More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2515 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2515  MATE efflux family protein  100 
 
 		 442 aa  888    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09173  MATE efflux family protein  37.99 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7238  MATE efflux family protein  37.07 
 
 		 450 aa  286  4e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2156  MATE efflux family protein  36.45 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.540946 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5025  MATE efflux family protein  35.9 
 
 		 461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.274377  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  34.01 
 
 		 454 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1767  MATE efflux family protein  34.09 
 
 		 462 aa  252  1e-65  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1494  MATE efflux family protein  37.38 
 
 		 451 aa  249  7e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6519  MATE efflux family protein  33.41 
 
 		 466 aa  234  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0650  MATE efflux family protein  32.36 
 
 		 458 aa  231  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0440  MATE efflux family protein  31.69 
 
 		 470 aa  228  1e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.589921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1935  MATE efflux family protein  32.68 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.18016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1019  MATE efflux family protein  32.88 
 
 		 474 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0355  putative multidrug resistance protein NorM  30.87 
 
 		 471 aa  221  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277827  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0339  multidrug resistance protein NorM, putative  30.87 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0755  MATE efflux family protein  32.95 
 
 		 456 aa  220  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0124459  normal  0.621342 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1736  MATE efflux family protein  33.56 
 
 		 472 aa  219  7e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.282832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1750  multidrug efflux protein  31.08 
 
 		 457 aa  218  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000919244  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1680  multidrug efflux protein  32.5 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2579  multidrug efflux protein  31.08 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.966509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1856  multidrug efflux protein  31.08 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1146  multidrug efflux protein  31.39 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.292586  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003524  multidrug efflux protein NorM  33.11 
 
 		 456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1783  multidrug efflux protein  31.35 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00383484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2391  multidrug efflux protein  32.27 
 
 		 457 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.346064  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02236  multidrug efflux protein  31.91 
 
 		 456 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2189  multidrug efflux protein  32 
 
 		 458 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00321419  hitchhiker  0.00000631963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 451 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  33.63 
 
 		 453 aa  209  1e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1907  MATE efflux family protein  33.19 
 
 		 457 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0742597  normal  0.100602 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  33.41 
 
 		 451 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2675  multidrug efflux protein  32.04 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01634  multidrug efflux protein NorM  32.87 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.900215  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3887  multi anti extrusion protein MatE  30.97 
 
 		 466 aa  206  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0845713 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1712  multidrug efflux protein  31.81 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01624  hypothetical protein  32.87 
 
 		 457 aa  207  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1743  multidrug efflux protein  32.87 
 
 		 457 aa  206  5e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000609014  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1382  multidrug efflux protein  31.01 
 
 		 460 aa  206  5e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.13512  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1966  multidrug efflux protein  32.87 
 
 		 457 aa  206  5e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000267108 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1749  multidrug efflux protein  32.96 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000456858  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1521  multidrug efflux protein  32.96 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0251273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1558  multidrug efflux protein  32.96 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1918  multidrug efflux protein  32.96 
 
 		 457 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00462926  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1977  MATE efflux family protein  32.64 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000001739  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1861  multidrug efflux protein  32.64 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000216071  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2376  multidrug efflux protein  32.64 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000568736  normal  0.0171948 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  32.2 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4308  MATE efflux family protein  31 
 
 		 470 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1535  multidrug efflux protein  32.96 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1534  multidrug efflux protein  32.64 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00445038  hitchhiker  0.00117159 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1877  multidrug efflux protein  32.64 
 
 		 457 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000154294  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3112  multidrug efflux protein  29.77 
 
 		 465 aa  202  7e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1277  MATE efflux family protein  30.85 
 
 		 480 aa  202  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2346  MATE efflux family protein  30.73 
 
 		 460 aa  202  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00458496 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  30.93 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  30.93 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  30.93 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  30.93 
 
 		 453 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2939  multidrug resistance protein  32.24 
 
 		 468 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000251457  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1263  MATE efflux family protein  33.26 
 
 		 467 aa  201  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0813234  normal  0.914064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1856  multidrug efflux protein  29.41 
 
 		 455 aa  199  6e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.30191  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1930  MATE efflux family protein  30.68 
 
 		 460 aa  199  6e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.135248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1686  multidrug resistance protein NorM, putative  32.24 
 
 		 464 aa  199  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.712622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  31.01 
 
 		 477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1298  MATE efflux family protein  32.28 
 
 		 467 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0967  MATE efflux family protein  31.92 
 
 		 462 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.932307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  31.01 
 
 		 477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1541  multidrug efflux protein  30.45 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.1514  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2511  multidrug efflux pump NorM  32.02 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0112614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2885  multidrug efflux pump NorM  32.02 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.132426  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1835  multidrug efflux pump NorM  32.02 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143849  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0502  multidrug resistance protein NorM, putative  32.02 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00841305  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2770  multidrug efflux pump NorM  32.02 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00327808  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0971  MATE efflux family protein  31.7 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2824  Na+-driven multidrug efflux pump  32.02 
 
 		 468 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338684  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  30.93 
 
 		 453 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1709  MATE efflux family protein  31.79 
 
 		 470 aa  196  7e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578822 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0014  putative multidrug resistance protein norM  34.16 
 
 		 460 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4204  multi anti extrusion protein MatE  32.28 
 
 		 462 aa  196  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0638116  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  29.57 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1050  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2212  MATE efflux family protein  32.51 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.520618  normal  0.988059 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2117  MATE efflux family protein  30.22 
 
 		 458 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0110658  normal  0.0465778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  29.77 
 
 		 452 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0612  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1091  MATE efflux family protein  32.14 
 
 		 462 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.427191  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2268  MATE efflux family protein  28.6 
 
 		 452 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.012169  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0797  MATE efflux family protein  32.46 
 
 		 463 aa  193  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.158372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1041  multi anti extrusion protein MatE  32.68 
 
 		 470 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29880  Multidrug efflux protein  31.67 
 
 		 459 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2494  MATE efflux family protein  28.51 
 
 		 458 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.121522  hitchhiker  0.0012501 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1304  multidrug efflux protein  30.91 
 
 		 452 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0387  multidrug efflux protein  30.26 
 
 		 457 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0273741  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  29.77 
 
 		 452 aa  190  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3141  MATE efflux family protein  31.6 
 
 		 472 aa  190  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.565795  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2226  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 459 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00326481  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0260  MATE efflux family protein  32.1 
 
 		 478 aa  189  8e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2943  MATE efflux family protein  32.03 
 
 		 470 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2144  MATE efflux family protein  29.35 
 
 		 459 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00844779  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  30.38 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>