More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2757 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  100 
 
 
216 aa  443  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  52.78 
 
 
219 aa  244  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  53.52 
 
 
219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  53.4 
 
 
219 aa  228  4e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  49.77 
 
 
214 aa  226  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  48.29 
 
 
227 aa  213  9.999999999999999e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  50.73 
 
 
219 aa  205  5e-52  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  49.51 
 
 
207 aa  203  2e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  45.54 
 
 
215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  42.38 
 
 
221 aa  181  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  45.32 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  42.65 
 
 
218 aa  177  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  45.74 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2961  beta-phosphoglucomutase  43.63 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.423838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  40.39 
 
 
209 aa  171  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  43.4 
 
 
214 aa  167  8e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  40 
 
 
220 aa  165  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1436  beta-phosphoglucomutase  39.9 
 
 
233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0665793  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  41.46 
 
 
215 aa  162  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  39.62 
 
 
219 aa  161  6e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  44.78 
 
 
965 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  39.62 
 
 
219 aa  160  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  37.38 
 
 
221 aa  159  3e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2329  beta-phosphoglucomutase  39.15 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0229968  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1432  putative beta-phosphoglucomutase  39.15 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2308  beta-phosphoglucomutase  39.15 
 
 
219 aa  159  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  44.06 
 
 
978 aa  157  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  38.5 
 
 
219 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  42.21 
 
 
220 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01294  predicted beta-phosphoglucomutase  38.68 
 
 
219 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01305  hypothetical protein  38.68 
 
 
219 aa  156  3e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  42.11 
 
 
585 aa  152  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  42.19 
 
 
223 aa  150  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  37.85 
 
 
228 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0997  HAD family sugar phosphatase  40.47 
 
 
223 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  40.64 
 
 
230 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0304  beta-phosphoglucomutase  36.32 
 
 
986 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.337026 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3311  beta-phosphoglucomutase  44.16 
 
 
220 aa  145  5e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  39.15 
 
 
208 aa  145  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  38.18 
 
 
223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.01 
 
 
217 aa  116  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  34.29 
 
 
233 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0071  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  34.76 
 
 
234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  31.69 
 
 
216 aa  107  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
220 aa  107  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  31.69 
 
 
216 aa  107  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.16 
 
 
217 aa  105  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.59 
 
 
221 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
225 aa  105  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.98 
 
 
396 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.63 
 
 
248 aa  102  3e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  32.35 
 
 
456 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  32.84 
 
 
456 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3373  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.9 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.154909  normal  0.78527 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2523  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
219 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000119514  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.33 
 
 
268 aa  98.6  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  29.47 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  34.84 
 
 
242 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.26 
 
 
218 aa  97.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.177922  normal  0.23268 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.27 
 
 
245 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
248 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  32.03 
 
 
1053 aa  96.7  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  29.38 
 
 
456 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  33.91 
 
 
253 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.62 
 
 
242 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2237  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.55 
 
 
254 aa  95.5  5e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.202357  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  33.17 
 
 
228 aa  95.1  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.18 
 
 
1053 aa  94.7  8e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.58 
 
 
236 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4825  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.83 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3787  HAD family hydrolase  33.68 
 
 
238 aa  93.6  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.85061  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.73 
 
 
218 aa  93.6  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.86 
 
 
1051 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.11 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.73 
 
 
232 aa  92.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.6 
 
 
1051 aa  92.4  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  28.77 
 
 
228 aa  92  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.2 
 
 
1053 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  31.03 
 
 
1055 aa  91.7  8e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33 
 
 
242 aa  91.7  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02545  predicted hydrolase  31.87 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00348702  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02510  hypothetical protein  31.87 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00621233  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2826  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1017  fructose-1-phosphatase  31.87 
 
 
188 aa  91.3  9e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0370364  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2065  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.03 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000166842  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2486  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.9 
 
 
232 aa  90.9  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.24904  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0994  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.87 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122872  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.05 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.91 
 
 
244 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.47 
 
 
268 aa  89.7  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2483  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  30.11 
 
 
233 aa  89.7  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0678579  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.14 
 
 
223 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  31.17 
 
 
1052 aa  89.4  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0845  fructose-1-phosphatase  31.35 
 
 
188 aa  89.4  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012907  hitchhiker  0.000000242912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3936  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1351  HAD family hydrolase  27.41 
 
 
236 aa  88.6  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00941248  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2812  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000062421  hitchhiker  0.000278868 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  28.44 
 
 
220 aa  89  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2973  fructose-1-phosphatase  31.32 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000945965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>