More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1929 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  100 
 
 		 137 aa  287  3e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  72.99 
 
 		 139 aa  224  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  70.8 
 
 		 138 aa  224  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  60.58 
 
 		 141 aa  187  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  58.39 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  59.12 
 
 		 137 aa  183  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  54.14 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  52.99 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  50.74 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  51.85 
 
 		 143 aa  147  6e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  50.75 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  49.62 
 
 		 132 aa  143  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  50.79 
 
 		 138 aa  141  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 		 144 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 144 aa  140  9e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  50.4 
 
 		 143 aa  139  9.999999999999999e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  48.48 
 
 		 140 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.41 
 
 		 152 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  50.38 
 
 		 150 aa  138  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  51.91 
 
 		 143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  50.38 
 
 		 144 aa  136  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.96 
 
 		 143 aa  136  8.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.38 
 
 		 139 aa  135  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  50 
 
 		 139 aa  135  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  52.03 
 
 		 139 aa  134  5e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  49.61 
 
 		 138 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1780  protein tyrosine phosphatase  46.21 
 
 		 154 aa  131  3e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0180876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 		 145 aa  130  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0842  protein tyrosine phosphatase  45.67 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.790254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  45.11 
 
 		 147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0521  protein tyrosine phosphatase  47.58 
 
 		 140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  43.61 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  47.73 
 
 		 134 aa  128  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1112  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.72 
 
 		 153 aa  127  7.000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.988044  normal  0.524433 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2431  arsenate reductase  47.33 
 
 		 131 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  49.58 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  45.31 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  49.6 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  46.43 
 
 		 141 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  46.67 
 
 		 138 aa  122  2e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  43.18 
 
 		 150 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.09 
 
 		 137 aa  122  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0209  arsenate reductase  45.52 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  44.96 
 
 		 145 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0826  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  44.85 
 
 		 154 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  45.32 
 
 		 142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  44.29 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  45.45 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3671  protein tyrosine phosphatase  47.15 
 
 		 144 aa  117  7e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.724528  normal  0.246211 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 		 142 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1874  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.04 
 
 		 144 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  45.86 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  45.59 
 
 		 157 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2953  arsenate reductase  41.6 
 
 		 140 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2348  protein tyrosine phosphatase  41.79 
 
 		 142 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  39.55 
 
 		 154 aa  111  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2919  arsenate reductase  43.08 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000358516  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.31 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  41.46 
 
 		 254 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0250  protein tyrosine phosphatase  46.15 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.371079  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2898  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.871154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3201  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  44.36 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3207  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.468162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2963  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  107  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.341383  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2971  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000815636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3196  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  106  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9959  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2768  protein tyrosine phosphatase  44.2 
 
 		 153 aa  106  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0158  arsenate reductase  43.08 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 255 aa  106  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0304  arsenate reductase  43.08 
 
 		 134 aa  106  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3221  arsenate reductase  43.08 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2062  arsenate reductase  43.85 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1604  arsenate reductase  42.86 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.121072  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0314  arsenate reductase  44.93 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  41.27 
 
 		 254 aa  103  8e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1022  tyrosine phosphatase  43.65 
 
 		 299 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  38.17 
 
 		 143 aa  100  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1084  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  42.86 
 
 		 299 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.592993  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0756  protein tyrosine phosphatase  40.58 
 
 		 153 aa  100  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.686448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  40.8 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2602  arsenate reductase  35.33 
 
 		 188 aa  99.4  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000913813  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 258 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0062  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 		 145 aa  98.2  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2548  protein tyrosine phosphatase  42.03 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.413885  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  37.23 
 
 		 151 aa  97.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3821  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2336  protein tyrosine phosphatase  35.43 
 
 		 138 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0739912 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3358  ArsR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 275 aa  97.4  6e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.426914  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1443  protein tyrosine phosphatase  40.74 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.907401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  43.81 
 
 		 258 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 257 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  43.28 
 
 		 165 aa  95.1  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.85 
 
 		 165 aa  94.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.23 
 
 		 167 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.117198 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  38.69 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 287 aa  94.7  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2835  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.09 
 
 		 287 aa  94.7  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3826  protein tyrosine phosphatase  39.23 
 
 		 167 aa  94.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.248837 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1128  putative arsenate reductase (arsenical PUMP modifier) protein  39.23 
 
 		 164 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.976104 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>