More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2796 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 		 138 aa  286  6e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.396749  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2435  3-dehydroquinate dehydratase, type II  74.64 
 
 		 142 aa  214  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.476649 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0128  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.91 
 
 		 137 aa  202  9e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.297868  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2345  3-dehydroquinate dehydratase, type II  66.18 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.660798  normal  0.653044 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0067  3-dehydroquinate dehydratase, type II  63.04 
 
 		 139 aa  186  7e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463951  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2703  3-dehydroquinate dehydratase  58.52 
 
 		 145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2174  3-dehydroquinate dehydratase, type II  60.14 
 
 		 140 aa  174  5e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11973  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0204  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.01 
 
 		 147 aa  169  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1731  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3145  3-dehydroquinate dehydratase  55.88 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.35351  normal  0.502836 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0570  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3392  3-dehydroquinate dehydratase  56.62 
 
 		 158 aa  155  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  52.55 
 
 		 153 aa  150  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2690  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 150 aa  150  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000775969  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 145 aa  150  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3121  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.85 
 
 		 149 aa  150  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  54.41 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3376  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 147 aa  149  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  52.94 
 
 		 156 aa  149  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 148 aa  149  1e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  51.77 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  53.68 
 
 		 156 aa  148  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3174  3-dehydroquinate dehydratase  52.52 
 
 		 153 aa  148  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.715681 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  51.43 
 
 		 162 aa  147  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0045  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.72 
 
 		 144 aa  147  3e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4568  3-dehydroquinate dehydratase  50.38 
 
 		 151 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3637  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.14 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3022  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 147 aa  147  5e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00285164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0784  3-dehydroquinate dehydratase  47.76 
 
 		 173 aa  147  6e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.559355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1610  3-dehydroquinate dehydratase  50.71 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0468975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5453  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 147 aa  147  7e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.747889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.36 
 
 		 145 aa  147  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  53.73 
 
 		 161 aa  146  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.33 
 
 		 144 aa  146  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  54.14 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.17 
 
 		 156 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 145 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0932  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 151 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  51.49 
 
 		 145 aa  146  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03924  3-dehydroquinate dehydratase (3-dehydroquinase) (Type II DHQase)  51.49 
 
 		 146 aa  146  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.252405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0845  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50.7 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.556565  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2834  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 		 149 aa  145  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2104  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 148 aa  144  3e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0883  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 		 160 aa  144  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.893545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3916  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 150 aa  144  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.491166  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2620  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 155 aa  143  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.535696 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0470  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000102213  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3854  3-dehydroquinate dehydratase  52.99 
 
 		 146 aa  143  6e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.31735  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2785  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 156 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.995047 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3030  3-dehydroquinate dehydratase  51.06 
 
 		 155 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1044  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.983383  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4964  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0222066 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 159 aa  142  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 		 146 aa  142  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3063  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.816098  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5304  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  142  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0349681 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3980  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2491  3-dehydroquinate dehydratase  47.52 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.254685  normal  0.906535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3692  3-dehydroquinate dehydratase  50.75 
 
 		 150 aa  141  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.526895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04071  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 207 aa  142  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2058  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5193  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3798  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 146 aa  142  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000334533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5319  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0546  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0344  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960001  normal  0.658958 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1210  3-dehydroquinate dehydratase  47.45 
 
 		 151 aa  141  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0586  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 150 aa  141  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0571  3-dehydroquinate dehydratase  50.36 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293441  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0511  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3520  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 144 aa  141  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3467  3-dehydroquinate dehydratase  48.91 
 
 		 149 aa  141  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 159 aa  141  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2302  3-dehydroquinate dehydratase  47.86 
 
 		 177 aa  141  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.708414  hitchhiker  0.00337586 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3348  3-dehydroquinate dehydratase  52.24 
 
 		 144 aa  141  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5032  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 		 142 aa  141  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 		 159 aa  141  4e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4665  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  140  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.560222  normal  0.542393 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1784  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851396 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3194  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  49.65 
 
 		 146 aa  140  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>