More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1966 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1390  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  42.34 
 
 
854 aa  676  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  44.66 
 
 
869 aa  703  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  100 
 
 
835 aa  1735  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  40.02 
 
 
858 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2917  aminopeptidase N  24.42 
 
 
875 aa  254  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.339647 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3244  aminopeptidase N  26.73 
 
 
887 aa  244  5e-63  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2915  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  26.75 
 
 
878 aa  243  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0708644  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0823  aminopeptidase N  25.79 
 
 
889 aa  241  3e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0653  aminopeptidase N  25.74 
 
 
853 aa  239  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3602  aminopeptidase N  24.25 
 
 
918 aa  237  5e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.104568  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0883  aminopeptidase N  25.19 
 
 
877 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.540659  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3479  aminopeptidase N  25.19 
 
 
877 aa  236  1e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3404  aminopeptidase N  25.32 
 
 
877 aa  236  1e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1059  aminopeptidase N  24.81 
 
 
877 aa  235  2e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0932  aminopeptidase N  24.81 
 
 
877 aa  234  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0957943  normal  0.139954 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3040  aminopeptidase N  24.81 
 
 
877 aa  233  1e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.623964  normal  0.59258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3016  aminopeptidase N  25.09 
 
 
877 aa  232  2e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0897  aminopeptidase N  24.43 
 
 
877 aa  229  1e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.77386  normal  0.216424 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0913  aminopeptidase N  26.28 
 
 
879 aa  224  4e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120566 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0760  aminopeptidase N  26.39 
 
 
906 aa  223  1e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.393425 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1408  aminopeptidase N  24.13 
 
 
848 aa  221  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00342541 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1330  aminopeptidase N  25.3 
 
 
853 aa  220  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.86376  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7988  aminopeptidase N  25.58 
 
 
858 aa  216  2e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5040  aminopeptidase N  25.49 
 
 
860 aa  210  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7336  aminopeptidase N  25.97 
 
 
858 aa  207  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113676  hitchhiker  1.85174e-05 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2630  aminopeptidase N  25.42 
 
 
865 aa  206  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.749966  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11560  aminopeptidase N  25.1 
 
 
849 aa  205  2e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2577  aminopeptidase N  30.65 
 
 
889 aa  203  9e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.99467 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2410  aminopeptidase N  25.2 
 
 
853 aa  201  5e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.621955  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3525  aminopeptidase N  26.8 
 
 
853 aa  199  2e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0714128  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2164  aminopeptidase N  26.81 
 
 
853 aa  198  3e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00664e-06 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4965  aminopeptidase N  29.51 
 
 
857 aa  197  9e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.861412  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21360  aminopeptidase N  28.6 
 
 
842 aa  195  3e-48  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  4.02596e-05 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5445  aminopeptidase N  24.96 
 
 
848 aa  195  4e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09800  Membrane alanyl aminopeptidase  26.99 
 
 
868 aa  194  5e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100237  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2534  aminopeptidase N  25.17 
 
 
855 aa  194  5e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.652237  normal  0.722591 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1102  aminopeptidase N  26.53 
 
 
862 aa  194  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11521  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1880  aminopeptidase N  27.59 
 
 
874 aa  194  6e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0164178 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0957  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  34.83 
 
 
830 aa  194  8e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00150459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1546  aminopeptidase N  26.41 
 
 
861 aa  194  8e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.966303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3678  aminopeptidase N  30.67 
 
 
867 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.701702  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3605  aminopeptidase N  30.67 
 
 
867 aa  193  9e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0943  aminopeptidase N  26.07 
 
 
849 aa  193  1e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  32.13 
 
 
853 aa  192  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12492  aminopeptidase N pepN (lysyl aminopeptidase)  30.34 
 
 
861 aa  192  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.414324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11670  aminopeptidase G  31.03 
 
 
882 aa  192  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.756822  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24580  aminopeptidase N  25.36 
 
 
850 aa  192  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.571572 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3610  aminopeptidase N  30.44 
 
 
867 aa  191  4e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.913388 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4057  aminopeptidase N  29.19 
 
 
869 aa  191  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.5742  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2381  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  33.88 
 
 
859 aa  191  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.42945  normal  0.881926 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1349  aminopeptidase N  25.07 
 
 
850 aa  190  8e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000264041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5306  aminopeptidase N  30.81 
 
 
851 aa  189  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.550867  normal  0.196392 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5477  aminopeptidase N  32.94 
 
 
838 aa  189  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.908342  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1142  aminopeptidase N  26.8 
 
 
852 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1050  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.41 
 
 
877 aa  187  9e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0939422  normal  0.722063 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1149  membrane alanyl aminopeptidase  25.3 
 
 
871 aa  187  9e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3475  aminopeptidase N  31.75 
 
 
837 aa  186  2e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.60984  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2881  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.87 
 
 
785 aa  186  2e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1381  aminopeptidase N  24.93 
 
 
863 aa  185  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1912  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  29.38 
 
 
863 aa  185  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.97634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1160  aminopeptidase N  30.81 
 
 
862 aa  185  4e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.640463  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3413  aminopeptidase N  24.97 
 
 
848 aa  184  5e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.639209  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09020  aminopeptidase N  27.63 
 
 
887 aa  183  1e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.259746  normal  0.0340911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1398  aminopeptidase N  29.28 
 
 
856 aa  182  3e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.397429  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0949  aminopeptidase N  25.25 
 
 
869 aa  181  4e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0910  aminopeptidase N  28.45 
 
 
807 aa  181  7e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24070  aminopeptidase N  27.65 
 
 
892 aa  180  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2038  aminopeptidase N  30.79 
 
 
862 aa  180  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1627  aminopeptidase N  30.42 
 
 
882 aa  179  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.169502  normal  0.072151 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0493  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  29.89 
 
 
852 aa  179  2e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2441  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.98 
 
 
859 aa  178  5e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.312278  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1371  aminopeptidase N  24.92 
 
 
868 aa  178  5e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.875513  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2129  aminopeptidase G  27.31 
 
 
876 aa  177  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7325  membrane alanyl aminopeptidase  29.46 
 
 
855 aa  177  1e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2528  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.61 
 
 
857 aa  175  4e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00982821  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0341  lysyl aminopeptidase  29.19 
 
 
846 aa  174  7e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1419  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  31.98 
 
 
859 aa  174  7e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1012  lysyl-aminopeptidase, aminopeptidase N  29.81 
 
 
846 aa  173  1e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04282  aminopeptidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G04330)  30.26 
 
 
881 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1058  lysyl aminopeptidase  31.97 
 
 
844 aa  171  6e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2204  aminopeptidase N  26.96 
 
 
846 aa  171  6e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0003  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  31.67 
 
 
886 aa  170  1e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.350265  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2138  aminopeptidase N  25.81 
 
 
834 aa  169  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11870  Membrane alanyl aminopeptidase  29.7 
 
 
854 aa  169  3e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.504469 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2417  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  32.34 
 
 
853 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.900684 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3517  aminopeptidase N  28.77 
 
 
851 aa  166  1e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3892  aminopeptidase N  29.41 
 
 
848 aa  166  2e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0986  aminopeptidase N  32.06 
 
 
849 aa  166  2e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.977905  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0575  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  30 
 
 
778 aa  164  8e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.509843  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0715  aminopeptidase N  29.63 
 
 
844 aa  162  2e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.063007  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0968  aminopeptidase N  27.8 
 
 
878 aa  162  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0504  lysyl aminopeptidase  31.69 
 
 
844 aa  161  4e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.777579  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01920  aminopeptidase N  30.06 
 
 
905 aa  160  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.384896  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0490  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.79 
 
 
784 aa  159  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.559596  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02632  aminopeptidase N  32.08 
 
 
890 aa  154  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3098  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.05 
 
 
933 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.020169  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_29758  predicted protein  28.61 
 
 
895 aa  152  3e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1156  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase-like protein  28.5 
 
 
875 aa  152  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.165699  normal  0.0390371 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2697  aminopeptidase N  26.04 
 
 
823 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.699352  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3293  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.06 
 
 
932 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00996699  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>