More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2432 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 511 aa  1028    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  77.35 
 
 		 514 aa  791    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  63.09 
 
 		 539 aa  630  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  59.92 
 
 		 525 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  59.35 
 
 		 525 aa  593  1e-168  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  57.89 
 
 		 526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  59.21 
 
 		 498 aa  570  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2995  major facilitator superfamily MFS_1  58.88 
 
 		 494 aa  539  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000112139  normal  0.562927 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  49.63 
 
 		 552 aa  495  1e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  48.08 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  49.91 
 
 		 552 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  50.83 
 
 		 564 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  49.09 
 
 		 552 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  50.74 
 
 		 564 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  48.91 
 
 		 567 aa  481  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  47.79 
 
 		 552 aa  482  1e-135  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  49.54 
 
 		 564 aa  482  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  47.59 
 
 		 558 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  48.15 
 
 		 553 aa  484  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  50 
 
 		 554 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  48.07 
 
 		 556 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  47.37 
 
 		 565 aa  478  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  48.1 
 
 		 567 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  47.18 
 
 		 557 aa  475  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  47.82 
 
 		 565 aa  477  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  48.26 
 
 		 554 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  47.6 
 
 		 552 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  47.99 
 
 		 552 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  49.17 
 
 		 554 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 552 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  48.61 
 
 		 560 aa  472  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  47.98 
 
 		 552 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  48.26 
 
 		 552 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  48.27 
 
 		 561 aa  469  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 556 aa  471  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  49.54 
 
 		 568 aa  470  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  47.59 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  47.79 
 
 		 552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  45.37 
 
 		 574 aa  470  1.0000000000000001e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  47.7 
 
 		 552 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  47.63 
 
 		 552 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  47.7 
 
 		 552 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  50.38 
 
 		 554 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  48.72 
 
 		 487 aa  464  1e-129  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  46.95 
 
 		 552 aa  463  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  47.43 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  46.91 
 
 		 573 aa  456  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  46.65 
 
 		 549 aa  454  1.0000000000000001e-126  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  45.49 
 
 		 563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  46.42 
 
 		 563 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  46.51 
 
 		 563 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  47.42 
 
 		 563 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  46.59 
 
 		 563 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0984  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.829965  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  47.64 
 
 		 559 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  47.64 
 
 		 558 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  49.62 
 
 		 541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  47.16 
 
 		 557 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  46 
 
 		 568 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  47.8 
 
 		 556 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  43.82 
 
 		 563 aa  434  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  46.05 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  44.72 
 
 		 539 aa  433  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  44.72 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  45.8 
 
 		 553 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  45.76 
 
 		 540 aa  429  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  44.53 
 
 		 539 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  47.87 
 
 		 558 aa  426  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  44.07 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2497  major facilitator superfamily MFS_1  45.04 
 
 		 562 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2565  major facilitator transporter  45.13 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2788  major facilitator superfamily MFS_1  45.13 
 
 		 578 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  43.46 
 
 		 554 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6348  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 577 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  57.18 
 
 		 628 aa  404  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  45.18 
 
 		 539 aa  402  1e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  44.42 
 
 		 539 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  56.34 
 
 		 628 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5178  major facilitator transporter  44.03 
 
 		 577 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  42.44 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  59.16 
 
 		 567 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  59.94 
 
 		 556 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  41.49 
 
 		 527 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  58.16 
 
 		 629 aa  387  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  50.12 
 
 		 632 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  57.62 
 
 		 625 aa  384  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  49.88 
 
 		 632 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1082  major facilitator family transporter  57.36 
 
 		 468 aa  378  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1299  major facilitator family transporter  56.13 
 
 		 468 aa  375  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.5876  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  55.21 
 
 		 468 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1953  general substrate transporter  41.3 
 
 		 544 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  53.31 
 
 		 627 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3784  major facilitator transporter  41.71 
 
 		 533 aa  366  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>