160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1867 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  100 
 
 		 634 aa  1303    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  42.35 
 
 		 933 aa  502  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  39.53 
 
 		 647 aa  414  1e-114  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  37.35 
 
 		 1575 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  38.74 
 
 		 558 aa  271  4e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  44.52 
 
 		 857 aa  239  1e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  37.84 
 
 		 486 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  52.59 
 
 		 497 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  46.34 
 
 		 331 aa  220  6e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  49 
 
 		 500 aa  220  7e-56  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  44.16 
 
 		 741 aa  218  4e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  42.86 
 
 		 862 aa  216  9.999999999999999e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  48.29 
 
 		 789 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  44.02 
 
 		 395 aa  214  3.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  38.62 
 
 		 862 aa  209  2e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  40.26 
 
 		 399 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  44.66 
 
 		 1038 aa  193  8e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  50 
 
 		 300 aa  192  1e-47  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  39.86 
 
 		 323 aa  188  2e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  40.23 
 
 		 2415 aa  187  5e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  41.32 
 
 		 377 aa  187  7e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  42.86 
 
 		 427 aa  187  7e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  32.17 
 
 		 2670 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  39.74 
 
 		 3060 aa  183  9.000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  44.78 
 
 		 253 aa  179  1e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  44.64 
 
 		 309 aa  179  2e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  46.9 
 
 		 609 aa  178  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  36.6 
 
 		 898 aa  177  4e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  42.67 
 
 		 800 aa  176  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  43.4 
 
 		 934 aa  176  1.9999999999999998e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  47.13 
 
 		 754 aa  172  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  36.45 
 
 		 467 aa  171  3e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  41.04 
 
 		 279 aa  171  3e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  39.13 
 
 		 907 aa  171  5e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  32.06 
 
 		 452 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  34.47 
 
 		 451 aa  165  3e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  37.71 
 
 		 521 aa  165  3e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  44 
 
 		 774 aa  164  5.0000000000000005e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 450 aa  163  1e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  47.4 
 
 		 1214 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  44.65 
 
 		 982 aa  158  3e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  41.03 
 
 		 250 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  43.75 
 
 		 762 aa  157  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  39.32 
 
 		 251 aa  143  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  43.62 
 
 		 226 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  39.81 
 
 		 414 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  45.51 
 
 		 173 aa  142  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  42.14 
 
 		 399 aa  140  7e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  46.06 
 
 		 250 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.03 
 
 		 1227 aa  134  3.9999999999999996e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  47.77 
 
 		 226 aa  134  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  47.62 
 
 		 272 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  36.41 
 
 		 405 aa  114  6e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  39.39 
 
 		 321 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  34.38 
 
 		 1437 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  48.62 
 
 		 509 aa  110  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  37.04 
 
 		 275 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  43.05 
 
 		 180 aa  108  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.3 
 
 		 1015 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  33.14 
 
 		 700 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  35.54 
 
 		 204 aa  103  1e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  37.35 
 
 		 543 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  31.61 
 
 		 324 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  34.19 
 
 		 200 aa  102  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  36.67 
 
 		 658 aa  101  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1170  hypothetical protein  31.56 
 
 		 809 aa  98.2  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  31.82 
 
 		 665 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29265  predicted protein  48.94 
 
 		 236 aa  96.3  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  34.55 
 
 		 1433 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  37.19 
 
 		 333 aa  96.3  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  30.65 
 
 		 996 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  35.19 
 
 		 501 aa  95.1  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  56.04 
 
 		 166 aa  94.4  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  32.93 
 
 		 571 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  34.57 
 
 		 755 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  53.57 
 
 		 913 aa  92  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  32.92 
 
 		 336 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  31.74 
 
 		 757 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  31.07 
 
 		 1174 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  40.91 
 
 		 560 aa  90.5  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0763  hypothetical protein  48.31 
 
 		 228 aa  89.7  1e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.216607  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  29.89 
 
 		 341 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6006  hypothetical protein  30.94 
 
 		 366 aa  87.8  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  32 
 
 		 1055 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1147 aa  87  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  35.63 
 
 		 347 aa  86.7  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  30.3 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  36.05 
 
 		 686 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  30.49 
 
 		 1668 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  33.54 
 
 		 394 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  28.93 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  33.73 
 
 		 803 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  43.97 
 
 		 371 aa  84.7  0.000000000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  28.9 
 
 		 1296 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  33.13 
 
 		 1029 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  28.9 
 
 		 408 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0291  hypothetical protein  45.65 
 
 		 182 aa  82.4  0.00000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1298  putative lipoprotein  44.76 
 
 		 288 aa  82  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  28.14 
 
 		 1003 aa  80.9  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0736  hypothetical protein  42.11 
 
 		 423 aa  80.1  0.0000000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>