161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2171 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2171  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
540 aa  1127    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.388384  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0941  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.39 
 
 
549 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3935  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.37 
 
 
534 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444109  normal  0.199374 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4967  hypothetical protein  39.47 
 
 
523 aa  363  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1328  hypothetical protein  34.61 
 
 
539 aa  315  1.9999999999999998e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1003  hypothetical protein  36.15 
 
 
554 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06430  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  31.37 
 
 
547 aa  253  6e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0096  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.8 
 
 
559 aa  253  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2331  hypothetical protein  44.21 
 
 
519 aa  250  5e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1075  hypothetical protein  33.95 
 
 
598 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.023264  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0206  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.47 
 
 
625 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.350389 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2095  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.05 
 
 
566 aa  242  1e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.683622 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1417  hypothetical protein  36.45 
 
 
568 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.118077  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2580  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.64 
 
 
629 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.294872 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0141  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.73 
 
 
624 aa  228  2e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.764176 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1895  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.62 
 
 
565 aa  227  4e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0937127  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3815  hypothetical protein  37.69 
 
 
540 aa  226  9e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2894  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.97 
 
 
560 aa  225  2e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0428751  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1218  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.81 
 
 
540 aa  224  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135115  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1790  hypothetical protein  32.56 
 
 
563 aa  223  8e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0148  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.68 
 
 
533 aa  223  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.246711  normal  0.747742 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2069  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  34.43 
 
 
560 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.118953  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2142  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.82 
 
 
563 aa  220  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.79447  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0166  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.41 
 
 
533 aa  219  8.999999999999998e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3586  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.14 
 
 
525 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3942  hypothetical protein  36.67 
 
 
557 aa  217  4e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1418  hypothetical protein  28.37 
 
 
558 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0511098  normal  0.206079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1133  twin-arginine translocation pathway signal  31.98 
 
 
419 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0008  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.21 
 
 
516 aa  213  5.999999999999999e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000297379 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2068  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.26 
 
 
672 aa  213  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.494147  normal  0.689634 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2470  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.98 
 
 
549 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.238543  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0952  cell wall degradation protein  32.49 
 
 
656 aa  211  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2235  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.34 
 
 
637 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.328672 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2015  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  30.48 
 
 
636 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0313  hypothetical protein  34.38 
 
 
546 aa  209  8e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000890514 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1899  hypothetical protein  31.03 
 
 
561 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.131383  hitchhiker  0.000892254 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2592  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.94 
 
 
543 aa  209  1e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000115115  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0962  hypothetical protein  32.26 
 
 
572 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.918601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2320  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.15 
 
 
560 aa  206  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2224  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.1 
 
 
668 aa  206  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1781  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.29 
 
 
500 aa  205  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0274269 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1240  peptidoglycan binding domain-containing protein  35.49 
 
 
535 aa  205  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.770213 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1936  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  32.08 
 
 
599 aa  204  3e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2893  hypothetical protein  32.32 
 
 
563 aa  204  3e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.724025  normal  0.0200907 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1575  hypothetical protein  31.78 
 
 
631 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00305451  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2774  hypothetical protein  29.66 
 
 
546 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.299675  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1416  peptidoglycan binding domain-containing protein  29.66 
 
 
546 aa  203  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.648865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1428  hypothetical protein  33.49 
 
 
718 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2392  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.88 
 
 
560 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.937016 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0815  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.49 
 
 
443 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.418141  normal  0.712241 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2875  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  36.34 
 
 
662 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.929395  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2979  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.57 
 
 
648 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.32051  normal  0.705599 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2078  hypothetical protein  31.19 
 
 
614 aa  199  7.999999999999999e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142171  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1619  hypothetical protein  35.07 
 
 
536 aa  199  9e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.193231 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1407  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.3 
 
 
716 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.281728  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1035  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.65 
 
 
544 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2752  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.81 
 
 
646 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1674  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.42 
 
 
560 aa  198  3e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.68179  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2903  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.07 
 
 
399 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000818135 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3150  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.64 
 
 
654 aa  196  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0340585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0991  hypothetical protein  33.09 
 
 
811 aa  196  9e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.95434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1176  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  32.55 
 
 
433 aa  196  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0293552  normal  0.0832546 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1223  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.41 
 
 
775 aa  196  1e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.213789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1556  hypothetical protein  29.53 
 
 
661 aa  196  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4668  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  33.49 
 
 
724 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.257633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2531  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.78 
 
 
433 aa  194  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1789  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.57 
 
 
571 aa  193  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.385253  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1265  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.67 
 
 
433 aa  193  6e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0469401  normal  0.170975 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1899  hypothetical protein  35.74 
 
 
571 aa  193  7e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0215  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.58 
 
 
670 aa  193  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1767  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.48 
 
 
526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0884  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.5 
 
 
456 aa  190  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.726278  normal  0.163701 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4769  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.25 
 
 
590 aa  190  7e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.974647  normal  0.95224 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3977  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.57 
 
 
730 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.618754 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5311  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  35.62 
 
 
602 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5236  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.25 
 
 
586 aa  189  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0586878 
 
 
-
 
NC_004310  BR0762  peptidoglycan-binding protein, putative  30.73 
 
 
433 aa  187  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3909  peptidoglycan binding domain-containing protein  33.33 
 
 
595 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0227727  normal  0.287079 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5299  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.05 
 
 
426 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6864  hypothetical protein  33.09 
 
 
702 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.337654  normal  0.0440449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0757  putative peptidoglycan-binding protein  30.73 
 
 
446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4673  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.54 
 
 
540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1609  hypothetical protein  30.59 
 
 
410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.831254  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1060  hypothetical protein  34.53 
 
 
616 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.2478  hitchhiker  0.00110354 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2805  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.68 
 
 
674 aa  184  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.75853  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3106  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.45 
 
 
426 aa  184  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319093  normal  0.0282241 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2393  hypothetical protein  34.53 
 
 
615 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.840289  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1931  peptidoglycan binding domain-containing protein  30.56 
 
 
556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2052  hypothetical protein  35.31 
 
 
575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.183791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1086  hypothetical protein  34.53 
 
 
611 aa  184  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0169645  normal  0.732672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00929  predicted carboxypeptidase  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.627631  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2718  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.51298  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1032  hypothetical protein  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1024  hypothetical protein  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600131  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00936  hypothetical protein  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.653767  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2671  hypothetical protein  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.370742  normal  0.102738 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2195  hypothetical protein  34.53 
 
 
615 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.555237  normal  0.324858 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2112  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.04 
 
 
447 aa  183  8.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1828  peptidoglycan binding domain-containing protein  31.27 
 
 
458 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0125895  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5373  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.34 
 
 
432 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.018729  normal  0.0376444 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>