286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2769 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2568  Soluble ligand binding domain protein  46.05 
 
 
812 aa  648  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2769  polysaccharide export protein  100 
 
 
846 aa  1693  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.594167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1078  polysaccharide export protein  39.06 
 
 
830 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3949  polysaccharide export protein  40.03 
 
 
823 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.256427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4937  polysaccharide export protein  38.06 
 
 
800 aa  457  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00100729  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4605  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
791 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.321524  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0473  polysaccharide export protein  33.71 
 
 
824 aa  397  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0353  polysaccharide export protein  32.3 
 
 
830 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.949664  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3035  polysaccharide export protein  28.84 
 
 
828 aa  298  3e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.636336  normal  0.407015 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2264  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.38 
 
 
827 aa  296  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000642696  decreased coverage  0.000131264 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2606  polysaccharide export protein  31.42 
 
 
936 aa  295  2e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1470  polysaccharide export protein  28.8 
 
 
828 aa  294  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.270093  normal  0.749053 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  29.11 
 
 
833 aa  281  4e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1604  polysaccharide export protein  29.07 
 
 
952 aa  278  4e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2903  polysaccharide export protein  29.44 
 
 
828 aa  278  4e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0690654  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  30.83 
 
 
948 aa  278  4e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1382  polysaccharide export protein  28.65 
 
 
837 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1315  polysaccharide export protein  28.65 
 
 
837 aa  278  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0893778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1375  polysaccharide export protein  28.24 
 
 
837 aa  271  3e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0193694  decreased coverage  2.8911e-06 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3062  polysaccharide export protein  28.59 
 
 
834 aa  269  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0530  polysaccharide export protein  28.41 
 
 
1055 aa  262  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.925852 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  29.48 
 
 
781 aa  245  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1576  ClpX, ATPase regulatory subunit  29.89 
 
 
833 aa  244  4e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  3.3468e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3403  polysaccharide export protein  28.88 
 
 
977 aa  244  6e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00684592  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  28.46 
 
 
869 aa  234  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0763  polysaccharide export protein  26.83 
 
 
852 aa  231  3e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00148481  normal  0.528442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1714  polysaccharide export protein  29.2 
 
 
947 aa  224  6e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.397648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0888  polysaccharide export protein  26.87 
 
 
940 aa  221  3e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.434689  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2671  polysaccharide export protein  27.84 
 
 
919 aa  218  5e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1395  polysaccharide export protein  28.33 
 
 
931 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0391429  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1399  polysaccharide export protein  27.62 
 
 
920 aa  211  4e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00159215  normal  0.0100644 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1651  polysaccharide export protein  27.12 
 
 
915 aa  211  4e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.530434  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3193  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 
921 aa  210  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2843  polysaccharide export protein  27.44 
 
 
910 aa  205  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.427616  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3032  polysaccharide export protein  27.48 
 
 
922 aa  204  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190653  normal  0.0184914 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2543  polysaccharide export protein  27.3 
 
 
919 aa  201  4e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.941823  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.95 
 
 
920 aa  201  4e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2893  polysaccharide export protein  26.79 
 
 
912 aa  201  5e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.325033  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0794  polysaccharide export protein  24.86 
 
 
869 aa  179  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.020437  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2676  polysaccharide export protein  24.52 
 
 
849 aa  176  1e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2732  polysaccharide export protein  27.44 
 
 
753 aa  175  3e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445544  normal  0.725394 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0648  polysaccharide export protein  29.6 
 
 
779 aa  166  1e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  25.08 
 
 
897 aa  162  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0277  polysaccharide export periplasmic protein  24.69 
 
 
869 aa  160  8e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1345  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  28 
 
 
568 aa  160  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291611 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1889  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  29.08 
 
 
576 aa  148  4e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.105703  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0660  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.7 
 
 
877 aa  142  2e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0566  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  28.7 
 
 
800 aa  143  2e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1986  polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.7 
 
 
877 aa  142  2e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1959  capsule polysaccharide export system periplasmic protein  28.7 
 
 
875 aa  142  3e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.940843  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3790  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
803 aa  138  5e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0599  polysaccharide export protein  30.99 
 
 
580 aa  120  9e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  5.41966e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.53 
 
 
478 aa  114  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2584  polysaccharide export protein  25.62 
 
 
605 aa  97.1  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  unclonable  2.40824e-05 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1344  polysaccharide export protein  36.18 
 
 
425 aa  97.1  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00232143 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001787  capsular polysaccharide export system periplasmic protein KpsD  23.6 
 
 
579 aa  95.5  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03058  capsular polysaccharide transport protein, putative  23.15 
 
 
609 aa  87.8  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.715854  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1618  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.71 
 
 
552 aa  87.4  1e-15  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1826  polysaccharide export protein  31.12 
 
 
516 aa  86.3  2e-15  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.698968  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1438  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.71 
 
 
552 aa  86.7  2e-15  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.473166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3241  polysaccharide export protein  22.7 
 
 
587 aa  84.3  9e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1779  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  31.22 
 
 
552 aa  82.8  2e-14  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  22.64 
 
 
495 aa  82.4  4e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0289  polysaccharide export protein  25.5 
 
 
992 aa  81.6  5e-14  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.593882  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.18 
 
 
473 aa  81.6  5e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2624  polysaccharide export protein  23.9 
 
 
573 aa  81.6  6e-14  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.145558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5952  polysaccharide export protein  29.1 
 
 
557 aa  80.9  9e-14  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0293  capsular polysaccharide ABC transporter, periplasmic polysaccharide-binding protein  27.41 
 
 
552 aa  80.9  9e-14  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.994472  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3221  polysialic acid capsule transport protein KpsD  24.43 
 
 
558 aa  80.5  1e-13  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.364488  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0290  polysaccharide export protein  25.19 
 
 
992 aa  80.5  1e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  24.43 
 
 
558 aa  79.7  2e-13  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  24.43 
 
 
558 aa  79.7  2e-13  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.32683e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  26.44 
 
 
387 aa  80.1  2e-13  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  27.35 
 
 
379 aa  78.2  7e-13  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  27.54 
 
 
388 aa  77  1e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1307  polysaccharide export protein  29.81 
 
 
565 aa  75.9  3e-12  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2475  polysaccharide export protein  25.54 
 
 
283 aa  75.5  4e-12  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1924  polysaccharide export protein  24.1 
 
 
551 aa  75.5  4e-12  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0359634 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  29.26 
 
 
373 aa  74.3  8e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  25.78 
 
 
386 aa  73.9  1e-11  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0621  KpsD protein  26.55 
 
 
606 aa  73.2  2e-11  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.440749 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2582  polysaccharide export protein  30.77 
 
 
205 aa  72.4  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  28.09 
 
 
281 aa  72.4  3e-11  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  23.64 
 
 
478 aa  72.4  3e-11  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  27.39 
 
 
282 aa  72.4  3e-11  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  28.43 
 
 
309 aa  72  4e-11  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1535  polysaccharide export protein  22.62 
 
 
495 aa  71.2  7e-11  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.106975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  27.02 
 
 
264 aa  70.9  9e-11  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  22.37 
 
 
495 aa  70.5  1e-10  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1528  polysaccharide export protein  27.53 
 
 
246 aa  70.1  2e-10  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0246  polysaccharide export protein  26.01 
 
 
537 aa  69.7  2e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  8.56367e-05  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4938  polysaccharide export protein  23.3 
 
 
603 aa  69.3  3e-10  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5038  polysaccharide export protein  26.17 
 
 
358 aa  69.3  3e-10  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  29.34 
 
 
252 aa  68.6  5e-10  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0310  polysaccharide biosynthesis/export protein  21.15 
 
 
703 aa  68.6  5e-10  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  28.18 
 
 
270 aa  67.8  7e-10  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  25.58 
 
 
347 aa  68.2  7e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.78188e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0468  polysaccharide export outer membrane protein  24.19 
 
 
387 aa  67.4  1e-09  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.622539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003530  polysaccharide export periplasmic protein  24.82 
 
 
700 aa  67  1e-09  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  29.51 
 
 
393 aa  67  1e-09  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>