83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2596 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  100 
 
 
487 aa  1006    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  45.79 
 
 
704 aa  443  1e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  44.89 
 
 
704 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  45.23 
 
 
638 aa  431  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  47.25 
 
 
581 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.6 
 
 
709 aa  423  1e-117  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  42.89 
 
 
690 aa  417  9.999999999999999e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.66 
 
 
698 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.94 
 
 
688 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.04 
 
 
687 aa  363  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  38.56 
 
 
750 aa  343  5e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  37.34 
 
 
932 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  40.53 
 
 
463 aa  336  5.999999999999999e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  35.15 
 
 
606 aa  296  6e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  36.88 
 
 
470 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  33.81 
 
 
460 aa  265  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  33.81 
 
 
460 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  35.98 
 
 
410 aa  258  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  33.19 
 
 
434 aa  238  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0640  F5/8 type C domain-containing protein  28.35 
 
 
436 aa  162  2e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0652  F5/8 type C domain-containing protein  27.91 
 
 
436 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0313432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  25.9 
 
 
467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  31.61 
 
 
581 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  44 
 
 
478 aa  106  8e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  28.9 
 
 
435 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.66 
 
 
435 aa  99  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  39.58 
 
 
447 aa  98.2  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  26.84 
 
 
440 aa  96.7  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  26.97 
 
 
473 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 
441 aa  94.7  3e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  35.62 
 
 
450 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  27.53 
 
 
479 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  26.43 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  25.6 
 
 
674 aa  91.7  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  26.81 
 
 
494 aa  90.5  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  33.88 
 
 
596 aa  90.5  6e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  25.08 
 
 
429 aa  87.4  5e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  35.85 
 
 
473 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  27.65 
 
 
452 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  25.73 
 
 
429 aa  84.7  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  33.77 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  49.37 
 
 
627 aa  81.6  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  27.78 
 
 
471 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  25.94 
 
 
485 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  22.15 
 
 
474 aa  80.5  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  28.77 
 
 
711 aa  79.7  0.0000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  24.57 
 
 
340 aa  79.7  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  34.29 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  22.98 
 
 
431 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  44.16 
 
 
446 aa  67.8  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  28.21 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  44.16 
 
 
446 aa  67  0.0000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  24.33 
 
 
534 aa  65.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  32.26 
 
 
490 aa  64.7  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  28.97 
 
 
538 aa  63.5  0.000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  50.91 
 
 
212 aa  60.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  32.84 
 
 
408 aa  60.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  37.37 
 
 
495 aa  60.8  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  32.81 
 
 
463 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  30.08 
 
 
584 aa  60.1  0.0000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  37.89 
 
 
532 aa  59.7  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  32.69 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  38.71 
 
 
464 aa  59.3  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  34.38 
 
 
482 aa  57.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  35.42 
 
 
606 aa  57.4  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  35.35 
 
 
484 aa  57  0.0000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  27.63 
 
 
446 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  23.43 
 
 
644 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  32.63 
 
 
466 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  36.7 
 
 
474 aa  54.7  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.43 
 
 
1967 aa  52.4  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  31.25 
 
 
537 aa  52  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  41.54 
 
 
478 aa  50.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.52 
 
 
492 aa  50.1  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  32.63 
 
 
464 aa  49.7  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  31.48 
 
 
471 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4324  coagulation factor 5/8 type, C-terminal  28 
 
 
223 aa  48.1  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.010102  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  32.86 
 
 
731 aa  47.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  31.3 
 
 
483 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  26.47 
 
 
516 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  30.47 
 
 
555 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  31.31 
 
 
473 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  42.11 
 
 
663 aa  43.5  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>