23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2584 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  902    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  50.68 
 
 
487 aa  450  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  33.65 
 
 
483 aa  279  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  30.16 
 
 
468 aa  196  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  25.76 
 
 
454 aa  179  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  24.06 
 
 
464 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  24.67 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  22.14 
 
 
428 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  23.12 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.17 
 
 
417 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  19.9 
 
 
444 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  24.38 
 
 
489 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  18.98 
 
 
488 aa  93.6  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1274  hypothetical protein  21.71 
 
 
492 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000354045  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  18.3 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1393  hypothetical protein  19.49 
 
 
495 aa  80.1  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.00000104621  hitchhiker  0.000142618 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1366  hypothetical protein  22.56 
 
 
481 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.78 
 
 
451 aa  67  0.0000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  20.27 
 
 
457 aa  65.5  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  19.76 
 
 
495 aa  60.1  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  20.9 
 
 
518 aa  58.2  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  20.43 
 
 
544 aa  50.1  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  20.72 
 
 
513 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>