More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2030 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  100 
 
 		 501 aa  1045    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  54.51 
 
 		 490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  52.14 
 
 		 493 aa  538  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  49.48 
 
 		 497 aa  512  1e-144  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  45.1 
 
 		 488 aa  473  1e-132  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  46.52 
 
 		 488 aa  471  1.0000000000000001e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  40.82 
 
 		 498 aa  405  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  40.96 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  39.29 
 
 		 527 aa  395  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  40.59 
 
 		 499 aa  395  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  40.34 
 
 		 490 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  39.58 
 
 		 500 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  37.14 
 
 		 519 aa  370  1e-101  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  36.71 
 
 		 506 aa  351  2e-95  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0318  phytoene desaturase  35.21 
 
 		 526 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.158779  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  33.4 
 
 		 548 aa  291  1e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  33.14 
 
 		 536 aa  283  6.000000000000001e-75  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  32.95 
 
 		 552 aa  283  6.000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  34.17 
 
 		 532 aa  282  8.000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  32.59 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  31.04 
 
 		 542 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  32.02 
 
 		 518 aa  259  1e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  35.01 
 
 		 551 aa  257  4e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  31.3 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  30.85 
 
 		 512 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  31.99 
 
 		 509 aa  252  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  31.05 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1073  phytoene dehydrogenase-related protein  32.01 
 
 		 460 aa  238  1e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2891  phytoene desaturase  33.53 
 
 		 550 aa  239  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.101189 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  29.84 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  29.84 
 
 		 502 aa  236  1.0000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  30.14 
 
 		 492 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  30.66 
 
 		 509 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  31.11 
 
 		 465 aa  231  2e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  29.96 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  26.77 
 
 		 494 aa  223  8e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  28.57 
 
 		 505 aa  222  1.9999999999999999e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  26.79 
 
 		 504 aa  216  7e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  29.67 
 
 		 507 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  27.13 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  28.81 
 
 		 512 aa  209  8e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  28.3 
 
 		 507 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29222  predicted protein  28.63 
 
 		 521 aa  207  3e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.821914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  29.15 
 
 		 504 aa  207  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  27.14 
 
 		 511 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  29.75 
 
 		 491 aa  206  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  25.51 
 
 		 537 aa  204  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  28.03 
 
 		 508 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  29.75 
 
 		 502 aa  203  7e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  27.91 
 
 		 531 aa  203  7e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0703  phytoene desaturase  30.49 
 
 		 453 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.687275  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  26.49 
 
 		 492 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  28.69 
 
 		 504 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.46 
 
 		 508 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  26.12 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  26.78 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  26.99 
 
 		 511 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  27.16 
 
 		 493 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  26.36 
 
 		 511 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  30.12 
 
 		 494 aa  190  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  28.9 
 
 		 508 aa  189  8e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  28 
 
 		 509 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  26.78 
 
 		 508 aa  188  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  28.63 
 
 		 492 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  29.18 
 
 		 519 aa  185  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.77 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  28.03 
 
 		 524 aa  182  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  28.21 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  28.66 
 
 		 492 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  26.24 
 
 		 495 aa  181  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  27.84 
 
 		 492 aa  179  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  29.47 
 
 		 506 aa  179  8e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  29.88 
 
 		 506 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.75 
 
 		 518 aa  177  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  28.03 
 
 		 495 aa  177  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  24.85 
 
 		 511 aa  177  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  27.8 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  26.13 
 
 		 508 aa  177  6e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  26.87 
 
 		 498 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2586  zeta-phytoene desaturase  25 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2640  zeta-phytoene desaturase  25 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  26.04 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  26.94 
 
 		 492 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  25.84 
 
 		 530 aa  173  5e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  25 
 
 		 530 aa  172  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  24.89 
 
 		 529 aa  170  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  27.2 
 
 		 546 aa  168  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  28.95 
 
 		 495 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  27.47 
 
 		 504 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  28.51 
 
 		 503 aa  165  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  26.99 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  26.99 
 
 		 518 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.37 
 
 		 549 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1810  phytoene dehydrogenase family protein  22.83 
 
 		 499 aa  163  6e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.149228  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  28.08 
 
 		 489 aa  161  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0796  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 475 aa  159  7e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  27.69 
 
 		 494 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  27.24 
 
 		 512 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  27.9 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  27.9 
 
 		 512 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>