239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2785 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2785  pentapeptide repeat protein  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.119978 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1685  pentapeptide repeat-containing protein  44.89 
 
 		 186 aa  160  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.655293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1295  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  40.78 
 
 		 194 aa  140  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.75651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0182  pentapeptide repeat-containing protein  39.68 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.659923  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1405  pentapeptide repeat protein  40.83 
 
 		 193 aa  137  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.207308 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1984  pentapeptide repeat-containing protein  39.15 
 
 		 193 aa  136  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673672  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01855  MCBG-like protein (microcin resistance protein)  38.33 
 
 		 191 aa  136  2e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.28173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1161  pentapeptide repeat protein  41.67 
 
 		 180 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0925875  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1064  pentapeptide repeat protein  37.43 
 
 		 193 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00169254  unclonable  0.00000682952 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1473  pentapeptide repeat protein  38.12 
 
 		 193 aa  127  8.000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.978598  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1489  pentapeptide repeat protein  42.07 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0526071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2486  pentapeptide repeat-containing protein  40.24 
 
 		 190 aa  124  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000657605  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2556  pentapeptide repeat-containing protein  35.96 
 
 		 197 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0339255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0867  pentapeptide repeat-containing protein  35.06 
 
 		 185 aa  108  6e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3404  pentapeptide repeat-containing protein  36.31 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00102719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0862  pentapeptide repeat protein  32.76 
 
 		 214 aa  100  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.438607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1483  MCBG protein (microcin resistance protein)-like  30.46 
 
 		 206 aa  97.8  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2591  pentapeptide repeat-containing protein  34.13 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1907  hypothetical protein  35.18 
 
 		 211 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0174231  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1608  pentapeptide repeat-containing protein  30.06 
 
 		 199 aa  87.8  7e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.341155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2009  hypothetical protein  34.17 
 
 		 211 aa  87  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0360432  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3436  hypothetical protein  34.67 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.788861  hitchhiker  0.0000000000213679 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0979  hypothetical protein  37.09 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1145  hypothetical protein  37.09 
 
 		 211 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0977  quinolone resistance protein  37.09 
 
 		 211 aa  85.9  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000210574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0277  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 		 195 aa  85.9  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2490  pentapeptide repeat-containing protein  31.33 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0558  pentapeptide repeat protein  33.14 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3782  pentapeptide repeat-containing protein  32.61 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0530  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4064  mcbg protein, putative  32.39 
 
 		 265 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0554  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3601  pentapeptide repeat-containing protein  29.32 
 
 		 199 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0610  pentapeptide repeat-containing protein  30.46 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3620  pentapeptide repeat-containing protein  31.55 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0506  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3445  pentapeptide repeat-containing protein  29.55 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1872  pentapeptide repeat protein  29.79 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000620101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1207  pentapeptide repeat-containing protein  30.17 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00122805  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2341  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 		 227 aa  67  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.017985  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3671  pentapeptide repeat-containing protein  26.89 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2262  pentapeptide repeat protein  27.33 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1950  pentapeptide repeat-containing protein  23.33 
 
 		 232 aa  61.2  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0649  hypothetical protein  25.35 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1273  pentapeptide repeat protein  25.53 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0243714  normal  0.749972 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3305  pentapeptide repeat-containing protein  21.2 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0582845  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  22.99 
 
 		 452 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0076  hypothetical protein  26.84 
 
 		 261 aa  57.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.440819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1294  hypothetical protein  31.09 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.10056 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2842  pentapeptide repeat protein  28.8 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.713395  normal  0.309994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4376  pentapeptide repeat-containing protein  27.1 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4864  pentapeptide repeat-containing protein  26 
 
 		 229 aa  57  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.985776  normal  0.176917 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1181  pentapeptide repeat protein  24.06 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.329473 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1590  quinolone resistance determinant QnrC  27.22 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0160927  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  26.09 
 
 		 844 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2126  pentapeptide repeat-containing protein  29.93 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0029  pentapeptide repeat-containing protein  26.82 
 
 		 976 aa  55.8  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.271954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0198  pentapeptide repeat-containing protein  22.99 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.720346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  21.26 
 
 		 453 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  21.26 
 
 		 485 aa  55.1  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5828  pentapeptide repeat protein  23.65 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510799  normal  0.209528 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3302  pentapeptide repeat protein  27.83 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.364956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3428  pentapeptide repeat-containing protein  22.94 
 
 		 739 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2958  pentapeptide repeat-containing protein  22.94 
 
 		 739 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0161296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3557  pentapeptide repeat-containing protein  22.94 
 
 		 739 aa  54.7  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  29.75 
 
 		 222 aa  53.9  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2466  pentapeptide repeat-containing protein  22.58 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2868  pentapeptide repeat protein  26.9 
 
 		 370 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06906  hypothetical protein  27.07 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4783  pentapeptide repeat-containing protein  22.98 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  22.37 
 
 		 449 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1751  pentapeptide repeat-containing protein  27.78 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00861009  normal  0.11682 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0030  pentapeptide repeat-containing protein  30.25 
 
 		 359 aa  52.4  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.108145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  26.71 
 
 		 175 aa  52  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  24 
 
 		 456 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1058  pentapeptide repeat protein  25.88 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819721  normal  0.059733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0911  pentapeptide repeat protein  25 
 
 		 215 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.545668 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0044  pentapeptide repeat-containing protein  23.89 
 
 		 245 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1028  pentapeptide repeat-containing protein  21.67 
 
 		 180 aa  50.4  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22421  normal  0.0351171 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  25.41 
 
 		 493 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  23.65 
 
 		 355 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4418  pentapeptide repeat protein  24.46 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  23.29 
 
 		 309 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1900  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 825 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1896  hypothetical protein  25.14 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1704  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 862 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0725  pentapeptide repeat-containing protein  28.57 
 
 		 568 aa  49.7  0.00002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.967446  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1193  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0798  hypothetical protein  30.47 
 
 		 171 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  24.07 
 
 		 215 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1210  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  24.07 
 
 		 411 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0911  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 825 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8772  hypothetical protein  24.52 
 
 		 206 aa  49.7  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1198  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 825 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0343  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 825 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.1938  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1220  pentapeptide repeat-containing protein  24.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0252  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 825 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2173  pentapeptide repeat-containing protein  25.13 
 
 		 825 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1144  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>