More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2634 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5765  leucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
971 aa  738  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.351208  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2634  leucyl-tRNA synthetase  100 
 
 
969 aa  2000  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3538  leucyl-tRNA synthetase  64.6 
 
 
936 aa  1298  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7074  leucyl-tRNA synthetase  43.57 
 
 
934 aa  779  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6801  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
958 aa  746  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1254  leucyl-tRNA synthetase  55.22 
 
 
922 aa  1110  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39550  leucyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 
949 aa  753  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990256  normal  0.390992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3901  leucyl-tRNA synthetase  39.34 
 
 
1064 aa  718  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0952  leucyl-tRNA synthetase  56.39 
 
 
1146 aa  747  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17360  leucyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 
984 aa  738  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.634909  normal  0.0124443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12550  leucyl-tRNA synthetase  39.19 
 
 
985 aa  701  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.220072  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1568  leucyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 
984 aa  709  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.609969 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0829  leucyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
1016 aa  712  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0577341  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5389  leucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
971 aa  738  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852911  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  40.47 
 
 
835 aa  682  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2339  leucyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
838 aa  728  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.476002  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0853  leucyl-tRNA synthetase  42.53 
 
 
949 aa  753  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0292771 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3225  leucyl-tRNA synthetase  41 
 
 
954 aa  737  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.14755  normal  0.0283865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6054  leucyl-tRNA synthetase  41.98 
 
 
968 aa  746  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.110636  normal  0.47008 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0565  leucyl-tRNA synthetase  57.66 
 
 
954 aa  1119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.352137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5478  leucyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
971 aa  738  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.81609  normal  0.704935 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0268  leucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
833 aa  704  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1363  leucyl-tRNA synthetase  54.49 
 
 
923 aa  1127  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0875  leucyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
829 aa  704  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0257  leucyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
840 aa  674  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.847152  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0328  leucyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 
987 aa  725  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10040  leucyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 
969 aa  723  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.928861 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1287  leucyl-tRNA synthetase  59.07 
 
 
921 aa  1211  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.242192  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1730  leucyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 
968 aa  693  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5392  leucyl-tRNA synthetase  41.18 
 
 
978 aa  708  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3451  leucyl-tRNA synthetase  41.72 
 
 
952 aa  727  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0150406 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  42.61 
 
 
854 aa  714  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0671  leucyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 
906 aa  766  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13250  leucyl-tRNA synthetase  40.94 
 
 
978 aa  714  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2223  leucyl-tRNA synthetase  39.26 
 
 
990 aa  698  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4214  leucyl-tRNA synthetase  41.02 
 
 
952 aa  727  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2234  leucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
982 aa  711  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0120653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1712  leucyl-tRNA synthetase  70.2 
 
 
949 aa  1434  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837375  normal  0.849359 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3367  leucyl-tRNA synthetase  39.82 
 
 
963 aa  711  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.737021  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3733  leucyl-tRNA synthetase  43.45 
 
 
936 aa  799  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0244486  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2057  leucyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 
833 aa  695  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00764641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4914  leucyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 
950 aa  752  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.782007 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2339  leucyl-tRNA synthetase  42.28 
 
 
858 aa  754  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000153257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04530  leucyl-tRNA synthetase  58.56 
 
 
944 aa  1140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0944  leucine--tRNA ligase  40.25 
 
 
994 aa  716  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4829  leucyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
951 aa  723  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.304554  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0796  leucyl-tRNA synthetase  57.55 
 
 
925 aa  1131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0481  leucyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 
819 aa  620  1e-176  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.772871  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1295  leucyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 
806 aa  618  1e-175  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.79205e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 
857 aa  602  1e-171  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2764  leucyl-tRNA synthetase  47.14 
 
 
805 aa  590  1e-167  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000658086  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41128  predicted protein  41.46 
 
 
879 aa  585  1e-165  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.780375  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 
805 aa  582  1e-165  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1413  leucyl-tRNA synthetase  35.5 
 
 
851 aa  575  1e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.16015e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1318  leucyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
804 aa  571  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0635  leucyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
808 aa  570  1e-161  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.578489  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1860  leucyl-tRNA synthetase  35.29 
 
 
854 aa  563  1e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  43.41 
 
 
805 aa  555  1e-156  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  45.18 
 
 
802 aa  552  1e-155  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4535  leucyl-tRNA synthetase  35.95 
 
 
904 aa  552  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  35.72 
 
 
875 aa  548  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1688  leucyl-tRNA synthetase  41.85 
 
 
805 aa  547  1e-154  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3031  leucyl-tRNA synthetase  34.48 
 
 
858 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.10606  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  34.91 
 
 
865 aa  541  1e-152  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0839  leucyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 
829 aa  541  1e-152  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.435731  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1636  leucyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
805 aa  540  1e-152  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.494326  normal  0.491966 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  35.84 
 
 
856 aa  536  1e-151  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  42.07 
 
 
806 aa  539  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  34.78 
 
 
904 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3236  leucyl-tRNA synthetase  35.74 
 
 
856 aa  534  1e-150  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0459  leucyl-tRNA synthetase  43.96 
 
 
804 aa  532  1e-150  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0456991  normal  0.0638031 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
801 aa  535  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1174  leucyl-tRNA synthetase  36.21 
 
 
859 aa  531  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2912  leucyl-tRNA synthetase  34.84 
 
 
880 aa  526  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2582  leucyl-tRNA synthetase  35.36 
 
 
864 aa  527  1e-148  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60297 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3868  leucyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
857 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579289  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  41.77 
 
 
807 aa  529  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1001  leucyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
859 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.355839  normal  0.124376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1062  leucyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
859 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0109864 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
875 aa  528  1e-148  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1106  leucyl-tRNA synthetase  34.51 
 
 
884 aa  526  1e-148  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
879 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4936  leucyl-tRNA synthetase  33.87 
 
 
872 aa  523  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.130078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  35.66 
 
 
874 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0997  leucyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
859 aa  525  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.248445  normal  0.169991 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  34.31 
 
 
853 aa  524  1e-147  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3269  leucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
874 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1098  leucyl-tRNA synthetase  35.56 
 
 
859 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.77445e-09 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2863  leucyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
859 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.140087  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  35.46 
 
 
874 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  34.7 
 
 
880 aa  521  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1920  leucyl-tRNA synthetase  33.98 
 
 
865 aa  519  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl490  leucyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 
801 aa  520  1e-146  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
879 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  33.91 
 
 
861 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0098  leucyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
878 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  34.85 
 
 
859 aa  517  1e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  33.6 
 
 
872 aa  516  1e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0321  leucyl-tRNA synthetase  33.27 
 
 
862 aa  516  1e-145  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.955307  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0505  leucyl-tRNA synthetase  41.62 
 
 
806 aa  518  1e-145  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>