08 
 
 		 277 aa  107  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0228565  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  28.95 
 
 		 273 aa  105  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0158  Cof-like hydrolase  27.48 
 
 		 265 aa  104  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0511  HAD superfamily hydrolase  31.07 
 
 		 270 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.930094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0086  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 280 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0545  hydrolase  29.45 
 
 		 278 aa  102  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0140  Cof-like hydrolase  29.01 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3865  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 273 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1724  HAD superfamily hydrolase  30.74 
 
 		 265 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000483617  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0725  HAD superfamily hydrolase  29.32 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1111  HAD superfamily hydrolase  28.78 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.609626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  28.21 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0596  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0582  Cof-like hydrolase  25.98 
 
 		 289 aa  100  4e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.446766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2860  Cof protein  27.91 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.50585  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0229  Cof-like hydrolase  27.91 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0247  Cof-like hydrolase  27.91 
 
 		 274 aa  98.2  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3826  Cof-like hydrolase  27.35 
 
 		 273 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.503819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0339  phosphatase  29.3 
 
 		 269 aa  97.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0257026  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0173  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 277 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0156  Cof-like hydrolase  27.94 
 
 		 273 aa  96.3  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.937674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0160  Cof-like hydrolase  25.78 
 
 		 291 aa  95.5  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.53218  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2983  Cof-like hydrolase  27.88 
 
 		 273 aa  95.5  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.767906  hitchhiker  0.000000295074 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1874  Cof-like hydrolase  27.47 
 
 		 268 aa  95.5  8e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.70026  normal  0.0402588 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0205  HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 		 292 aa  94.7  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.855458  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3349  Cof protein/HAD-superfamily hydrolase  28.17 
 
 		 274 aa  95.1  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.616719 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0210  HAD superfamily hydrolase  25.71 
 
 		 319 aa  94  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0217  Cof-like hydrolase  31.92 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0271  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.71 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  31.37 
 
 		 270 aa  94.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0108  HAD family hydrolase  25.39 
 
 		 273 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.569654 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02386  hypothetical protein  32.21 
 
 		 268 aa  93.6  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5075  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.71 
 
 		 290 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0246  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.36 
 
 		 290 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1772  HAD superfamily hydrolase  27.99 
 
 		 272 aa  92.4  7e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0250  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  25.71 
 
 		 290 aa  92  8e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00158966  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0795  Cof-like hydrolase  28.57 
 
 		 269 aa  91.7  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1309  HAD family hydrolase  26.57 
 
 		 277 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0224  Cof-like hydrolase  26.28 
 
 		 290 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0214  HAD superfamily hydrolase  25.36 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0213  Cof-like hydrolase  24.64 
 
 		 319 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>