More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2020 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 		 366 aa  747    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  61.05 
 
 		 375 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4903  secretion protein HlyD family protein  53.52 
 
 		 359 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4261  secretion protein HlyD family protein  49.44 
 
 		 347 aa  308  6.999999999999999e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2691  secretion protein HlyD family protein  44.6 
 
 		 369 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.955062  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5332  secretion protein HlyD family protein  39.61 
 
 		 347 aa  259  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.588118 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1354  secretion protein HlyD family protein  42.27 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0069  secretion protein HlyD family protein  44.48 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0094  secretion protein HlyD family protein  40.33 
 
 		 328 aa  238  1e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4410  secretion protein HlyD family protein  38.42 
 
 		 370 aa  236  3e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1774  secretion protein HlyD family protein  40.35 
 
 		 355 aa  235  7e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0040  multidrug resistance protein A  40.29 
 
 		 342 aa  229  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.984941  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0055  multidrug resistance protein A  38.9 
 
 		 332 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3095  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 410 aa  218  1e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6122  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 		 347 aa  216  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0064  secretion protein HlyD family protein  38.46 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1481  multidrug resistance protein, putative  37.68 
 
 		 372 aa  209  7e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.318452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0156  secretion protein HlyD  36.68 
 
 		 390 aa  207  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2630  secretion protein HlyD family protein  36.64 
 
 		 366 aa  206  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0794256  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1608  secretion protein HlyD family protein  37.58 
 
 		 414 aa  206  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000243495 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6591  secretion protein HlyD family protein  38.79 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.216636 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5998  secretion protein HlyD family protein  38.7 
 
 		 394 aa  203  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4651  HlyD family multidrug resistance protein  35.54 
 
 		 380 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.731563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1605  secretion protein HlyD family protein  34.96 
 
 		 366 aa  202  5e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  36.5 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4682  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.384444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6154  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 470 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.18096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1283  secretion protein HlyD  37.76 
 
 		 475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.277079  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6548  secretion protein HlyD family protein  37.76 
 
 		 475 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2114  multidrug resistance protein A  35.66 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3837  multidrug resistance efflux pump  35.49 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1100  secretion protein HlyD family protein  36.36 
 
 		 443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0175972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2705  secretion protein HlyD family protein  34.7 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0954  secretion protein HlyD family protein  36.49 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.702567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4416  secretion protein HlyD family protein  36.52 
 
 		 366 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.401076  normal  0.621386 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3415  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 406 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.297812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  36.72 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3454  secretion protein HlyD family protein  36.66 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6560  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23530  putative secretion protein  35.24 
 
 		 355 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0127928 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6274  secretion protein HlyD family protein  36.34 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0399198 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1992  putative secretion protein  35.24 
 
 		 344 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0238  secretion protein HlyD  34.54 
 
 		 375 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3793  secretion protein HlyD  36.15 
 
 		 373 aa  194  3e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.167137  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1332  secretion protein HlyD family protein  37.65 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.729441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6488  secretion protein HlyD family protein  37.77 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5419  secretion protein HlyD family protein  35.73 
 
 		 385 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5521  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 468 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0734962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2980  secretion protein HlyD family protein  35.79 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1815  secretion protein HlyD family protein  35.69 
 
 		 390 aa  191  2e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3091  secretion protein HlyD family protein  36.44 
 
 		 334 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0552  secretion protein HlyD  36.23 
 
 		 350 aa  191  2e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3795  secretion protein HlyD family protein  35.05 
 
 		 373 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0499  secretion protein HlyD family protein  33.52 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1632  secretion protein HlyD family protein  34.74 
 
 		 368 aa  189  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.201734  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5589  HlyD family multidrug resistance protein protein  36.47 
 
 		 346 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.346185 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7473  secretion protein HlyD family protein  35.74 
 
 		 390 aa  189  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0736  major facilitator superfamily multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.94 
 
 		 375 aa  189  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2191  HlyD family secretion protein  35.07 
 
 		 373 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3675  secretion protein HlyD family protein  36.61 
 
 		 381 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1008  secretion protein HlyD  33.89 
 
 		 463 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1375  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0634631  hitchhiker  0.000428617 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2634  secretion protein HlyD family protein  33.71 
 
 		 375 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3784  secretion protein HlyD family protein  33.71 
 
 		 387 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.52274  normal  0.687731 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1357  multidrug efflux pump (emrA)  33.89 
 
 		 467 aa  186  5e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0943753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3276  secretion protein HlyD family protein  35.41 
 
 		 372 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.996632 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1976  secretion protein HlyD family protein  33.71 
 
 		 387 aa  185  8e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339437  hitchhiker  0.00926098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5592  HlyD family multidrug resistance protein  36.04 
 
 		 381 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.306614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3509  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 351 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2528  secretion protein HlyD family protein  35.65 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  35.55 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3843  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 352 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0523  secretion protein HlyD family protein  35.21 
 
 		 351 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  35.55 
 
 		 349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2928  HlyD family secretion protein  34.24 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0312  secretion protein HlyD family protein  34.99 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.17056  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0482  secretion protein HlyD family protein  35.24 
 
 		 352 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3713  secretion protein HlyD family protein  33.89 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.598746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3279  secretion protein HlyD  35.67 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.119493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4967  HlyD family secretion protein  33.06 
 
 		 343 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0119064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1507  secretion protein HlyD family protein  33.99 
 
 		 351 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.194742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4226  secretion protein HlyD family protein  33.06 
 
 		 411 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3613  secretion protein HlyD family protein  37.19 
 
 		 422 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.281428  hitchhiker  0.00219458 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1877  secretion protein HlyD  35.82 
 
 		 349 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4521  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 		 351 aa  182  6e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.170966 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2726  multidrug ABC transporter transmembrane protein  37.05 
 
 		 388 aa  182  7e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.874339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0522  secretion protein HlyD family protein  34.38 
 
 		 351 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.889598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3632  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 		 363 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5486  secretion protein HlyD family protein  36.62 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.707329  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2068  multidrug efflux MFS membrane fusion protein, putative  36.01 
 
 		 425 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.851411 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2360  secretion protein HlyD family protein  33.04 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4494  secretion protein HlyD family protein  34.37 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.001486  normal  0.244602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3768  secretion protein HlyD family protein  35.98 
 
 		 364 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.20986 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0108  HlyD family secretion protein  34.01 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.736551  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2344  HlyD family secretion protein  36.28 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3595  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 404 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.766279  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6769  secretion protein HlyD family protein  34.78 
 
 		 393 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.238192  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4608  secretion protein HlyD  35.87 
 
 		 364 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>