More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2251 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  100 
 
 
432 aa  895    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  32.7 
 
 
433 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  33.81 
 
 
447 aa  209  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  33 
 
 
414 aa  203  5e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  32.82 
 
 
427 aa  201  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  32.5 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  31.13 
 
 
422 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  30.32 
 
 
445 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  31.71 
 
 
420 aa  192  7e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  31.46 
 
 
420 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  31.06 
 
 
424 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  31.08 
 
 
424 aa  188  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  33.25 
 
 
420 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  33.25 
 
 
420 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  31.75 
 
 
420 aa  186  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  32.11 
 
 
426 aa  186  8e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  31.94 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  33.24 
 
 
370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  31.5 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  33.68 
 
 
438 aa  183  4.0000000000000006e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  33.17 
 
 
418 aa  180  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  30.28 
 
 
408 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  30.05 
 
 
406 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  30.07 
 
 
440 aa  177  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  28.21 
 
 
405 aa  173  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  28.09 
 
 
405 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  27.27 
 
 
405 aa  171  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  30.55 
 
 
408 aa  171  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  28.16 
 
 
414 aa  169  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  29.27 
 
 
417 aa  169  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  31.12 
 
 
424 aa  169  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  29.12 
 
 
427 aa  165  1.0000000000000001e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  31.81 
 
 
410 aa  165  1.0000000000000001e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  29.74 
 
 
613 aa  164  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  29.07 
 
 
407 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  31.36 
 
 
395 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  31.88 
 
 
395 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  31.38 
 
 
395 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  27.43 
 
 
399 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  31.03 
 
 
395 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  29.8 
 
 
402 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  30.23 
 
 
454 aa  158  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  28.43 
 
 
399 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  27.94 
 
 
423 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  28.33 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  27.46 
 
 
411 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  29.09 
 
 
414 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  29.17 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  29.17 
 
 
401 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  29.17 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  28.57 
 
 
426 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  29.91 
 
 
438 aa  147  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  27.78 
 
 
430 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  27.61 
 
 
431 aa  146  6e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  27.98 
 
 
415 aa  146  9e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  28.21 
 
 
422 aa  146  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  27.92 
 
 
407 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  25.76 
 
 
431 aa  144  3e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  28.26 
 
 
425 aa  144  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  25.81 
 
 
412 aa  143  7e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  28.29 
 
 
407 aa  142  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  29.38 
 
 
397 aa  142  9.999999999999999e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  28.54 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  26.45 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  26.68 
 
 
435 aa  140  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  26.95 
 
 
407 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  28.43 
 
 
438 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  28.04 
 
 
409 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  28 
 
 
418 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  25.65 
 
 
411 aa  136  7.000000000000001e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  27.81 
 
 
382 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  25.31 
 
 
411 aa  132  9e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  26.39 
 
 
397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  30.45 
 
 
389 aa  132  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  27.2 
 
 
452 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  27.16 
 
 
401 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  27.58 
 
 
436 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  25.54 
 
 
393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3462  beta-lactamase  28.98 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00219099  normal  0.0121501 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  28.17 
 
 
419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  27.07 
 
 
401 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  27.44 
 
 
440 aa  127  5e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  30.28 
 
 
437 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  25.71 
 
 
393 aa  125  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  25.81 
 
 
444 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  26.51 
 
 
398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  26.51 
 
 
398 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  28.5 
 
 
395 aa  125  2e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  27.41 
 
 
430 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  25.27 
 
 
404 aa  123  5e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2728  beta-lactamase  29.83 
 
 
387 aa  123  5e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.144324 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  26.51 
 
 
401 aa  123  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  27.37 
 
 
397 aa  122  9.999999999999999e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  26.53 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  25.12 
 
 
468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  26.5 
 
 
428 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  26.29 
 
 
398 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1441  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  29.14 
 
 
395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00263583  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0093  beta-lactamase, putative  26.29 
 
 
375 aa  119  9e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  25.2 
 
 
396 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>