More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2381 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  100 
 
 		 407 aa  828    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  48.64 
 
 		 555 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  50.83 
 
 		 330 aa  294  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  47.71 
 
 		 315 aa  272  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  49.12 
 
 		 308 aa  270  4e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  39.68 
 
 		 674 aa  229  7e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  35.59 
 
 		 1103 aa  223  6e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  37.46 
 
 		 598 aa  209  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  34.42 
 
 		 944 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  39.03 
 
 		 323 aa  177  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  34.25 
 
 		 623 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  30.68 
 
 		 574 aa  151  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  33.1 
 
 		 318 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  33.22 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  34.27 
 
 		 309 aa  139  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  31 
 
 		 301 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  32.12 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  35.62 
 
 		 546 aa  119  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  31.39 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  31.02 
 
 		 341 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  31.02 
 
 		 384 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  31.08 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  29.07 
 
 		 346 aa  113  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  37.09 
 
 		 528 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  30.66 
 
 		 386 aa  110  3e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.85 
 
 		 342 aa  111  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  37.23 
 
 		 424 aa  110  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  30 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  32.25 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  29.24 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  33.09 
 
 		 319 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  30.23 
 
 		 325 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  29.6 
 
 		 346 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  28.01 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  29.35 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  34.13 
 
 		 533 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.9 
 
 		 579 aa  103  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  26.75 
 
 		 323 aa  103  5e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  33.49 
 
 		 531 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  30.71 
 
 		 529 aa  102  9e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  35.53 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  30.38 
 
 		 552 aa  102  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  33.03 
 
 		 491 aa  100  3e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  34.31 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  31.25 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  32.59 
 
 		 603 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.41 
 
 		 571 aa  97.8  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  33.5 
 
 		 549 aa  97.1  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  32.88 
 
 		 549 aa  95.9  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  32.63 
 
 		 503 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  35.14 
 
 		 552 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  32.56 
 
 		 563 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  27.24 
 
 		 319 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  35.14 
 
 		 552 aa  94.7  2e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  38.46 
 
 		 548 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.62 
 
 		 529 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0686  peptidase M28  33 
 
 		 391 aa  94  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  31.7 
 
 		 506 aa  93.6  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  32.54 
 
 		 550 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  35.75 
 
 		 558 aa  93.2  7e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  31.7 
 
 		 541 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  31.7 
 
 		 541 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  31.56 
 
 		 532 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  33.33 
 
 		 549 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.11 
 
 		 540 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  31.56 
 
 		 540 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  31.25 
 
 		 541 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  31.56 
 
 		 540 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  34.31 
 
 		 552 aa  90.1  6e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  27.54 
 
 		 341 aa  90.1  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  27.87 
 
 		 325 aa  90.1  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  30.83 
 
 		 528 aa  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  34.8 
 
 		 558 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  31.36 
 
 		 548 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  33.82 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.83 
 
 		 553 aa  88.2  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  34.95 
 
 		 557 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  34.33 
 
 		 558 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  34.33 
 
 		 558 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.91 
 
 		 545 aa  87.8  3e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  34.63 
 
 		 522 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  31.94 
 
 		 546 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  31.75 
 
 		 547 aa  86.7  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  34.31 
 
 		 569 aa  86.7  7e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  34.95 
 
 		 557 aa  86.7  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  34.95 
 
 		 557 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  35.06 
 
 		 542 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.89 
 
 		 551 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  35.71 
 
 		 556 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  29.22 
 
 		 539 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  34.52 
 
 		 555 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  33.83 
 
 		 552 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  33.48 
 
 		 506 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  29.38 
 
 		 552 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  32.42 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  28.76 
 
 		 532 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  36.09 
 
 		 597 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  30.32 
 
 		 529 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2164  peptidase M28  29.74 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.502107  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  33.15 
 
 		 550 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>