54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2374 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  43.5 
 
 		 1039 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  100 
 
 		 968 aa  1994    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  29.87 
 
 		 919 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  28.47 
 
 		 911 aa  369  1e-100  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  28.45 
 
 		 909 aa  299  2e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  25.6 
 
 		 960 aa  273  1e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  27 
 
 		 951 aa  260  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  25.42 
 
 		 969 aa  259  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  25.42 
 
 		 969 aa  259  2e-67  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  24.35 
 
 		 984 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  24.04 
 
 		 997 aa  160  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  26.27 
 
 		 1000 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1100 aa  149  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  23.73 
 
 		 780 aa  99.4  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  22.33 
 
 		 781 aa  97.4  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  21.53 
 
 		 803 aa  84  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  22.5 
 
 		 786 aa  83.2  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  22.61 
 
 		 794 aa  72  0.00000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  22.49 
 
 		 781 aa  68.6  0.0000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  21.05 
 
 		 788 aa  64.7  0.000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  21.09 
 
 		 957 aa  64.7  0.000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  21.05 
 
 		 788 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0840  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.63 
 
 		 1048 aa  62.8  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.564215  hitchhiker  0.00099262 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  21.21 
 
 		 788 aa  61.6  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  24.76 
 
 		 1049 aa  59.3  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  23.72 
 
 		 962 aa  58.5  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3435  hypothetical protein  25 
 
 		 1018 aa  57.4  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  22.29 
 
 		 951 aa  56.2  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1066  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 		 1048 aa  53.9  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  22.61 
 
 		 947 aa  53.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1049 aa  52.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3299  double-strand break repair protein AddB  22.22 
 
 		 1015 aa  52.4  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1998  helicase  25.15 
 
 		 993 aa  52  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138335  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  20.56 
 
 		 1054 aa  50.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  23.05 
 
 		 1001 aa  50.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3437  double-strand break repair helicase AddB  22.46 
 
 		 988 aa  49.7  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  20.25 
 
 		 896 aa  48.9  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3424  ATP-dependent nuclease subunit B  19.64 
 
 		 1171 aa  48.9  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2132  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V subunit B  22.56 
 
 		 976 aa  48.9  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.687537 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.29 
 
 		 1048 aa  48.5  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  19.16 
 
 		 1043 aa  48.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  25.93 
 
 		 1051 aa  48.1  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2115  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.95 
 
 		 957 aa  48.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  24.69 
 
 		 1095 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  22.81 
 
 		 991 aa  47.8  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3583  hypothetical protein  19.42 
 
 		 853 aa  47.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0256387  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  22.3 
 
 		 991 aa  47  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  22.56 
 
 		 922 aa  47  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  20.78 
 
 		 1040 aa  47  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  20.77 
 
 		 1037 aa  45.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  22.39 
 
 		 1049 aa  45.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  23.09 
 
 		 1135 aa  44.7  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.74 
 
 		 1016 aa  44.7  0.009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0757  hypothetical protein  26.99 
 
 		 259 aa  44.7  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>