More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2714 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2714  amidohydrolase  100 
 
 		 449 aa  917    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0207  amidohydrolase  68.31 
 
 		 480 aa  632  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.696886  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3266  amidohydrolase  58.02 
 
 		 438 aa  501  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.309281 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1358  carboxypeptidase  58.31 
 
 		 459 aa  498  1e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0259  amidohydrolase  57.71 
 
 		 435 aa  484  1e-135  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0605709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3743  carboxypeptidase  52.94 
 
 		 465 aa  474  1e-132  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3816  carboxypeptidase  55.81 
 
 		 465 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1258  peptidase M20D, amidohydrolase  57.74 
 
 		 431 aa  465  9.999999999999999e-131  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.248557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0302  amidohydrolase  51.26 
 
 		 437 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00571  Peptidase M20D, amidohydrolase  54.32 
 
 		 432 aa  464  1e-129  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0208  amidohydrolase  53.51 
 
 		 466 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.132335  normal  0.813004 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5885  amidohydrolase  55.45 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3688  amidohydrolase  53.22 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.395415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03984  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  51.2 
 
 		 438 aa  448  1e-125  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4257  amidohydrolase  52.87 
 
 		 465 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0206  amidohydrolase  51.45 
 
 		 471 aa  443  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.196253  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3941  carboxypeptidase  52.26 
 
 		 470 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4303  amidohydrolase  52.17 
 
 		 436 aa  439  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4131  amidohydrolase  54.5 
 
 		 471 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3487  peptidase M20D, amidohydrolase  51.27 
 
 		 435 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00054557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1417  amidohydrolase  50.79 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1306  amidohydrolase  51.61 
 
 		 447 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1501  amidohydrolase  49.36 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.190577  normal  0.0701308 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0066  amidohydrolase  42.6 
 
 		 390 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4369  amidohydrolase  41.41 
 
 		 405 aa  318  1e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4368  amidohydrolase  41.33 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4430  amidohydrolase  41.33 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.282991 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0256  peptidase M20D, amidohydrolase  41.52 
 
 		 408 aa  311  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3557  amidohydrolase  39.76 
 
 		 405 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0217903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2218  peptidase M20D, amidohydrolase  42.39 
 
 		 405 aa  309  6.999999999999999e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1843  amidohydrolase  40.28 
 
 		 405 aa  306  7e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0130  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  41.18 
 
 		 401 aa  301  1e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0750166  normal  0.238012 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7287  amidohydrolase  40.05 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1096  hypothetical protein  43.11 
 
 		 400 aa  301  2e-80  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.081293 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0528  amidohydrolase  42.93 
 
 		 390 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0004  amidohydrolase  42.17 
 
 		 399 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.209653  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1415  amidohydrolase family protein  39.85 
 
 		 398 aa  292  8e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.486637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1225  amidohydrolase family protein  40 
 
 		 398 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0413476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0493  amidohydrolase  41.87 
 
 		 391 aa  290  3e-77  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.642244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2791  amidohydrolase  38.9 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0982  amidohydrolase  40.14 
 
 		 404 aa  287  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0022  amidohydrolase  41.85 
 
 		 380 aa  286  5e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1597  amidohydrolase  41.13 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0486539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1431  amidohydrolase  41.03 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00950334  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2708  amidohydrolase  39.21 
 
 		 415 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0172  amidohydrolase  41.81 
 
 		 388 aa  281  2e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4224  amidohydrolase  37.53 
 
 		 391 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000104143  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2432  amidohydrolase  39.18 
 
 		 430 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2758  amidohydrolase  41.54 
 
 		 393 aa  278  2e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.00285471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3841  amidohydrolase  38.88 
 
 		 397 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1591  amidohydrolase  41.81 
 
 		 389 aa  277  3e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.653364 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0146  amidohydrolase family protein  40.7 
 
 		 400 aa  276  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0273  amidohydrolase  40.86 
 
 		 395 aa  276  8e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4372  hippurate hydrolase  42.47 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1012  amidohydrolase  38.54 
 
 		 400 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.570696 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0180  peptidase M20D, amidohydrolase  41.22 
 
 		 393 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0634  amidohydrolase  39.35 
 
 		 387 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0169  amidohydrolase  36.28 
 
 		 411 aa  273  3e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0678  amidohydrolase  38.86 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.000000231632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4957  amidohydrolase  39.71 
 
 		 395 aa  272  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00657786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0613  amidohydrolase  38.26 
 
 		 400 aa  272  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3175  amidohydrolase  39.51 
 
 		 394 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2224  amidohydrolase  39.45 
 
 		 396 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.355102  normal  0.809475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2022  amidohydrolase  39.51 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36900  amidohydrolase  40.6 
 
 		 410 aa  269  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0846344 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2073  amidohydrolase  34.9 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1020  peptidase M20D, amidohydrolase  37.32 
 
 		 407 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0205344 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0017  amidohydrolase  37.76 
 
 		 394 aa  268  2e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1324  amidohydrolase  39.43 
 
 		 410 aa  266  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3491  amidohydrolase  38.25 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207753  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4586  putative amidohydrolase family protein  40.05 
 
 		 389 aa  266  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1988  amidohydrolase  39.9 
 
 		 399 aa  266  5.999999999999999e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000688604  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1764  amidohydrolase  39.12 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7215  hippurate hydrolase  40.3 
 
 		 397 aa  265  8.999999999999999e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0903  peptidase M20D, amidohydrolase  37.35 
 
 		 409 aa  265  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3690  amidohydrolase  40.24 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.824469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4829  amidohydrolase  40.65 
 
 		 384 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.316322  normal  0.642966 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1741  amidohydrolase  38.54 
 
 		 395 aa  265  2e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3456  amidohydrolase  38.8 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2314  peptidase M20D, amidohydrolase  39.7 
 
 		 402 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.63249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1222  amidohydrolase  38.75 
 
 		 393 aa  263  6e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115214  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0545  amidohydrolase  37.83 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.502241  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06010  amidohydrolase  36.96 
 
 		 413 aa  262  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.842798  normal  0.268708 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2319  amidohydrolase  38.97 
 
 		 386 aa  262  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00292059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2667  peptidase M20D, amidohydrolase  36.41 
 
 		 404 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2932  peptidase M20D, amidohydrolase  39.9 
 
 		 382 aa  260  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.886758  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1491  amidohydrolase  38.56 
 
 		 396 aa  259  6e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3350  amidohydrolase  39.56 
 
 		 388 aa  259  8e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028515  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1044  amidohydrolase  37.96 
 
 		 408 aa  259  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210114  unclonable  0.00000194036 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5199  hippurate hydrolase  37.62 
 
 		 403 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3877  amidohydrolase  36.67 
 
 		 402 aa  258  2e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0606835  normal  0.924655 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3771  thermostable carboxypeptidase 1  39.3 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.406616  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3605  amidohydrolase  38 
 
 		 446 aa  257  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.202541  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3419  N-acyl-L-amino acid amidohydrolase  37.47 
 
 		 381 aa  257  4e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1059  peptidase M20D, amidohydrolase  40.1 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996259  decreased coverage  0.0000027158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1544  thermostable carboxypeptidase 1  38.96 
 
 		 381 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0195635 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0269  amidohydrolase  34.97 
 
 		 423 aa  256  5e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2925  amidohydrolase  37.79 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0728  amidohydrolase  40.1 
 
 		 454 aa  256  7e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.0037974  hitchhiker  0.0000264187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1178  amidohydrolase  36.95 
 
 		 398 aa  255  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>