159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2630 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2630  Agmatine deiminase  100 
 
 
352 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0827  peptidyl-arginyl deiminase  59.71 
 
 
347 aa  432  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0810  Agmatine deiminase  59.83 
 
 
353 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.360404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3937  Agmatine deiminase  59.71 
 
 
349 aa  422  1e-117  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0591935  normal  0.116304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0694  Agmatine deiminase  56.65 
 
 
349 aa  421  1e-117  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2742  agmatine deiminase  52.03 
 
 
348 aa  365  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.337578  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1823  agmatine deiminase  50.14 
 
 
348 aa  361  9e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0706  Agmatine deiminase  51.44 
 
 
347 aa  355  7.999999999999999e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1511  Agmatine deiminase  48.4 
 
 
342 aa  346  4e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.940428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2858  agmatine deiminase  50.74 
 
 
334 aa  342  5e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.182607 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1596  Agmatine deiminase  46.75 
 
 
339 aa  337  9.999999999999999e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1604  Agmatine deiminase  47.51 
 
 
348 aa  337  9.999999999999999e-92  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1028  Agmatine deiminase  45.64 
 
 
349 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.262442  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1715  Agmatine deiminase  44.93 
 
 
349 aa  322  5e-87  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.712045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1512  hypothetical protein  44.77 
 
 
350 aa  317  1e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.26981  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0612  peptidyl-arginine deiminase  43.86 
 
 
640 aa  315  5e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.778419 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1901  peptidyl-arginine deiminase  44.77 
 
 
352 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.459054  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0940  hypothetical protein  43.15 
 
 
346 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2038  peptidyl-arginine deiminase  42.61 
 
 
639 aa  301  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1727  Agmatine deiminase  43.87 
 
 
347 aa  290  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0117  Agmatine deiminase  42.44 
 
 
351 aa  278  1e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3413  agmatine deiminase  41.81 
 
 
346 aa  272  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0034  peptidyl-arginine deiminase  39.83 
 
 
631 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137362  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0078  peptidyl-arginine deiminase  39.53 
 
 
624 aa  270  4e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0071  Agmatine deiminase  41.79 
 
 
348 aa  268  8.999999999999999e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.73105  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2455  Agmatine deiminase  40.65 
 
 
334 aa  266  5.999999999999999e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.164164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0034  peptidyl-arginine deiminase  40.41 
 
 
343 aa  259  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.714281  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1939  peptidyl-arginine deiminase  38.44 
 
 
365 aa  258  8e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  0.826102 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0005  hypothetical protein  36.29 
 
 
347 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0005  hypothetical protein  37.14 
 
 
346 aa  246  6e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1362  Agmatine deiminase  37.28 
 
 
344 aa  239  5e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2804  agmatine deiminase  37.64 
 
 
346 aa  238  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.341254 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1183  peptidyl-arginine deiminase  36.31 
 
 
370 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.460045  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5393  hypothetical protein  35.6 
 
 
368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1197  Agmatine deiminase  37.29 
 
 
356 aa  232  6e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.614919  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0383  agmatine deiminase  36.41 
 
 
368 aa  232  7.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1028  peptidylarginine deiminase-related protein  35.86 
 
 
344 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.442505  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4932  agmatine deiminase  35.14 
 
 
368 aa  231  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.803102  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1018  hypothetical protein  37.06 
 
 
341 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0337  agmatine deiminase  34.5 
 
 
368 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2176  peptidyl-arginine deiminase  37.83 
 
 
343 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1834  Agmatine deiminase  37.83 
 
 
343 aa  229  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.519602  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4942  agmatine deiminase  36.41 
 
 
368 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.470202  hitchhiker  0.00000068337 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1581  peptidyl-arginine deiminase  37.46 
 
 
355 aa  228  9e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2962  agmatine deiminase  37.84 
 
 
374 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48900  agmatine deiminase  34.57 
 
 
372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0724155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2597  Agmatine deiminase  37.79 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0204527  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0281  agmatine deiminase  35.33 
 
 
368 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0266  agmatine deiminase  35.05 
 
 
368 aa  222  7e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0291  agmatine deiminase  35.33 
 
 
368 aa  222  9e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1861  hypothetical protein  38.42 
 
 
367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.114437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03810  agmatine deiminase  33.78 
 
 
368 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.571257 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0832  agmatine deiminase  35.81 
 
 
365 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3338  agmatine deiminase  35.81 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0834  agmatine deiminase  35.81 
 
 
371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.048656  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1601  hypothetical protein  33.63 
 
 
363 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0153  agmatine deiminase  35.39 
 
 
367 aa  220  3e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0711  peptidyl-arginine deiminase  37.28 
 
 
351 aa  219  5e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0168  agmatine deiminase  35.6 
 
 
367 aa  218  8.999999999999998e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52163  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1544  agmatine deiminase  33.04 
 
 
363 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1144  agmatine deiminase  36.61 
 
 
369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.84564  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4017  agmatine deiminase  37.63 
 
 
365 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0822  peptidyl-arginine deiminase  34.83 
 
 
355 aa  216  7e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2586  Agmatine deiminase  34.37 
 
 
358 aa  215  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.729677  normal  0.275773 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3490  agmatine deiminase  35.86 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1755  agmatine deiminase  36.07 
 
 
348 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.807714  normal  0.973962 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0652  agmatine deiminase  34.05 
 
 
364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3810  agmatine deiminase  37.47 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.387298  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3203  agmatine deiminase  36.36 
 
 
348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.659757  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1443  peptidyl-arginine deiminase  38.35 
 
 
365 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0971798 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0291  agmatine deiminase  32.79 
 
 
368 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0984  Agmatine deiminase  35.29 
 
 
345 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1750  peptidyl-arginine deiminase  35.57 
 
 
350 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.355031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1013  Agmatine deiminase  35.29 
 
 
345 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1447  agmatine deiminase  36.69 
 
 
342 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.994739  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1489  agmatine deiminase  33.15 
 
 
369 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.138528  hitchhiker  0.00047454 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1203  agmatine deiminase  37.97 
 
 
332 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.111825  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0737  peptidyl-arginine deiminase  35.19 
 
 
341 aa  206  6e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00770089  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2447  peptidyl-arginine deiminase  34.37 
 
 
357 aa  205  9e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1746  Agmatine deiminase  34.02 
 
 
342 aa  205  9e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3209  agmatine deiminase  33.04 
 
 
387 aa  205  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2471  peptidyl-arginine deiminase  35.5 
 
 
343 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1172  peptidyl-arginine deiminase family protein  34.55 
 
 
325 aa  204  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1030  peptidyl-arginine deiminase  35.1 
 
 
327 aa  204  3e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.497197  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3139  agmatine deiminase  33.06 
 
 
370 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0136309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1254  peptidyl-arginine deiminase  36.09 
 
 
386 aa  203  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.145775  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0659  agmatine deiminase  33.6 
 
 
370 aa  202  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.598319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3288  agmatine deiminase  33.33 
 
 
370 aa  202  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3445  agmatine deiminase  32.17 
 
 
366 aa  202  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3465  agmatine deiminase  33.33 
 
 
370 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0672  agmatine deiminase  32.89 
 
 
371 aa  202  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.915937  decreased coverage  0.00000489111 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3505  hypothetical protein  33.63 
 
 
385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3130  agmatine deiminase  33.06 
 
 
370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0659  orotidine 5'-phosphate decarboxylase  35.93 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1202  agmatine deiminase  33.88 
 
 
368 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3497  agmatine deiminase  32.94 
 
 
385 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2402  hypothetical protein  34.32 
 
 
376 aa  200  3e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00162245  decreased coverage  0.000927611 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1751  agmatine deiminase  32.94 
 
 
385 aa  200  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17571  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1642  Agmatine deiminase  31.27 
 
 
345 aa  200  3e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.638362 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2760  agmatine deiminase  32.88 
 
 
370 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.679274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>