More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2797 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 298 aa  612  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  68.79 
 
 		 305 aa  428  1e-119  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  64.31 
 
 		 299 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  62.29 
 
 		 316 aa  396  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  59.52 
 
 		 299 aa  355  3.9999999999999996e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  57.24 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  51.35 
 
 		 298 aa  328  8e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  51.01 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  49.83 
 
 		 303 aa  300  3e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  51.37 
 
 		 308 aa  293  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  44.26 
 
 		 296 aa  266  2e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  44.33 
 
 		 306 aa  262  4e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.88 
 
 		 298 aa  257  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  42.47 
 
 		 304 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.81 
 
 		 299 aa  251  1e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  41.14 
 
 		 295 aa  246  4e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 		 304 aa  244  9e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 		 295 aa  244  9.999999999999999e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  42.76 
 
 		 295 aa  243  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  43.2 
 
 		 295 aa  242  5e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  44 
 
 		 304 aa  240  2e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  41.39 
 
 		 302 aa  240  2e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.96 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.96 
 
 		 296 aa  240  2e-62  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  43.14 
 
 		 295 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 		 306 aa  239  2.9999999999999997e-62  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  239  5e-62  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  238  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.61 
 
 		 296 aa  238  6.999999999999999e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  42.66 
 
 		 297 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  40.61 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  42.33 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  41.44 
 
 		 305 aa  236  2e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  40.88 
 
 		 295 aa  236  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  41.86 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 295 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.27 
 
 		 296 aa  235  7e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 292 aa  234  9e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  42.61 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  41.06 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  41.92 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  39.6 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  43.1 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  42.03 
 
 		 310 aa  227  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  42.18 
 
 		 317 aa  226  3e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 		 309 aa  226  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 		 303 aa  226  4e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  42.76 
 
 		 298 aa  225  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  40.46 
 
 		 309 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  39.93 
 
 		 295 aa  223  3e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  41.72 
 
 		 298 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  41.98 
 
 		 298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0651  tyrosine recombinase XerD  40.75 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0950079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  39.06 
 
 		 302 aa  222  4.9999999999999996e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  43 
 
 		 298 aa  222  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  40.2 
 
 		 294 aa  222  7e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  39.19 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.5 
 
 		 300 aa  222  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  39.59 
 
 		 309 aa  221  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  42.16 
 
 		 321 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  39.74 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 		 298 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  39.74 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  39.53 
 
 		 301 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.91 
 
 		 302 aa  219  3.9999999999999997e-56  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  40.53 
 
 		 306 aa  219  5e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 		 298 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.98 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.22 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  39.45 
 
 		 291 aa  218  1e-55  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  40.82 
 
 		 303 aa  217  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  40.86 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  38.91 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  37.16 
 
 		 296 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  38.11 
 
 		 311 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36.24 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.07 
 
 		 299 aa  216  4e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  39.13 
 
 		 303 aa  216  4e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.24 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  39.74 
 
 		 320 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 		 298 aa  216  5e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  43.34 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  39.53 
 
 		 312 aa  216  5e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  38.23 
 
 		 300 aa  215  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.48 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  37.8 
 
 		 296 aa  215  8e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>