More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2246 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1084 aa  2222    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4198  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.06 
 
 
1185 aa  400  9.999999999999999e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.996958 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
776 aa  392  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
776 aa  389  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.69 
 
 
1535 aa  357  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0717  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.16 
 
 
641 aa  355  2e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5571  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  46.59 
 
 
1218 aa  352  3e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273526  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2241  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.23 
 
 
657 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4352  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.89 
 
 
1287 aa  321  3.9999999999999996e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.06083 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6399  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.83 
 
 
1361 aa  320  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.191888  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.27 
 
 
1406 aa  320  1e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4112  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.64 
 
 
639 aa  318  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5252  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  39.92 
 
 
1698 aa  317  9.999999999999999e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.99 
 
 
1501 aa  315  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3018  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.07 
 
 
1371 aa  311  4e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.980757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5679  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.03 
 
 
845 aa  311  5e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.304618  normal  0.613324 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.27 
 
 
657 aa  311  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.435635  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  41.06 
 
 
1152 aa  308  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5434  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 
539 aa  308  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.489177  normal  0.0484799 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.47 
 
 
866 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6439  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
776 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.249109  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6406  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
528 aa  304  7.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0853653  normal  0.114934 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1391  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
526 aa  303  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.444347  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 
844 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1750  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.77 
 
 
660 aa  302  2e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.72 
 
 
816 aa  301  6e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5658  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
528 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568926  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
530 aa  300  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.766371  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4915  PAS  34.17 
 
 
1384 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.11 
 
 
844 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.93 
 
 
529 aa  297  7e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.17892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5085  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
530 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3193  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  34.54 
 
 
1380 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.112764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.02 
 
 
1223 aa  296  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1490  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.26 
 
 
835 aa  295  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.19 
 
 
1408 aa  292  3e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0091  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.16 
 
 
930 aa  290  8e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00954137  normal  0.993222 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  39.15 
 
 
547 aa  290  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
1261 aa  290  1e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
906 aa  288  2.9999999999999996e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1400  PAS sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
938 aa  287  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
659 aa  284  5.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.47344  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.6 
 
 
664 aa  281  6e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
869 aa  280  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0521  multi sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
1344 aa  279  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3250  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  33.53 
 
 
1348 aa  278  4e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.534329  normal  0.0270765 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  25.8 
 
 
1629 aa  276  1.0000000000000001e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
1068 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1404  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  36.77 
 
 
1759 aa  275  4.0000000000000004e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2356  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 
764 aa  274  6e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.736998  normal  0.0891785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1597  histidine kinase  40.96 
 
 
537 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0756537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3143  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
652 aa  271  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.417887  normal  0.0487579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.35 
 
 
1453 aa  271  5.9999999999999995e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.24 
 
 
652 aa  270  1e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.950985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2929  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.84 
 
 
623 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.850341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.79 
 
 
1088 aa  270  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2210  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
633 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00664902  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4054  histidine kinase  41.51 
 
 
551 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.36 
 
 
1002 aa  266  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1601  CheB methylesterase, CheR methyltransferase, hybrid histidine kinase  38.37 
 
 
1222 aa  265  4e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.472526  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1520  signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  34.6 
 
 
1303 aa  264  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.124967  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  34.93 
 
 
659 aa  261  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1737  histidine kinase  42.94 
 
 
633 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.181813  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1664  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.38 
 
 
633 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0956689  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
768 aa  259  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5630  histidine kinase  41.62 
 
 
714 aa  258  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.11737 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0397  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.62 
 
 
755 aa  258  4e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.243308 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.23 
 
 
761 aa  258  5e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.170014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1658  histidine kinase  40 
 
 
518 aa  255  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2484  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.97 
 
 
761 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.55775  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0372  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  37.41 
 
 
1233 aa  254  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5975  histidine kinase  40 
 
 
524 aa  253  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.005421  normal  0.414836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3275  PAS sensor protein  33.26 
 
 
1015 aa  253  2e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.991698  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 
1297 aa  252  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0072  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.9 
 
 
568 aa  252  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516402 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
680 aa  251  4e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6390  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
770 aa  251  5e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.186908 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6252  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.84 
 
 
730 aa  250  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.996582  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1671  histidine kinase  40.11 
 
 
755 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408129  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2956  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.53 
 
 
752 aa  249  2e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.660632  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6537  histidine kinase  39.84 
 
 
742 aa  249  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3151  histidine kinase  41.93 
 
 
741 aa  247  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.105074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4167  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.87 
 
 
592 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2005  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.53 
 
 
522 aa  246  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3029  histidine kinase  43.09 
 
 
512 aa  245  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3043  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.18 
 
 
738 aa  245  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0109423  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5538  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.38 
 
 
760 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762207 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3135  histidine kinase  43.92 
 
 
512 aa  244  9e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0645839  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.7 
 
 
865 aa  243  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
768 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
768 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 
768 aa  241  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1379  sensory box histidine kinase/response regulator  31.26 
 
 
769 aa  241  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.364148  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2264  sensory box histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 
771 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.87596  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1979  sensory box histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 
771 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3377  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  35.7 
 
 
1242 aa  240  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1000  sensory box histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 
771 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1716  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
628 aa  240  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.805197  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1289  sensory box histidine kinase/response regulator  31.15 
 
 
772 aa  240  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3183  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 
1279 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>