203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2819 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2819  galactokinase  100 
 
 		 395 aa  816    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1466  galactokinase  52.62 
 
 		 388 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3026  galactokinase  48.66 
 
 		 389 aa  378  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1633  galactokinase  47.14 
 
 		 384 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1114  galactokinase  43.92 
 
 		 386 aa  338  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1701  galactokinase  43.35 
 
 		 398 aa  318  9e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.33248 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0490  galactokinase  41.96 
 
 		 414 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.027509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20660  galactokinase  40.71 
 
 		 404 aa  297  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0939  galactokinase  39.04 
 
 		 389 aa  291  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1087  galactokinase  40.69 
 
 		 387 aa  289  6e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3819  galactokinase  37.19 
 
 		 391 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.388206  normal  0.0156398 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2325  galactokinase  36.27 
 
 		 405 aa  279  7e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0536  galactokinase  39.69 
 
 		 396 aa  278  8e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0554  galactokinase  37.88 
 
 		 403 aa  273  3e-72  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3238  galactokinase  38.4 
 
 		 397 aa  272  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.217049  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0657  galactokinase  39.39 
 
 		 387 aa  270  2e-71  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2085  galactokinase  38.81 
 
 		 394 aa  269  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0609  galactokinase  38.74 
 
 		 387 aa  269  5.9999999999999995e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0700517  normal  0.0223386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1195  galactokinase  37 
 
 		 380 aa  268  1e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1516  galactokinase  39.95 
 
 		 385 aa  267  2.9999999999999995e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0969  galactokinase  38.22 
 
 		 392 aa  266  4e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.003784  normal  0.261209 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1552  galactokinase  39.12 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0578  galactokinase  38.11 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0998  galactokinase  34.44 
 
 		 391 aa  264  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1345  galactokinase  38.86 
 
 		 387 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.659508  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1097  galactokinase  39.83 
 
 		 385 aa  263  6e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0010459  normal  0.419761 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1628  galactokinase  38.78 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1562  galactokinase  38.78 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00232  galactokinase  39.02 
 
 		 379 aa  259  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.234167  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0355  galactokinase  41.93 
 
 		 389 aa  256  4e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1248  galactokinase  39.07 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0320  galactokinase  37.57 
 
 		 386 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1777  galactokinase  37.73 
 
 		 392 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0304  galactokinase  39.3 
 
 		 392 aa  252  7e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0647  galactokinase  37.18 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00202468  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0869  galactokinase  37.6 
 
 		 382 aa  249  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0780  galactokinase  37.37 
 
 		 382 aa  249  6e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2885  galactokinase  37.37 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0860  galactokinase  37.37 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048492  normal  0.889348 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0810  galactokinase  37.6 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2905  galactokinase  37.37 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.233357 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0784  galactokinase  37.37 
 
 		 382 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0901  galactokinase  37.6 
 
 		 382 aa  249  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0838  galactokinase  37.6 
 
 		 382 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0924  galactokinase  37.33 
 
 		 382 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2888  galactokinase  37.01 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1411  galactokinase  39.49 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2945  galactokinase  39.49 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0678  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2857  galactokinase  39.49 
 
 		 383 aa  247  3e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0811  galactokinase  37.11 
 
 		 382 aa  247  3e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1197  galactokinase  37.6 
 
 		 405 aa  246  4e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.765458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2387  galactokinase  40.69 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1291  galactokinase  38.27 
 
 		 383 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.68588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1073  galactokinase  37.28 
 
 		 385 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.848986  normal  0.026776 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3336  galactokinase  36.67 
 
 		 409 aa  245  8e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.325513  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7279  galactokinase  37.63 
 
 		 418 aa  245  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1313  galactokinase  38.52 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.20548  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4020  galactokinase  35.14 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000198069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3717  galactokinase  40.06 
 
 		 376 aa  240  2.9999999999999997e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0664685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2212  galactokinase  34.44 
 
 		 399 aa  239  5e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.180846  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3249  galactokinase  39.83 
 
 		 387 aa  239  5e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3271  galactokinase  35.64 
 
 		 388 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.6391  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0425  galactokinase  35.08 
 
 		 351 aa  239  5.999999999999999e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.64864  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2134  galactokinase  34.65 
 
 		 383 aa  235  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856123  normal  0.0763102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1171  galactokinase  37.06 
 
 		 383 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1322  galactokinase  38.16 
 
 		 396 aa  233  6e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2085  galactokinase  36.31 
 
 		 385 aa  231  1e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.351225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0415  galactokinase  36.39 
 
 		 355 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1768  galactokinase  37.43 
 
 		 385 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.862041  normal  0.168773 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0830  galactokinase  35.47 
 
 		 386 aa  230  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0480015  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002662  galactokinase  36.65 
 
 		 386 aa  229  8e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0652  galactokinase  33.85 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.430663  hitchhiker  0.00000383534 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03327  galactokinase  35.8 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2017  galactokinase  33.77 
 
 		 387 aa  227  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.126452  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2815  galactokinase  39.35 
 
 		 359 aa  224  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0577  galactokinase  33.93 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14320  galactokinase  36.39 
 
 		 389 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0883  galactokinase  36.68 
 
 		 394 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2244  galactokinase  35.26 
 
 		 399 aa  218  2e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1632  galactokinase  35.64 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2397  galactokinase  37.43 
 
 		 349 aa  216  5e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.667862 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2287  galactokinase  34.43 
 
 		 393 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1069  galactokinase  37.13 
 
 		 396 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2692  galactokinase  33.33 
 
 		 392 aa  213  3.9999999999999995e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  0.174085 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0171  galactokinase  36.87 
 
 		 390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0371326  hitchhiker  0.000320404 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0892  galactokinase  34.73 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0958973 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1233  galactokinase  36.39 
 
 		 395 aa  212  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000254056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1161  galactokinase  37.54 
 
 		 401 aa  210  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.415843  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1191  galactokinase  37.54 
 
 		 373 aa  210  3e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1938  galactokinase  35.81 
 
 		 369 aa  208  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.491701  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1464  galactokinase  36.09 
 
 		 394 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.10348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2607  galactokinase  35.39 
 
 		 399 aa  206  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00377614  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1371  galactokinase  35.05 
 
 		 388 aa  205  9e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3018  galactokinase  36.87 
 
 		 361 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1326  galactokinase  34.41 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0657  galactokinase  33.33 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0661  galactokinase  33.33 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3728  galactokinase  33.33 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0634  galactokinase  33.33 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>