More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2503 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_0706  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000238299  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1595  glutaminyl-tRNA synthetase  58.33 
 
 
562 aa  650    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000811863  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00637  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2957  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0517  glutaminyl-tRNA synthetase  57.27 
 
 
556 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3366  glutaminyl-tRNA synthetase  57.14 
 
 
554 aa  639    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2904  glutaminyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
567 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.781654 
 
 
-
 
NC_002950  PG1951  glutaminyl-tRNA synthetase  58.59 
 
 
566 aa  640    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2363  glutaminyl-tRNA synthetase  68.12 
 
 
570 aa  793    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.621285 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0242  glutaminyl-tRNA synthetase  68.61 
 
 
555 aa  805    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00628  hypothetical protein  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3743  glutaminyl-tRNA synthetase  58.72 
 
 
569 aa  653    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0260392  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0841  glutaminyl-tRNA synthetase  58.51 
 
 
555 aa  667    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1485  glutaminyl-tRNA synthetase  59.86 
 
 
569 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1734  glutaminyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
564 aa  651    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.112324  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004127  glutaminyl-tRNA synthetase  58.32 
 
 
556 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000085379  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4500  glutaminyl-tRNA synthetase  59.08 
 
 
563 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.111687  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0745  glutaminyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
555 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.794095  normal  0.613987 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2109  glutaminyl-tRNA synthetase  55.37 
 
 
557 aa  637    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.831991  hitchhiker  0.000255722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3882  glutaminyl-tRNA synthetase  55.48 
 
 
565 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1843  glutaminyl-tRNA synthetase  55.56 
 
 
559 aa  642    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311784  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2787  glutaminyl-tRNA synthetase  57.4 
 
 
567 aa  644    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0805  glutaminyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
555 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.112626  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3639  glutaminyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
566 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.193855 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2879  glutaminyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
567 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0101  glutaminyl-tRNA synthetase  59.75 
 
 
572 aa  684    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3791  glutaminyl-tRNA synthetase  59.82 
 
 
565 aa  655    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0570  glutaminyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
554 aa  661    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.011441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0773  glutaminyl-tRNA synthetase  58.88 
 
 
554 aa  662    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0411639  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3509  glutaminyl-tRNA synthetase  58.29 
 
 
561 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.271227  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0267  glutaminyl-tRNA synthetase  59.71 
 
 
587 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  62.12 
 
 
568 aa  711    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.16998  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4167  glutaminyl-tRNA synthetase  57.9 
 
 
568 aa  663    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2940  glutaminyl-tRNA synthetase  56.47 
 
 
552 aa  635    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0919452  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1133  glutaminyl-tRNA synthetase  58.85 
 
 
579 aa  696    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.613915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0792  glutaminyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
555 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.674612  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03410  glutaminyl-tRNA synthetase  60.33 
 
 
555 aa  670    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2811  glutaminyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 
561 aa  657    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.129668  normal  0.859959 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1596  glutaminyl-tRNA synthetase  57.32 
 
 
557 aa  646    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0189  glutaminyl-tRNA synthetase  59.64 
 
 
561 aa  679    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.360973  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0702  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.237561  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2452  glutaminyl-tRNA synthetase  58.53 
 
 
559 aa  660    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930191  normal  0.727818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2406  glutaminyl-tRNA synthetase  57.77 
 
 
567 aa  645    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2503  glutaminyl-tRNA synthetase  100 
 
 
556 aa  1164    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00970277  normal  0.785784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3251  glutaminyl-tRNA synthetase  57.71 
 
 
560 aa  665    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1116  glutaminyl-tRNA synthetase  57.74 
 
 
552 aa  650    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1205  glutaminyl-tRNA synthetase  56.93 
 
 
552 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00285651  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1012  glutaminyl-tRNA synthetase  61.15 
 
 
705 aa  703    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1229  glutaminyl-tRNA synthetase  57.43 
 
 
554 aa  650    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0152842  normal  0.0951842 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2841  glutaminyl-tRNA synthetase  56.81 
 
 
561 aa  655    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.602815 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0417  glutaminyl-tRNA synthetase  58.87 
 
 
570 aa  662    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0725  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.769137  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1710  glutaminyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 
558 aa  645    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2976  glutaminyl-tRNA synthetase  59.06 
 
 
554 aa  663    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2572  glutaminyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 
555 aa  669    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0923139  hitchhiker  0.00019462 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3799  glutaminyl-tRNA synthetase  55.83 
 
 
565 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.105698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23520  glutaminyl-tRNA synthetase  59.2 
 
 
555 aa  656    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0832  glutaminyl-tRNA synthetase  57.59 
 
 
552 aa  651    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.551071  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0626  glutaminyl-tRNA synthetase  57.98 
 
 
552 aa  646    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00799923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0612  glutaminyl-tRNA synthetase  58.17 
 
 
552 aa  647    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000113459  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4241  glutaminyl-tRNA synthetase  70.45 
 
 
564 aa  837    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1384  glutaminyl-tRNA synthetase  59.34 
 
 
563 aa  660    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.559394 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1195  glutaminyl-tRNA synthetase  58.15 
 
 
555 aa  664    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.068426  decreased coverage  0.0000265755 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2459  glutaminyl-tRNA synthetase  60.07 
 
 
589 aa  672    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3516  glutaminyl-tRNA synthetase  60.58 
 
 
564 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.953083  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0917  glutaminyl-tRNA synthetase  61.89 
 
 
580 aa  691    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0733  glutaminyl-tRNA synthetase  58.7 
 
 
555 aa  669    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41380  glutaminyl-tRNA synthetase  58.47 
 
 
556 aa  649    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01337  glutaminyl-tRNA synthetase  57.22 
 
 
556 aa  653    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3486  glutaminyl-tRNA synthetase  61.17 
 
 
565 aa  677    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.409047  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2083  glutaminyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 
565 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2184  glutaminyl-tRNA synthetase  55.5 
 
 
558 aa  634  1e-180  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.213652  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3126  glutaminyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
552 aa  634  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0016183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6655  glutaminyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
583 aa  629  1e-179  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204769  normal  0.445852 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0421  glutaminyl-tRNA synthetase  57.48 
 
 
559 aa  630  1e-179  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2907  glutaminyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 
555 aa  627  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.483628  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4882  glutaminyl-tRNA synthetase  56.86 
 
 
540 aa  626  1e-178  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0058  glutaminyl-tRNA synthetase  56.75 
 
 
553 aa  626  1e-178  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2994  glutaminyl-tRNA synthetase  55.92 
 
 
555 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1725  glutaminyl-tRNA synthetase  56.78 
 
 
565 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.153622  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1902  glutaminyl-tRNA synthetase  56.83 
 
 
590 aa  626  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000991205  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0326  glutaminyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 
555 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000088467  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0682  glutaminyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
582 aa  622  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  normal  0.476969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0791  glutaminyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
580 aa  620  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00535923  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0833  glutaminyl-tRNA synthetase  53.87 
 
 
609 aa  619  1e-176  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227422  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01892  glutaminyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
555 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00449379  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2052  glutaminyl-tRNA synthetase  55.84 
 
 
576 aa  619  1e-176  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.26884  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0818  glutaminyl-tRNA synthetase  53.35 
 
 
582 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0602034 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0895  glutaminyl-tRNA synthetase  56.2 
 
 
548 aa  620  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1270  glutaminyl-tRNA synthetase  52.54 
 
 
551 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1269  glutaminyl-tRNA synthetase  52.72 
 
 
551 aa  615  1e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0850  glutaminyl-tRNA synthetase  53.81 
 
 
565 aa  616  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.750586 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2128  glutaminyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 
558 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.116661  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0681  glutaminyl-tRNA synthetase  55.09 
 
 
748 aa  617  1e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.480313  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0807  glutaminyl-tRNA synthetase  52.43 
 
 
576 aa  617  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0536  glutaminyl-tRNA synthetase  55.94 
 
 
556 aa  616  1e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04610  glutaminyl-tRNA synthetase  53.11 
 
 
579 aa  616  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.959469  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1249  glutaminyl-tRNA synthetase  56.04 
 
 
777 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0737  glutaminyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
576 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2599  glutaminyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 
778 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0790772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>