More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1901 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1901  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 405 aa  819    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.209847  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3566  major facilitator superfamily MFS_1  61.58 
 
 		 422 aa  539  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.457003  normal  0.431414 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2211  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 413 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.895405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  38.65 
 
 		 420 aa  256  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2623  major facilitator superfamily MFS_1  36.36 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.100079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3254  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 416 aa  249  6e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254674  normal  0.0467898 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2064  major facilitator superfamily MFS_1  36.59 
 
 		 410 aa  241  1e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000913971  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1424  major facilitator superfamily MFS_1  34.63 
 
 		 850 aa  237  3e-61  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.314854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2598  major facilitator superfamily MFS_1  31.15 
 
 		 420 aa  167  4e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.200679 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3438  major facilitator transporter  28.42 
 
 		 506 aa  121  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.356572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0508  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0836573  normal  0.693468 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  26.86 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3034  major facilitator transporter  30.1 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.201695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4127  major facilitator superfamily MFS_1  26.2 
 
 		 432 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4716  major facilitator transporter  33.71 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3856  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4299  major facilitator transporter  25.66 
 
 		 413 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.881294  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3843  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0045  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0327786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3956  major facilitator superfamily MFS_1  32.67 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291271  normal  0.0908797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3398  major facilitator superfamily MFS_1  23.89 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2215  major facilitator superfamily MFS_1  25.4 
 
 		 413 aa  106  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0909109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  26.1 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  27.46 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2012  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 413 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000197881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  28.75 
 
 		 420 aa  103  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1905  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 426 aa  103  5e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3888  major facilitator superfamily transporter  27.02 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3250  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.613026 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3221  major facilitator transporter  25.22 
 
 		 416 aa  103  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00772282 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 426 aa  103  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  27.22 
 
 		 438 aa  103  8e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.21 
 
 		 433 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  25.42 
 
 		 426 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  23.95 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3525  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.653507  normal  0.582224 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0578  major facilitator superfamily MFS_1  26.91 
 
 		 407 aa  100  4e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  22.56 
 
 		 439 aa  100  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5358  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 465 aa  99.8  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12885  normal  0.601812 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.42 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2122  major facilitator transporter  26 
 
 		 461 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1834  major facilitator transporter  26.07 
 
 		 418 aa  99  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.711974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3455  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 430 aa  99  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0048  major facilitator transporter  25.78 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7350  major facilitator transporter  25.33 
 
 		 464 aa  98.2  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25449  normal  0.921964 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 429 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4600  major facilitator transporter  25.88 
 
 		 442 aa  98.2  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.578788  normal  0.252114 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  24.93 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3528  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 468 aa  97.8  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.168718 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2493  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 465 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3898  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 467 aa  97.1  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.547341  normal  0.242029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0903  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 440 aa  97.1  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0333563  normal  0.084831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2862  major facilitator transporter  26.49 
 
 		 448 aa  96.7  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.0171068 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 430 aa  96.7  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2817  major facilitator transporter  26.41 
 
 		 426 aa  96.3  9e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.850013  normal  0.439964 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1710  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  28.82 
 
 		 446 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0437115 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 451 aa  96.3  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2236  general substrate transporter  27.78 
 
 		 449 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  26.17 
 
 		 427 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4054  major facilitator transporter  24.16 
 
 		 437 aa  95.9  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0519542 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4014  major facilitator transporter  26.51 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.242843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2674  major facilitator transporter  25.91 
 
 		 426 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3622  major facilitator transporter  24.32 
 
 		 467 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.416218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1407  major facilitator transporter  24.59 
 
 		 452 aa  95.9  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0585  major facilitator transporter  35.2 
 
 		 542 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.895306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0332  major facilitator superfamily transporter phthalate permease  24.84 
 
 		 475 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.444017  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0360  major facilitator transporter  29.7 
 
 		 578 aa  95.5  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.826159 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4010  major facilitator transporter  28.82 
 
 		 446 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.835742  normal  0.379616 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5194  Permeases of the major facilitator superfamily  25.07 
 
 		 436 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2463  multidrug resistance protein, putative  27.73 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.190584  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5071  major facilitator transporter  23.42 
 
 		 470 aa  94.4  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.844572  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2069  major facilitator superfamily protein  25.47 
 
 		 424 aa  94  4e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118592  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5295  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 428 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  27.02 
 
 		 441 aa  93.6  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0887  major facilitator transporter  25.84 
 
 		 416 aa  93.2  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 437 aa  92.8  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1874  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 435 aa  92.8  9e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.20349 
 
 
-
 
NC_003296  RS02171  transport transmembrane protein  27.55 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115532  normal  0.0335477 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2392  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 416 aa  92.8  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3077  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 441 aa  91.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.163799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2811  major facilitator superfamily MFS_1  23.78 
 
 		 419 aa  92  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.501035  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  21.29 
 
 		 428 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2392  major facilitator transporter  26.92 
 
 		 450 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5472  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 437 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4105  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  21.83 
 
 		 437 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2242  major facilitator transporter  24.76 
 
 		 432 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0299  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 431 aa  90.9  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.504157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  26.74 
 
 		 449 aa  90.5  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2587  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  25.81 
 
 		 428 aa  90.9  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2535  major facilitator transporter  26.22 
 
 		 425 aa  90.5  4e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3962  major facilitator transporter  24.31 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1145  major facilitator transporter  23.57 
 
 		 436 aa  90.1  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.667647  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  28.86 
 
 		 415 aa  89.7  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 449 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  25.25 
 
 		 449 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2612  major facilitator transporter  28.93 
 
 		 433 aa  89.7  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.209857  normal  0.81136 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  26.67 
 
 		 439 aa  89.4  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0137  major facilitator transporter  23.62 
 
 		 427 aa  89.4  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0711872  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>