157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1906 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  100 
 
 		 647 aa  1328    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  39.53 
 
 		 634 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  42.05 
 
 		 1575 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  32.31 
 
 		 558 aa  282  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  39.86 
 
 		 933 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  43.91 
 
 		 857 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  43.13 
 
 		 500 aa  234  4.0000000000000004e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  42.22 
 
 		 395 aa  228  3e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  47.67 
 
 		 497 aa  226  1e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  43.75 
 
 		 741 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  45.75 
 
 		 486 aa  224  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  42.48 
 
 		 331 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  41.35 
 
 		 862 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  48.02 
 
 		 300 aa  206  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  43.03 
 
 		 862 aa  205  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  43.95 
 
 		 399 aa  205  2e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  48.94 
 
 		 323 aa  204  3e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  32.6 
 
 		 2670 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  39.68 
 
 		 789 aa  196  8.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  43.9 
 
 		 309 aa  195  2e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  35.14 
 
 		 898 aa  193  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  37.17 
 
 		 2415 aa  191  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  37.39 
 
 		 1038 aa  191  4e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  42.31 
 
 		 3060 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  37.45 
 
 		 377 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  40 
 
 		 427 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  33.24 
 
 		 467 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  38.86 
 
 		 800 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  39.22 
 
 		 452 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  35.21 
 
 		 907 aa  171  4e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  39 
 
 		 774 aa  169  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  43.75 
 
 		 609 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  41.85 
 
 		 253 aa  167  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  35.38 
 
 		 934 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  36.89 
 
 		 451 aa  160  7e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  34.84 
 
 		 450 aa  158  4e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  43.24 
 
 		 347 aa  157  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  45.2 
 
 		 1214 aa  152  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  40.35 
 
 		 279 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6114  hypothetical protein  36.42 
 
 		 367 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  37.75 
 
 		 762 aa  148  3e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  50.33 
 
 		 173 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6600  hypothetical protein  38.12 
 
 		 398 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  43.26 
 
 		 250 aa  144  5e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  44 
 
 		 754 aa  143  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  43.02 
 
 		 251 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  34.18 
 
 		 521 aa  139  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  48.51 
 
 		 226 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  39.25 
 
 		 982 aa  135  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  38.69 
 
 		 399 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  39.78 
 
 		 254 aa  134  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  43.3 
 
 		 250 aa  132  3e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  44.79 
 
 		 272 aa  130  6e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  43.35 
 
 		 275 aa  127  8.000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  28.69 
 
 		 1227 aa  124  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  47.01 
 
 		 226 aa  122  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  39.38 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  46.4 
 
 		 509 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  35.58 
 
 		 200 aa  112  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  26.15 
 
 		 405 aa  110  6e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  41.5 
 
 		 180 aa  109  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  36.61 
 
 		 321 aa  105  3e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  34.34 
 
 		 366 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.67 
 
 		 1015 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  47.62 
 
 		 228 aa  100  6e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  45.71 
 
 		 913 aa  100  8e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  45.45 
 
 		 560 aa  97.8  6e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08600  surface protein 26-residue repeat-containing protein  26.4 
 
 		 414 aa  95.1  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.14343  hitchhiker  0.0000116306 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  54.67 
 
 		 95 aa  93.2  1e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  31.96 
 
 		 688 aa  93.6  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  42.75 
 
 		 288 aa  91.7  4e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  34.84 
 
 		 658 aa  90.5  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  33.73 
 
 		 571 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  28.99 
 
 		 204 aa  88.2  4e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0305  hypothetical protein  36.96 
 
 		 496 aa  87.4  7e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  42.86 
 
 		 166 aa  87  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  29.2 
 
 		 809 aa  86.3  0.000000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05064  hypothetical protein  50.62 
 
 		 158 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0737  hypothetical protein  40.37 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.442798  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  43.56 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0444  hypothetical protein  42.86 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.640177  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  40.2 
 
 		 190 aa  83.6  0.00000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  43.27 
 
 		 236 aa  83.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  30.34 
 
 		 477 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  34.32 
 
 		 1437 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4214  hypothetical protein  28.11 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.208947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0738  hypothetical protein  38.46 
 
 		 446 aa  82.4  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  35.52 
 
 		 803 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  28.9 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  29.41 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0226  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  38.83 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.713864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  33.7 
 
 		 543 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0177  hypothetical protein  44.44 
 
 		 129 aa  79.7  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  42.57 
 
 		 182 aa  78.6  0.0000000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  32.97 
 
 		 996 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  34.64 
 
 		 336 aa  77.8  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.67 
 
 		 1147 aa  77.4  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.5 
 
 		 846 aa  77  0.0000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  32.16 
 
 		 541 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  32.34 
 
 		 501 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>