More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2582 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2582  30S ribosomal protein S16  100 
 
 		 197 aa  386  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00178967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1384  ribosomal protein S16  71.52 
 
 		 186 aa  228  4e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.227441  normal  0.758588 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0117  30S ribosomal protein S16  57.95 
 
 		 175 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.549276 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0109  30S ribosomal protein S16  67.26 
 
 		 119 aa  169  3e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2117  30S ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 192 aa  154  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.595697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0035  ribosomal protein S16  53.64 
 
 		 204 aa  151  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.173963  normal  0.182146 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04640  ribosomal protein S16  48.57 
 
 		 191 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0103  30S ribosomal protein S16  49.08 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1301  30S ribosomal protein S16  49.65 
 
 		 188 aa  135  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1328  ribosomal protein S16  48.3 
 
 		 146 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.519364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1497  30S ribosomal protein S16  59.76 
 
 		 88 aa  108  3e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.155145  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0786  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 		 90 aa  109  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  2.11078e-18  unclonable  1.2360400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1506  30S ribosomal protein S16  58.33 
 
 		 90 aa  107  1e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000148464  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07300  ribosomal protein S16  60 
 
 		 88 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.83606e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2224  30S ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 86 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98252e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1485  SSU ribosomal protein S16P  56.25 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000209071  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1154  30S ribosomal protein S16  57.14 
 
 		 91 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000677791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3886  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3667  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000528742  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3695  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000036513  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3585  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.24703e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3603  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000351748  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3858  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.93273e-63 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3943  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000144012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3982  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000152128  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3892  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000076365  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0798  SSU ribosomal protein S16P  54.76 
 
 		 96 aa  103  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000268891  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1300  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  103  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000139404  unclonable  4.2704600000000004e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1088  30S ribosomal protein S16  53.93 
 
 		 90 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000001932  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2496  30S ribosomal protein S16  52.94 
 
 		 90 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000037425  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0769  30S ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 81 aa  102  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000269081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1979  30S ribosomal protein S16  55.95 
 
 		 90 aa  102  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1028  ribosomal protein S16  45.53 
 
 		 208 aa  101  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1197  30S ribosomal protein S16  57.32 
 
 		 88 aa  101  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00460539  normal  0.0958126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1358  30S ribosomal protein S16  54.65 
 
 		 90 aa  101  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000511359  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3760  30S ribosomal protein S16  53.57 
 
 		 88 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0113592  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1417  ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  100  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000010648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1524  30S ribosomal protein S16  44.64 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000501914  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1634  ribosomal protein S16  56.41 
 
 		 96 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2309  ribosomal protein S16  62.03 
 
 		 82 aa  99.8  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000155548  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1712  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 86 aa  99.4  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1388  SSU ribosomal protein S16P  57.5 
 
 		 85 aa  99.4  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0159057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3493  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 88 aa  98.6  5e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.18951e-29 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3431  30S ribosomal protein S16  56.96 
 
 		 88 aa  98.6  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000117102  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1663  30S ribosomal protein S16  52.38 
 
 		 90 aa  98.6  6e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000254638  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1352  ribosomal protein S16  48.81 
 
 		 91 aa  97.4  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000135994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2871  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  97.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000408452  hitchhiker  0.000000516516 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2450  30S ribosomal protein S16  55 
 
 		 87 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000801266  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1098  30S ribosomal protein S16  56.25 
 
 		 85 aa  97.4  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00129235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0710  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  97.1  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000278806  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1369  SSU ribosomal protein S16P  56.25 
 
 		 82 aa  96.7  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000301445  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1378  ribosomal protein S16  60 
 
 		 81 aa  96.7  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000172433  normal  0.497883 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0966  30S ribosomal protein S16  40.31 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000085544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3763  30S ribosomal protein S16  55.7 
 
 		 88 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000744609  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1416  ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 82 aa  95.5  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000269941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2997  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 86 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.00000265446  normal  0.805241 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3039  ribosomal protein S16  57.69 
 
 		 86 aa  95.5  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000430382  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2055  ribosomal protein S16  57.5 
 
 		 89 aa  95.5  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000864984  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1398  30S ribosomal protein S16  42.11 
 
 		 133 aa  94.4  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000212857  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1292  30S ribosomal protein S16  37.31 
 
 		 134 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000777064  normal  0.783471 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0656  ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 92 aa  92.8  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0001625  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0643  30S ribosomal protein S16  56.58 
 
 		 95 aa  92.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144131  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0320  ribosomal protein S16  51.85 
 
 		 111 aa  92.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000084035  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0967  SSU ribosomal protein S16P  51.9 
 
 		 90 aa  92.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1492  30S ribosomal protein S16  52.56 
 
 		 136 aa  92  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990353  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0804  30S ribosomal protein S16  56.79 
 
 		 91 aa  91.7  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525288  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10970  SSU ribosomal protein S16P  58.67 
 
 		 81 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000033138  unclonable  0.00000000137998 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3352  30S ribosomal protein S16  58.44 
 
 		 120 aa  89.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.238376 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1463  30S ribosomal protein S16  55.29 
 
 		 122 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.190646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0804  30S ribosomal protein S16  41.96 
 
 		 136 aa  89.7  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1015  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 135 aa  89.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000242274  normal  0.999781 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4621  ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000355382  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3616  30S ribosomal protein S16  56.1 
 
 		 120 aa  89  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0072517 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2657  30S ribosomal protein S16  58.54 
 
 		 154 aa  89  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1966  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  88.6  5e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.408162  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1684  30S ribosomal protein S16  52.5 
 
 		 81 aa  88.6  5e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000195322  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3682  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 119 aa  88.6  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.442815  hitchhiker  0.00533118 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0688  ribosomal protein S16  52 
 
 		 128 aa  88.2  7e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000224694  hitchhiker  0.000468142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1537  ribosomal protein S16  54.55 
 
 		 93 aa  88.2  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000163425  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1322  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 91 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000033965  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1805  30S ribosomal protein S16  50.63 
 
 		 95 aa  87.8  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000294952  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0632  30S ribosomal protein S16  54.88 
 
 		 120 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.479979 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1297  30S ribosomal protein S16  53.09 
 
 		 91 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000043058  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2982  30S ribosomal protein S16  51.76 
 
 		 122 aa  87  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.117081 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1303  ribosomal protein S16  47.5 
 
 		 81 aa  86.7  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0170665  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0968  30S ribosomal protein S16  51.25 
 
 		 81 aa  86.7  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000054377  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0653  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 120 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  0.112542 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0664  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 120 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0505631 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1052  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 153 aa  86.7  2e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2888  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 119 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0568  30S ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  85.9  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000021123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0509  30S ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 107 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_507  ribosomal protein S16  50 
 
 		 82 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.0000000000000394154  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0245  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 106 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0352  30S ribosomal protein S16  53.66 
 
 		 110 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.250559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2855  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 86 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.888184  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2181  30S ribosomal protein S16  51.28 
 
 		 168 aa  85.5  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.20607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2476  30S ribosomal protein S16  53.25 
 
 		 86 aa  85.1  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2727  ribosomal protein S16  52.44 
 
 		 201 aa  85.1  6e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1226  30S ribosomal protein S16  46.99 
 
 		 95 aa  85.1  6e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000587393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>