58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2831 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  100 
 
 		 605 aa  1243    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  35.39 
 
 		 619 aa  357  5e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  27.83 
 
 		 595 aa  209  2e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  25.98 
 
 		 587 aa  188  2e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  29.8 
 
 		 572 aa  182  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  27.09 
 
 		 575 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  26.36 
 
 		 588 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  23.58 
 
 		 649 aa  153  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.44 
 
 		 735 aa  85.5  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7227  TonB-dependent receptor plug  32.85 
 
 		 875 aa  76.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  25.85 
 
 		 1138 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  22.33 
 
 		 1177 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  27.57 
 
 		 1102 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  26.99 
 
 		 1106 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  24.76 
 
 		 1142 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  27.46 
 
 		 382 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  30.04 
 
 		 704 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  26.32 
 
 		 1165 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3693  TonB-dependent receptor plug  27.39 
 
 		 881 aa  56.2  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000588542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  20.29 
 
 		 1144 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5486  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 1147 aa  55.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.370163  normal  0.067232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  22.35 
 
 		 1164 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  24.57 
 
 		 386 aa  54.3  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  23.55 
 
 		 923 aa  53.9  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  32.1 
 
 		 1146 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  25.77 
 
 		 1122 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  26.03 
 
 		 1127 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.92 
 
 		 708 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  24.31 
 
 		 1237 aa  52  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 1090 aa  51.6  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  25.36 
 
 		 360 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  23.21 
 
 		 1129 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5278  TonB-dependent receptor plug  22.94 
 
 		 1163 aa  50.4  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.054683  normal  0.154876 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.94 
 
 		 704 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2451  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 1153 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.117099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  22.49 
 
 		 1179 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0356  TonB-dependent receptor plug  27.01 
 
 		 1128 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.36308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  22.77 
 
 		 1176 aa  48.1  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  23.57 
 
 		 1188 aa  47.8  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  22.22 
 
 		 1148 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  21.62 
 
 		 1096 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  21.11 
 
 		 1202 aa  47.4  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 		 1166 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  21.34 
 
 		 1103 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  21.05 
 
 		 1120 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2881  TonB-dependent receptor plug  22.63 
 
 		 1205 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  23.23 
 
 		 1152 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2854  TonB-dependent receptor plug  24.03 
 
 		 1138 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.958759  normal  0.16457 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  22.11 
 
 		 1128 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  25.27 
 
 		 1189 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  22.06 
 
 		 1230 aa  45.8  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0659  hypothetical protein  23.26 
 
 		 888 aa  44.7  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 		 1124 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  22.1 
 
 		 1087 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  30.67 
 
 		 1114 aa  44.3  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2768  TonB-dependent receptor plug  28 
 
 		 1067 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000113347 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  20.25 
 
 		 1150 aa  43.9  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  22.41 
 
 		 1155 aa  43.9  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>