More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2800 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 588 aa  1185    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  56.3 
 
 		 589 aa  669    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  43.46 
 
 		 590 aa  478  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  41.79 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  43.97 
 
 		 583 aa  451  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  43 
 
 		 513 aa  413  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.18 
 
 		 605 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  37.24 
 
 		 608 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.27 
 
 		 598 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.27 
 
 		 598 aa  364  2e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.16 
 
 		 585 aa  361  2e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.97 
 
 		 604 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  41.83 
 
 		 609 aa  350  3e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  36.95 
 
 		 611 aa  344  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.74 
 
 		 590 aa  339  9.999999999999999e-92  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.61 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  35.99 
 
 		 616 aa  302  1e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.78 
 
 		 637 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  34.9 
 
 		 616 aa  299  1e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.49 
 
 		 613 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  33.87 
 
 		 616 aa  291  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.83 
 
 		 615 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.96 
 
 		 640 aa  290  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.65 
 
 		 615 aa  290  4e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.65 
 
 		 615 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.15 
 
 		 615 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  33.56 
 
 		 616 aa  290  7e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  33.5 
 
 		 616 aa  289  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  34.15 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  34.15 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  34.71 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.15 
 
 		 618 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  34.15 
 
 		 622 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  34.15 
 
 		 618 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  34.15 
 
 		 618 aa  287  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  34.15 
 
 		 618 aa  287  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  34.47 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  34.17 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.18 
 
 		 614 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  34.35 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  34.35 
 
 		 618 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  34.17 
 
 		 618 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.18 
 
 		 614 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  36.86 
 
 		 612 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.23 
 
 		 615 aa  284  4.0000000000000003e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.69 
 
 		 633 aa  284  4.0000000000000003e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  33.98 
 
 		 618 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  35.69 
 
 		 633 aa  283  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.18 
 
 		 614 aa  283  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.75 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  34.33 
 
 		 618 aa  278  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.43 
 
 		 629 aa  277  5e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.87 
 
 		 613 aa  277  5e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  33.27 
 
 		 617 aa  276  8e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.79 
 
 		 613 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.05 
 
 		 614 aa  274  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.75 
 
 		 613 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.39 
 
 		 649 aa  274  4.0000000000000004e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.44 
 
 		 617 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  34.7 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  34.7 
 
 		 616 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  34.7 
 
 		 616 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  34.52 
 
 		 618 aa  268  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  33.9 
 
 		 610 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.87 
 
 		 617 aa  265  2e-69  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.26 
 
 		 566 aa  263  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.89 
 
 		 613 aa  263  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.1 
 
 		 621 aa  253  7e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0867  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.9 
 
 		 595 aa  249  1e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  32.96 
 
 		 621 aa  248  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.47 
 
 		 563 aa  247  4e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.88 
 
 		 617 aa  246  6e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.36 
 
 		 620 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  32.15 
 
 		 618 aa  245  1.9999999999999999e-63  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  30.09 
 
 		 569 aa  244  3e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.72 
 
 		 611 aa  244  3e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3608  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.95 
 
 		 570 aa  241  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.113162  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.36 
 
 		 626 aa  240  6.999999999999999e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2621  peptidase S49  31.51 
 
 		 593 aa  238  2e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.5 
 
 		 562 aa  236  9e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  29.34 
 
 		 623 aa  229  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2410  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.04 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00005921  decreased coverage  0.000106081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.38 
 
 		 661 aa  228  3e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3877  signal peptide peptidase SppA, 67K type  48.05 
 
 		 656 aa  226  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.725611  normal  0.0235537 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.54 
 
 		 605 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.54 
 
 		 605 aa  224  2e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4955  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.61 
 
 		 875 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.864933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.29 
 
 		 593 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.29 
 
 		 593 aa  224  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.53 
 
 		 593 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1819  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.63 
 
 		 571 aa  217  5.9999999999999996e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0408737 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  29.26 
 
 		 601 aa  216  8e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.26 
 
 		 597 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.44 
 
 		 831 aa  208  2e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  30.03 
 
 		 601 aa  208  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5026  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.84 
 
 		 595 aa  206  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.025113  normal  0.110244 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1225  peptidase S49  28.85 
 
 		 555 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0362989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2526  signal peptide peptidase SppA, 36K type  30.68 
 
 		 561 aa  205  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0222519 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  32.3 
 
 		 609 aa  203  9e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>