More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2007 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  100 
 
 
148 aa  291  1e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  72.11 
 
 
147 aa  223  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2593  50S ribosomal protein L9  56.85 
 
 
147 aa  162  2.0000000000000002e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  54.36 
 
 
149 aa  161  3e-39  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  54.11 
 
 
147 aa  155  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  48.63 
 
 
179 aa  148  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3480  50S ribosomal protein L9  45.52 
 
 
146 aa  127  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.34024  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.06 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1668  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 
175 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.197637  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  43.33 
 
 
151 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.15 
 
 
151 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 
151 aa  114  6e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 
148 aa  113  7.999999999999999e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 
148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 
147 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  37.16 
 
 
148 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.05 
 
 
149 aa  110  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
151 aa  110  6e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 
151 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
151 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
148 aa  107  4.0000000000000004e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6995  ribosomal protein L9  40.14 
 
 
148 aa  107  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.142438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
167 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  38.97 
 
 
147 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
148 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  39.46 
 
 
147 aa  105  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
151 aa  104  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 
167 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
148 aa  104  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9354  50S ribosomal protein L9P  38 
 
 
148 aa  103  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.837132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  35.56 
 
 
147 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  36.91 
 
 
149 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
171 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
149 aa  102  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  37.5 
 
 
147 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  38.64 
 
 
148 aa  101  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  38.93 
 
 
147 aa  101  4e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  34.03 
 
 
153 aa  101  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4841  ribosomal protein L9  35.33 
 
 
148 aa  100  5e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 
146 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  35.37 
 
 
149 aa  100  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  32.88 
 
 
168 aa  100  7e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4519  50S ribosomal protein L9  35.14 
 
 
148 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.986951  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  36.99 
 
 
146 aa  98.6  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 
189 aa  97.8  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  37.41 
 
 
148 aa  97.1  7e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0334  50S ribosomal protein L9  37.42 
 
 
151 aa  96.7  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.801723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 
168 aa  96.7  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3092  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0370883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 
148 aa  96.3  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0881  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00774862  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  35.42 
 
 
189 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  33.1 
 
 
160 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4946  ribosomal protein L9  34.23 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  36.99 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  37.31 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4661  50S ribosomal protein L9P  37.58 
 
 
148 aa  95.1  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  39.73 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.55 
 
 
179 aa  94  6e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
149 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 
149 aa  94  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3303  ribosomal protein L9  38.81 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204917  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7309  50S ribosomal protein L9  33.78 
 
 
148 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.937449  normal  0.0304173 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2306  50S ribosomal protein L9  38.93 
 
 
189 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.891012  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  39.6 
 
 
149 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  37.67 
 
 
189 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18631  50S ribosomal protein L9  40.94 
 
 
151 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.58702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3666  50S ribosomal protein L9  37.82 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.006093  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  35.81 
 
 
148 aa  91.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  34.72 
 
 
189 aa  91.7  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18631  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
151 aa  91.3  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
172 aa  91.3  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  32.89 
 
 
188 aa  91.3  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
149 aa  90.9  6e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
193 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  34 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0130  50S ribosomal protein L9  33.12 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0311991 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0411  50S ribosomal protein L9  37.96 
 
 
195 aa  90.1  8e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.112533  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5065  ribosomal protein L9  32.19 
 
 
151 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.366091  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
209 aa  89.4  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2827  ribosomal protein L9  38.82 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  35.62 
 
 
204 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4117  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
150 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  37.58 
 
 
149 aa  88.6  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2625  ribosomal protein L9  29.93 
 
 
167 aa  89  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.24643  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1765  50S ribosomal protein L9  36.05 
 
 
151 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18821  50S ribosomal protein L9  36.73 
 
 
151 aa  89  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0277205  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1918  50S ribosomal protein L9  35.33 
 
 
196 aa  88.2  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.403674  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0738  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 
191 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823068  normal  0.564603 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3888  50S ribosomal protein L9  35.37 
 
 
150 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00361277 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0112  50S ribosomal protein L9  34.07 
 
 
173 aa  87.8  4e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  33.79 
 
 
170 aa  87.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2510  50S ribosomal protein L9  37.66 
 
 
194 aa  87.4  6e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.531472  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23230  LSU ribosomal protein L9P  35.14 
 
 
153 aa  87.4  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1620  50S ribosomal protein L9  34.93 
 
 
211 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645747  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>